Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10020
• Subject: NM_182606.4
• Aligned Length: 1263
• Identities: 1251
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGATGTATCGGACAGTAGGATTTGGCACCCGAAGCAGAAATCTGAAGCCATGGATGATTGCCGTTCTCATTGT  74
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGTATCGGACAGTGGGATTTGGCACCCGAAGCAGAAATCTGAAGCCATGGATGATTGCCGTTCTCATTGT  74

Query   75  GTTGTCCCTGACAGTGGTGGCAGTGACCATAGGTCTCCTGGTTCACTTCCTAGTATTTGACCAAAAAAAGGAGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTTGTCCCTGACAGTGGTGGCAGTGACCATAGGTCTCCTGGTTCACTTCCTAGTATTTGACCAAAAAAAGGAGT  148

Query  149  ACTATCATGGCTCCTTTAAAATTTTAGATCCACAAATCAATAACAATTTCGGACAAAGCAACACATATCAACTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACTATCATGGCTCCTTTAAAATTTTAGATCCACAAATCAATAACAATTTCGGACAAAGCAACACATATCAACTT  222

Query  223  AAGGACTTACGAGAGACGACCGAAAATTT---------GGTGGATGAGATATTTATAGATTCAGCCTGGAAGAA  287
            |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGGACTTACGAGAGACGACCGAAAATTTGGTGAGTCAGGTGGATGAGATATTTATAGATTCAGCCTGGAAGAA  296

Query  288  AAATTATATCAAGAACCAAGTAGTCAGACTGACTCCAGAGGAAGATGGTGTGAAAGTAGATGTCATTATGGTGT  361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAATTATATCAAGAACCAAGTAGTCAGACTGACTCCAGAGGAAGATGGTGTGAAAGTAGATGTCATTATGGTGT  370

Query  362  TCCAGTTCCCCTCTACTGAACAAAGGGCAGTAAGAGAGAAGAAAATCCAAAGCATCTTAAATCAGAAGATAAGG  435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCAGTTCCCCTCTACTGAACAAAGGGCAGTAAGAGAGAAGAAAATCCAAAGCATCTTAAATCAGAAGATAAGG  444

Query  436  AATTTAAGAGCCTTGCCAATAAATGCCTCATCAGTTCAAGTTAATGCAATGAGCTCATCAACAGGGGAGTTAAC  509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATTTAAGAGCCTTGCCAATAAATGCCTCATCAGTTCAAGTTAATGCAATGAGCTCATCAACAGGGGAGTTAAC  518

Query  510  TGTCCAAGCAAGTTGTGGTAAACGAGTTGTTCCATTAAACGTCAACAGAATAGCATCTGGAGTCATTGCACCCA  583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTCCAAGCAAGTTGTGGTAAACGAGTTGTTCCATTAAACGTCAACAGAATAGCATCTGGAGTCATTGCACCCA  592

Query  584  AGGCGGCCTGGCCTTGGCAAGCTTCCCTTCAGTATGATAACATCCATCAGTGTGGGGCCACCTTGATTAGTAAC  657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGCGGCCTGGCCTTGGCAAGCTTCCCTTCAGTATGATAACATCCATCAGTGTGGGGCCACCTTGATTAGTAAC  666

Query  658  ACATGGCTTGTCACTGCAGCACACTGCTTCCAGAAGTATAAAAATCCACATCAATGGACTGTTAGTTTTGGAAC  731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACATGGCTTGTCACTGCAGCACACTGCTTCCAGAAGTATAAAAATCCACATCAATGGACTGTTAGTTTTGGAAC  740

Query  732  AAAAATCAACCCTCCCTTAATGAAAAGAAATGTCAGAAGATTTATTATCCATGAGAAGTACCGCTCTGCAGCAA  805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAAAATCAACCCTCCCTTAATGAAAAGAAATGTCAGAAGATTTATTATCCATGAGAAGTACCGCTCTGCAGCAA  814

Query  806  GAGAGTACGACATTGCTGTTGTGCAGGTCTCTTCCAGAGTCACCTTTTCGGATGACATACGCCGGATTTGTTTG  879
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  815  GAGAGTACGACATTGCTGTTGTGCAGGTCTCTTCCAGAGTCACCTTTTCGGATGACATACGCCAGATTTGTTTG  888

Query  880  CCAGAAGCCTCTGCATCCTTCCAACCAAATTTGACTGTCCACATCACAGGATTTGGAGCACTTTACTATGGTGG  953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCAGAAGCCTCTGCATCCTTCCAACCAAATTTGACTGTCCACATCACAGGATTTGGAGCACTTTACTATGGTGG  962

Query  954  GGAATCCCAAAATGATCTCCGAGAAGCCAGAGTGAAAATCATAAGTGACGATGTCTGCAAGCAACCACAGGTGT  1027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAATCCCAAAATGATCTCCGAGAAGCCAGAGTGAAAATCATAAGTGATGATGTCTGCAAGCAACCACAGGTGT  1036

Query 1028  ATGGCAATGATATAAAACCTGGAATGTTCTGTGCCGGATATATGGAAGGAATTTATGATGCCTGCAGGGGTGAT  1101
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGGCAATGATATAAAACCTGGAATGTTCTGTGCCGGATATATGGAAGGAATTTATGATGCCTGCAGGGGTGAT  1110

Query 1102  TCTGGGGGACCTTTAGTCACAAGGGATCTGAAAGATACGTGGTATCTCATTGGAATTGTAAGCTGGGGAGATAA  1175
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTGGGGGACCTTTAGTCACAAGGGATCTGAAAGATACGTGGTATCTCATTGGAATTGTAAGCTGGGGAGATAA  1184

Query 1176  CTGTGGTCAAAAGGACAAGCCTGGAGTCTACACACAAGTGACTTATTACCGAAACTGGATTGCTTCAAAAACAG  1249
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTGTGGTCAAAAGGACAAGCCTGGAGTCTACACACAAGTGACTTATTACCGAAACTGGATTGCTTCAAAAACAG  1258

Query 1250  GCATC  1254
            |||||
Sbjct 1259  GCATC  1263