Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10022
- Subject:
- XM_011246974.2
- Aligned Length:
- 1723
- Identities:
- 1264
- Gaps:
- 302
Alignment
Query 1 ATGCACACCCTCACTGGCTTCTCCCTGGTCAGCCTGCTCAGCTTCGGCTACCTGTCCTGGGACTGGGCCAAGCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAGCTTCGTGGCCGACGGGCCCGGGGAGGCTGGCGAGCAGCCCTCGGCCGCTCCGCCCCAGCCTCCCCACATCA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TCTTCATCCTCACGGACGACCAAGGCTACCACGACGTGGGCTACCATGGTTCAGATATCGAGACCCCTACGCTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GACAGGCTGGCGGCCAAGGGGGTCAAGTTGGAGAATTATTACATCCAG--CCCA-TCTGCACGCCTTCGCGGAG 293
||.||| |||| |||
Sbjct 1 ------------------------------------------ATGCAGAACCCACTCT---------------- 16
Query 294 CCAGCTCCTCACT-GGCAGGTACCAGATCCACACAGGACTCCAGCATTCCATCATCCGCCCACAGCAGCCCAAC 366
|||| ||| |.||.||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 17 -----TCCT-ACTAGCCATGTACCAGATCCATACAGGATTGCAGCACTCCATTATCCGCCCACGGCAGCCCAAC 84
Query 367 TGCCTGCCCCTGGACCAGGTGACACTGCCACAGAAGCTGCAGGAGGCAGGTTATTCCACCCATATGGTGGGCAA 440
||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 85 TGTCTGCCCCTGGACCAGGTGACGCTGCCCCAGAAGCTACAGGAGGCAGGCTACTCCACCCACATGGTGGGCAA 158
Query 441 GTGGCACCTGGGCTTCTACCGGAAGGAGTGTCTGCCCACCCGTCGGGGCTTCGACACCTTCCTGGGCTCGCTCA 514
||||||.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 159 GTGGCATCTGGGCTTCTACCGGAAGGAGTGCTTGCCTACCCGCCGGGGCTTCGACACCTTCCTGGGTTCCCTCA 232
Query 515 CGGGCAATGTGGACTATTACACCTATGACAACTGTGATGGCCCAGGCGTGTGCGGCTTCGACCTGCACGAGGGT 588
|.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 233 CAGGCAATGTGGATTACTACACCTACGACAACTGTGATGGCCCAGGGGTTTGTGGGTTTGACCTGCACGAGGGT 306
Query 589 GAGAATGTGGCCTGGGGGCTCAGCGGCCAGTACTCCACTATGCTTTACGCCCAGCGCGCCAGCCATATCCTGGC 662
||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 307 GAGAGCGTGGCCTGGGGGCTCAGCGGCCAGTACTCCACTATGCTCTACGCTCAGCGTGCAAGCCACATCCTGGC 380
Query 663 CAGCCACAGCCCTCAGCGTCCCCTCTTCCTCTATGTGGCCTTCCAGGCAGTACACACACCCCTGCAGTCCCCTC 736
||||||||..||.|||..|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 381 CAGCCACAATCCCCAGAATCCCCTCTTTCTCTATGTGGCCTTCCAGGCAGTACACACGCCCCTACAGTCACCTC 454
Query 737 GTGAGTACCTGTACCGCTACCGCACCATGGGCAATGTGGCCCGGCGGAAGTACGCGGCCATGGTGACCTGCATG 810
|.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 455 GAGAATACCTATACCGCTACCGCACGATGGGCAACGTAGCACGGCGCAAGTACGCAGCCATGGTGACCTGCATG 528
Query 811 GATGAGGCTGTGCGCAACATCACCTGGGCCCTCAAGCGCTACGGTTTCTACAACAACAGTGTCATCATCTTCTC 884
||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 529 GACGAGGCTGTGCGTAACATCACCTGGGCCCTCAAGCGCTATGGTTTCTATAACAACAGTGTCATTATCTTCTC 602
Query 885 CAGTGACAATGGTGGCCAGACTTTCTCGGGGGGCAGCAACTGGCCGCTCCGAGGACGCAAGGGCACTTATTGGG 958
