Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09988
• Subject: XM_011516067.2
• Aligned Length: 1275
• Identities: 1251
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGTTCCCACCAGCCAGGGGGAAGGAGCTGCTCTCGTTTGAGGATGTGGCGATGTACTTCACCAGAGAGGAGTG  74
                                 |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------ATGGAGCTGCTCTCGTTTGAGGATGTGGCGATGTACTTCACCAGAGAGGAGTG  53

Query   75  GGGCCACCTCAACTGGGGTCAGAAGGACCTCTACCGAGATGTGATGTTGGAGAACTACAGGAACATGGTCTTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   54  GGGCCACCTCAACTGGGGTCAGAAGGACCTCTACCGAGATGTGATGTTGGAGAACTACAGGAACATGGTCTTGC  127

Query  149  TGGGATTTCAGTTTCCCAAACCTGAGATGATCTGTCAGCTGGAGAACTGGGACGAGCAGTGGATCCTGGATCTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  128  TGGGATTTCAGTTTCCCAAACCTGAGATGATCTGTCAGCTGGAGAACTGGGACGAGCAGTGGATCCTGGATCTA  201

Query  223  CCGAGAGCTGGGAATAGGAAGGCTTCCGGTAGTGCTTGCCCAGGTTCTGAAGCCAGACACAAGATGAAAAAGCT  296
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  202  CCGAGAACTGGGAATAGGAAGGCTTCCGGTAGTGCTTGCCCAGGTTCTGAAGCCAGACACAAGATGAAAAAGCT  275

Query  297  AACTCCAAAACAGAAATTTTCTGAAGATTTAGAGTCATATAAGATATCAGTGGTAATGCAGGAATCAGCTGAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  276  AACTCCAAAACAGAAATTTTCTGAAGATTTAGAGTCATATAAGATATCAGTGGTAATGCAGGAATCAGCTGAGA  349

Query  371  AACTTTCAGAAAAGTTACATAAGTGTAAAGAATTTGTGGACAGTTGCAGGCTTACTTTCCCTACTAGTGGTGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  350  AACTTTCAGAAAAGTTACATAAGTGTAAAGAATTTGTGGACAGTTGCAGGCTTACTTTCCCTACTAGTGGTGAT  423

Query  445  GAATACAGCAGGGGCTTCCTTCAAAACCTTAACCTTATTCAAGATCAGAATGCGCAAACAAGGTGGAAGCAGGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  424  GAATACAGCAGGGGCTTCCTTCAAAACCTTAACCTTATTCAAGATCAGAATGCGCAAACAAGGTGGAAGCAGGG  497

Query  519  CAGATATGATGAGGATGGCAAACCCTTCAATCAAAGATCTTTGCTTTTGGGGCATGAGCGAATTCTCACAAGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  CAGATATGATGAGGATGGCAAACCCTTCAATCAAAGATCTTTGCTTTTGGGGCATGAGCGAATTCTCACAAGAG  571

Query  593  CAAAGTCTTATGAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTCATTAGGCGTAAGGCATGGTTTGATCAACATCAAAGAATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  572  CAAAGTCTTATGAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTCATTAGGCGTAAGGCATGGTTTGATCAACATCAAAGAATT  645

Query  667  CACTTTTTAGAGAATCCTTTTGAGTGTAAGGTCTGTGGGCAAGCCTTCAGACAGCGGTCAGCTCTTACGGTCCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  646  CACTTTTTAGAGAATCCTTTTGAGTGTAAGGTCTGTGGGCAAGCCTTCAGACAGCGGTCAGCTCTTACGGTCCA  719

Query  741  TAAACAGTGTCACCTGCAAAACAAGCCATACAGATGTCATGACTGTGGAAAGTGTTTTCGGCAGCTCGCGTATA  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  720  TAAACAGTGTCACCTGCAAAACAAGCCATACAGATGTCATGACTGTGGAAAGTGTTTTCGGCAGCTCGCGTATC  793

Query  815  TTGTTGAACATAAGAGGATTCACACCAAAGAAAAACCTTATAAATGTAGCAAATGTGAAAAAACGTTTAGTCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  TTGTTGAACATAAGAGGATTCACACCAAAGAAAAACCTTATAAATGTAGCAAATGTGAAAAAACGTTTAGTCAG  867

Query  889  AATTCAACCCTTATTCGACATCAGGTGATCCATAGTGGAGAAAAACGCCATAAATGCCTTGAGTGTGGAAAAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  868  AATTCAACCCTTATTCGACATCAGGTGATCCATAGTGGAGAAAAACGCCATAAATGCCTTGAGTGTGGAAAAGC  941

Query  963  CTTTGGCCGGCATTCAACCCTTCTATGTCATCAACAGATTCACAGTAAACCGAACACCCATAAATGCAGTGAAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  CTTTGGCCGGCATTCAACCCTTCTATGTCATCAACAGATTCACAGTAAACCGAACACCCATAAATGCAGTGAAT  1015

Query 1037  GTGGACAGTCCTTTGGTAGGAATGTGGATCTCATTCAGCATCAAAGAATCCATACAAAGGAGGAATTCTTTCAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016  GTGGACAGTCCTTTGGTAGGAATGTGGATCTCATTCAGCATCAAAGAATCCATACAAAGGAGGAATTCTTTCAA  1089

Query 1111  TGTGGAGAATGTGGGAAAACGTTTAGTTTTAAGAGGAATCTTTTTCGACATCAGGTCATTCACACTGGAAGCCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090  TGTGGAGAATGTGGGAAAACGTTTAGTTTTAAGAGGAATCTTTTTCGACATCAGGTCATTCACACTGGAAGCCA  1163

Query 1185  ACCCTACCAATGTGTCATATGTGGAAAATCTTTCAAGTGGCACACAAGCTTTATTAAGCACCAGGGCACTCACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164  ACCCTACCAATGTGTCATATGTGGAAAATCTTTCAAGTGGCACACAAGCTTTATTAAGCACCAGGGCACTCACA  1237

Query 1259  AAGGACAGATATCCACA  1275
            |||||||||||||||||
Sbjct 1238  AAGGACAGATATCCACA  1254