Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10006
• Subject: NM_001301427.1
• Aligned Length: 1140
• Identities: 989
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ATGACGGGGAAAGCAGGGGAAGCGCTGAGCAAGCCCAAATCCGAGACAGTGGCCAAGAGTACCTCGGGGGGCGC  74
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACGGGGAAAGCGGGGGAAGCGCTGAGCAAGCCCAAATCCGAGACAGTGGCCAAGAGTACCTCGGGGGGCGC  74

Query   75  CCCGGCCAGGTGCACTGGGTTCGGCATCCAGGAGATCCTGGGCTTGAACAAGGAGCCCCCGAGCTCCCACCCGC  148
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  CCCGGCCAGGTGCACAGGGTTCGGCATCCAGGAGATCCTAGGCTTGAACAAGGAGCCTCCCAGCTCCCACCCGC  148

Query  149  GGGCAGCGCTCGACGGCCTGGCCCCCGGGCACTTGCTGGCGGCGCGCTCAGTGCTCAGCCCCGCGGGGGTGGGC  222
            ||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||
Sbjct  149  GGGCTGCCCTCGACGGCCTGGCCCCTGGGCATTTGTTAGCTGCGCGCTCCGTTCTCAGCCCGGCAGGAGTGGGC  222

Query  223  GGCATGGGGCTTCTGGGGCCCGGGGGGCTCCCTGGCTTCTACACGCAGCCCACCTTCCTGGAAGTGCTGTCCGA  296
            .||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCATGGGGCTGCTGGGGCCCGGGGGACTTCCCGGCTTCTACACACAGCCCACCTTCTTGGAAGTGCTGTCCGA  296

Query  297  CCCGCAGAGCGTCCACTTGCAGCCATTGGGCAGAGCATCGGGGCCGCTGGACACCAGCCAGACGGCCAGCTCGG  370
            .||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  TCCGCAGAGCGTCCACTTGCAGCCACTAGGCAGAGCGTCGGGGCCGCTGGACACCAGCCAGACGGCCAGCTCCG  370

Query  371  ATTCTGAAGATGTTTCCTCCAGCGATCGAAAAATGTCCAAATCTGCTTTAAACCAGACCAAGAAACGGAAGAAG  444
            ||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  371  ATTCCGAAGATGTTTCCTCCAGTGACCGAAAAATGTCCAAATCGGCTTTAAACCAGACCAAGAAGCGTAAGAAG  444

Query  445  CGGCGACACAGGACAATCTTTACCTCTTACCAGCTAGAGGAGCTGGAGAAGGCATTCAACGAAGCCCACTACCC  518
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  CGGCGACACAGGACAATCTTTACTTCCTACCAGCTAGAGGAGCTGGAGAAAGCATTCAATGAAGCCCACTACCC  518

Query  519  AGACGTCTATGCCCGGGAGATGCTGGCCATGAAAACGGAGCTGCCGGAAGACAGGATACAGGTCTGGTTCCAGA  592
            |||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  519  AGATGTCTACGCCCGGGAGATGCTGGCCATGAAAACGGAGCTCCCAGAAGACAGGATACAGGTGTGGTTCCAGA  592

Query  593  ACCGTCGAGCCAAGTGGAGGAAGCGGGAGAAGTGCTGGGGCCGGAGCAGTGTCATGGCGGAGTATGGGCTCTAC  666
            ||||..|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct  593  ACCGCAGAGCCAAGTGGAGGAAGAGGGAGAAGTGCTGGGGCCGGAGCAGCGTCATGGCTGAGTATGGTCTCTAT  666

Query  667  GGGGCCATGGTGCGGCACTCCATCCCCCTGCCCGAGTCCATCCTCAAGTCAGCCAAGGATGGCATCATGGACTC  740
            ||.|||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  667  GGAGCCATGGTGAGGCACTCGATCCCCCTGCCAGAGTCTATCCTCAAGTCTGCCAAGGATGGCATAATGGATTC  740

Query  741  CTGTGCCCCGTGGCTACTG-------------------------------------------------------  759
            |||||||||.|||||||||                                                       
Sbjct  741  CTGTGCCCCATGGCTACTGGTTCAAGATGGCTTTCCCAGGCGCTTTTCTAAACCCGAATACCAACAATTCTTTT  814

Query  760  --GGGATGCACAAAAAGTCGCTGGAGGCAGCAGCCGAGTCGGGGAGGAAGCCCGAGGGGGAACGCCAGGCCCTG  831
              ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  815  TAGGGATGCACAAAAAGTCGCTGGAGGCAGCAGCTGAGTCGGGAAGGAAGCCCGAGGTGGAACGCCAGGCCCTG  888

Query  832  CCCAAGCTCGACAAGATGGAGCAGGACGAGCGGGGCCCCGACGCTCAGGCGGCCATCTCCCAGGAGGAACTGAG  905
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  889  CCCAAGCTCGACAAGATGGAGCAGGAGGAACGGGCCCCAGAGGCCCAGGCAGCCATCTCCCAGGAAGAACTGAG  962

Query  906  GGAGAACAGCATTGCGGTGCTCCGGGCCAAAGCTCAGGAGCACAGCACCAAAGTGCTGGGGACTGTGTCTGGGC  979
            |||||||||||||||.|..|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  963  GGAGAACAGCATTGCCGCCCTCCGAGCCAAAGCTCAGGAACACAGCACCAAGGTTCTGGGGACTGTATCTGGGC  1036

Query  980  CGGACAGCCTGGCCCGGAGTACCGAGAAGCCAGAGGAGGAGGAGGCCATGGATGAAGACAGGCCGGCGGAGAGG  1053
            |.||||||||||||.|.|.|.|.|||||||||||.||.|||||.||||.|||.|||||||||||.||.||||.|
Sbjct 1037  CTGACAGCCTGGCCAGAAATGCTGAGAAGCCAGAAGAAGAGGACGCCACGGAGGAAGACAGGCCAGCTGAGAAG  1110

Query 1054  CTCAGTCCACCGCAGCTGGAGGACATGGCT  1083
            |||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTCAGCCCACCGCAGCTGGAGGACATGGCT  1140