|||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 603 CAGTGACAATGGTGGCCAGACCTTCTCAGGGGGTAGCAACTGGCCCCTTCGAGGACGCAAGGGTACTTACTGGG 676
Query 959 AAGGTGGCGTGCGGGGCCTAGGCTTTGTCCACAGTCCCCTGCTCAAGCGAAAGCAACGGACAAGCCGGGCACTG 1032
|||||||.|||.|||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||..||||..||||||.||.|||||.|||
Sbjct 677 AAGGTGGTGTGAGGGGCCTGGGTTTTGTCCACAGCCCACTGCTCAAGAAAAAGAGACGGACCAGTCGGGCCCTG 750
Query 1033 ATGCACATCACTGACTGGTACCCGACCCTGGTGGGTCTGGCAGGTGGTACCACCTCAGCAGCCGATGGGCTAGA 1106
.|.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 751 GTCCATATCACAGACTGGTACCCAACACTGGTGGGTCTGGCAGGCGGTACTACATCAGCAGCTGATGGGCTGGA 824
Query 1107 TGGCTACGACGTGTGGCCGGCCATCAGCGAGGGCCGGGCCTCACCACGCACGGAGATCCTGCACAACATTGACC 1180
||||||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 825 TGGCTATGATGTATGGCCAGCCATTAGTGAGGGCCGGGCCTCACCACGCACAGAGATCCTACACAACATCGACC 898
Query 1181 CACTCTACAACCATGCCCAGCATGGCTCCCTGGAGGGCGGCTTTGGCATCTGGAACACCGCCGTGCAGGCTGCC 1254
|.||||||||||||||||.||||||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct 899 CCCTCTACAACCATGCCCGGCATGGATCCTTGGAGGGTGGCTTTGGGATCTGGAATACAGCAGTGCAGGCTGCT 972
Query 1255 ATCCGCGTGGGTGAGTGGAAGCTGCTGACAGGAGACCCCGGCTATGGCGATTGGATCCCACCGCAGACACTGGC 1328
|||||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 973 ATCCGAGTTGGGGAGTGGAAGCTGCTCACTGGAGACCCAGGCTATGGTGACTGGATTCCACCTCAGACACTGGC 1046
Query 1329 CACCTTCCCGGGTAGCTGGTGGAACCTGGAACGAATGGCCAGTGTCCGCCAGGCCGTGTGGCTCTTCAACATCA 1402
|.|||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||..||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1047 CTCCTTCCCTGGCAGCTGGTGGAACCTGGAGCGGATGGCCAGCATCCGCCAGGCTGTGTGGCTCTTTAACATCA 1120
Query 1403 GTGCTGACCCTTATGAACGGGAGGACCTGGCTGGCCAGCGGCCTGATGTGGTCCGCACCCTGCTGGCTCGCCTG 1476
|||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1121 GTGCTGACCCTTACGAACGAGAGGACCTGGCTGGCCAGCGACCCGATGTAGTCCGCACCCTTCTGGCTCGCCTG 1194
Query 1477 GCCGAATATAACCGCACAGCCATCCCGGTACGCTACCCAGCTGAGAACCCCCGGGCTCATCCTGACTTTAATGG 1550
||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||.||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1195 GCTGATTATAACCGTACTGCCATCCCCGTGCGTTACCCAGCTGCGAACCCTCGGGCCCATCCTGACTTTAATGG 1268
Query 1551 GGGTGCTTGGGGGCCCTGGGCCAGT---GATGAGGAAGAGGAGGAAGAGGAAG-GGAGG--------GCTCGAA 1612
||||||||||||||||||||||||| ||.||||||||||||||.||||||| ||||| |||.|||
Sbjct 1269 GGGTGCTTGGGGGCCCTGGGCCAGTGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGGCAGAGCTAGAA 1342
Query 1613 GCTTCTCCCGGGGTCGTCGCAAGAAAAAATGCAAGATTTGCAAGCTTCGATCCTTTTTCCGTAAACTCAACACC 1686
|.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1343 GTTTCTCCCGGGGTCGCCGCAAGAAGAAATGCAAGATTTGCAAGCTTCGATCTTTTTTCCGTAAACTCAATACC 1416
Query 1687 AGGCTAATGTCCCAACGGATC 1707
|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1417 AGGCTGATGTCCCACCGGATC 1437