Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10033
• Subject: NM_199289.3
• Aligned Length: 2124
• Identities: 2123
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGATAAGTACGATGCGATTAAGGCCATCGGGCAAGGTGCCTTCGGGAAAGCATACTTAGCTAAAGGGAAATC  74
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATAAGTACGATGTGATTAAGGCCATCGGGCAAGGTGCCTTCGGGAAAGCATACTTAGCTAAAGGGAAATC  74

Query   75  AGATAGCAAGCACTGTGTCATAAAAGAGATCAATTTTGAAAAGATGCCCATACAAGAAAAAGAAGCTTCAAAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGATAGCAAGCACTGTGTCATAAAAGAGATCAATTTTGAAAAGATGCCCATACAAGAAAAAGAAGCTTCAAAGA  148

Query  149  AAGAAGTGATTCTTCTGGAAAAGATGAAACATCCCAACATTGTAGCCTTCTTCAATTCATTTCAAGAGAATGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGAAGTGATTCTTCTGGAAAAGATGAAACATCCCAACATTGTAGCCTTCTTCAATTCATTTCAAGAGAATGGC  222

Query  223  AGGCTGTTTATTGTAATGGAATATTGTGATGGAGGGGATCTCATGAAAAGGATCAATAGACAACGGGGTGTGTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGCTGTTTATTGTAATGGAATATTGTGATGGAGGGGATCTCATGAAAAGGATCAATAGACAACGGGGTGTGTT  296

Query  297  ATTTAGTGAAGATCAGATCCTCGGTTGGTTTGTACAGATTTCTCTAGGACTAAAACATATTCATGACAGGAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATTTAGTGAAGATCAGATCCTCGGTTGGTTTGTACAGATTTCTCTAGGACTAAAACATATTCATGACAGGAAGA  370

Query  371  TATTACACAGGGACATAAAAGCTCAGAACATTTTTCTTAGCAAGAACGGAATGGTGGCAAAGCTTGGGGACTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TATTACACAGGGACATAAAAGCTCAGAACATTTTTCTTAGCAAGAACGGAATGGTGGCAAAGCTTGGGGACTTT  444

Query  445  GGTATAGCAAGAGTCCTGAATAATTCCATGGAACTTGCTCGAACTTGTATTGGAACACCTTACTACCTGTCCCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGTATAGCAAGAGTCCTGAATAATTCCATGGAACTTGCTCGAACTTGTATTGGAACACCTTACTACCTGTCCCC  518

Query  519  AGAGATCTGTCAGAATAAACCCTACAACAATAAAACGGATATTTGGTCTCTTGGCTGTGTCTTATATGAGCTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAGATCTGTCAGAATAAACCCTACAACAATAAAACGGATATTTGGTCTCTTGGCTGTGTCTTATATGAGCTCT  592

Query  593  GCACACTTAAACATCCTTTTGAGGGTAACAACTTACAGCAGCTGGTTCTGAAGATTTGTCAAGCACATTTTGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCACACTTAAACATCCTTTTGAGGGTAACAACTTACAGCAGCTGGTTCTGAAGATTTGTCAAGCACATTTTGCC  666

Query  667  CCAATATCTCCGGGGTTTTCTCGTGAGCTCCATTCCTTGATATCTCAGCTCTTTCAAGTATCTCCTCGAGACCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCAATATCTCCGGGGTTTTCTCGTGAGCTCCATTCCTTGATATCTCAGCTCTTTCAAGTATCTCCTCGAGACCG  740

Query  741  ACCATCCATAAATTCCATTTTGAAAAGGCCCTTTTTAGAGAATCTTATTCCCAAATATTTGACTCCTGAGGTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACCATCCATAAATTCCATTTTGAAAAGGCCCTTTTTAGAGAATCTTATTCCCAAATATTTGACTCCTGAGGTCA  814

Query  815  TTCAGGAAGAATTCAGTCACATGCTTATATGCAGAGCAGGAGCGCCAGCTTCTCGACATGCTGGGAAGGTGGTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCAGGAAGAATTCAGTCACATGCTTATATGCAGAGCAGGAGCGCCAGCTTCTCGACATGCTGGGAAGGTGGTC  888

Query  889  CAGAAGTGTAAAATACAAAAAGTGAGATTCCAGGGAAAGTGCCCACCAAGATCAAGGATATCTGTGCCAATTAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGAAGTGTAAAATACAAAAAGTGAGATTCCAGGGAAAGTGCCCACCAAGATCAAGGATATCTGTGCCAATTAA  962

Query  963  AAGGAATGCTATATTGCATAGAAATGAATGGAGACCACCAGCTGGAGCCCAGAAGGCCAGATCTATAAAAATGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAGGAATGCTATATTGCATAGAAATGAATGGAGACCACCAGCTGGAGCCCAGAAGGCCAGATCTATAAAAATGA  1036

Query 1037  TAGAAAGACCCAAAATTGCTGCTGTCTGTGGACATTATGATTATTATTATGCTCAACTTGATATGCTGAGGAGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAGAAAGACCCAAAATTGCTGCTGTCTGTGGACATTATGATTATTATTATGCTCAACTTGATATGCTGAGGAGG  1110

Query 1111  AGAGCCCACAAACCAAGTTATCACCCTATTCCTCAAGAAAATACTGGAGTTGAGGATTACGGTCAGGAAACGAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGAGCCCACAAACCAAGTTATCACCCTATTCCTCAAGAAAATACTGGAGTTGAGGATTACGGTCAGGAAACGAG  1184

Query 1185  GCATGGTCCATCCCCAAGTCAATGGCCTGCTGAGTACCTTCAGAGAAAATTTGAAGCTCAACAATATAAGTTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCATGGTCCATCCCCAAGTCAATGGCCTGCTGAGTACCTTCAGAGAAAATTTGAAGCTCAACAATATAAGTTGA  1258

Query 1259  AAGTGGAGAAGCAATTGGGTCTTCGTCCATCTTCTGCCGAGCCAAATTACAACCAGAGACAAGAGCTAAGAAGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGTGGAGAAGCAATTGGGTCTTCGTCCATCTTCTGCCGAGCCAAATTACAACCAGAGACAAGAGCTAAGAAGT  1332

Query 1333  AATGGAGAAGAGCCTAGATTCCAGGAGCTGCCATTTAGGAAAAACGAAATGAAGGAACAGGAATATTGGAAGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AATGGAGAAGAGCCTAGATTCCAGGAGCTGCCATTTAGGAAAAACGAAATGAAGGAACAGGAATATTGGAAGCA  1406

Query 1407  GTTAGAGGAAATACGCCAACAGTACCACAATGACATGAAAGAAATTAGAAAGAAGATGGGGAGAGAACCAGAGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTTAGAGGAAATACGCCAACAGTACCACAATGACATGAAAGAAATTAGAAAGAAGATGGGGAGAGAACCAGAGG  1480

Query 1481  AGAACTCAAAAATAAGTCATAAAACCTATTTGGTGAAGAAGAGTAACCTGCCTGTCCATCAAGATGCATCTGAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGAACTCAAAAATAAGTCATAAAACCTATTTGGTGAAGAAGAGTAACCTGCCTGTCCATCAAGATGCATCTGAG  1554

Query 1555  GGAGAAGCACCTGTGCAGATGGAATTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGAGAAGCACCTGTGCAGATGGAATTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCAC  1628

Query 1629  CGCAACCTCCGCCTCCCAGGACATTGAAAAAGACTTGAAACAAATGAGGCTTCAGAACACAAAGGAAAGTAAAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CGCAACCTCCGCCTCCCAGGACATTGAAAAAGACTTGAAACAAATGAGGCTTCAGAACACAAAGGAAAGTAAAA  1702

Query 1703  ATCCAGAACAGAAATATAAAGCTAAGAAGGGGGTAAAATTTGAAATTAATTTAGACAAATGTATTTCTGATGAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATCCAGAACAGAAATATAAAGCTAAGAAGGGGGTAAAATTTGAAATTAATTTAGACAAATGTATTTCTGATGAA  1776

Query 1777  AACATCCTCCAAGAGGAAGAGGCAATGGATATACCAAATGAAACTTTGACCTTTGAGGATGGCATGAAGTTTAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AACATCCTCCAAGAGGAAGAGGCAATGGATATACCAAATGAAACTTTGACCTTTGAGGATGGCATGAAGTTTAA  1850

Query 1851  GGAATATGAATGTGTAAAGGAGCATGGAGATTATACAGACAAAGCATTTGAAAAACTTCACTGCCCAGAAGCAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGAATATGAATGTGTAAAGGAGCATGGAGATTATACAGACAAAGCATTTGAAAAACTTCACTGCCCAGAAGCAG  1924

Query 1925  GGTTTTCCACGCAGACTGTAGCTGCTGTGGGAAACAGGAGGCAGTGGGATGGAGGAGCGCCTCAGACTCTGCTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GGTTTTCCACGCAGACTGTAGCTGCTGTGGGAAACAGGAGGCAGTGGGATGGAGGAGCGCCTCAGACTCTGCTG  1998

Query 1999  CAGATGATGGCAGTGGCCGACATCACCTCCACCTGCCCCACGGGGCCTGACAGTGAGTCTGTGCTTAGCGTCAG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CAGATGATGGCAGTGGCCGACATCACCTCCACCTGCCCCACGGGGCCTGACAGTGAGTCTGTGCTTAGCGTCAG  2072

Query 2073  TCGTCAGGAAGGGAAGACCAAGGACCCGTACAGCCCAGTGCTCATCCTGATG  2124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TCGTCAGGAAGGGAAGACCAAGGACCCGTACAGCCCAGTGCTCATCCTGATG  2124