Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10083
• Subject: NM_001256128.2
• Aligned Length: 1152
• Identities: 1003
• Gaps: 147

Alignment

Query    1  ATGGCAGCGCTGACACTGAGGGGTGTCCGGGAGCTGCTGAAGCGTGTGGACCTCGCGACGGTCCCGCGGAGACA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCGATATAAGAAGAAATGGGCTGCCACAGAGCCCAAATTCCCTGCTGTTCGACTGGCTTTGCAGAATTTTGACA  148
                                                                                     |
Sbjct    1  -------------------------------------------------------------------------A  1

Query  149  TGGCTTACAGTGTGCAGTTTGGAGATCTTTGGCCATCAATCCGTGTCAGTCTCCTCTCAGAGCAGAAGTATGGT  222
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    2  TGACTTACAGTGTGCAGTTTGGAGATCTTTGGCCATCAATCCGTGTCAGTCTCCTCTCAGAGCAGAAGTATGGT  75

Query  223  GCACTGGTCAATAACTTTGCTGCCTGGGATCATGTAAGTGCTAAGCTGGAGCAGCTGAGTGCCAAGGATTTTGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   76  GCACTGGTCAATAACTTTGCTGCCTGGGATCATGTAAGTGCTAAGCTGGAGCAGCTGAGTGCCAAGGATTTTGT  149

Query  297  GAATGAAGCCATCTCCCACTGGGAACTGCAGTCTGAGGGTGGCCAATCTGCAGCCCCATCCCCTGCCTCCTGGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  150  GAATGAAGCCATCTCCCACTGGGAACTGCAGTCTGAGGGTGGCCAATCTGCAGCCCCATCCCCTGCCTCCTGGG  223

Query  371  CCTGCAGTCCGAACCTTCGATGCTTCACTTTTGACAGAGGGGATATCAGTCGCTTCCCTCCTGCCAGACCTGGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  224  CCTGCAGTCCGAACCTTCGATGCTTCACTTTTGACAGAGGGGATATCAGTCGCTTCCCTCCTGCCAGACCTGGC  297

Query  445  AGCCTGGGTGTCATGGAGTACTACCTGATGGATGCTGCCTCCTTGCTGCCTGTTCTGGCCCTCGGCCTGCAGCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  298  AGCCTGGGTGTCATGGAGTACTACCTGATGGATGCTGCCTCCTTGCTGCCTGTTCTGGCCCTCGGCCTGCAGCC  371

Query  519  TGGGGACATCGTGCTTGACCTATGTGCAGCTCCTGGGGGAAAGACACTAGCGTTGCTTCAGACTGGCTGTTGCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  372  TGGGGACATCGTGCTTGACCTATGTGCAGCTCCTGGGGGAAAGACACTAGCGTTGCTTCAGACTGGCTGTTGCC  445

Query  593  GCAATCTTGCTGCCAATGATCTCTCCCCGTCCCGAATAGCCAGACTACAGAAGATCCTTCACAGCTATGTGCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  446  GCAATCTTGCTGCCAATGATCTCTCCCCGTCCCGAATAGCCAGACTACAGAAGATCCTTCACAGCTATGTGCCT  519

Query  667  GAAGAGATCAGGGATGGAAATCAAGTTCGAGTTACCTCATGGGATGGCAGGAAATGGGGAGAACTGGAGGGGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  520  GAAGAGATCAGGGATGGAAATCAAGTTCGAGTTACCTCATGGGATGGCAGGAAATGGGGAGAACTGGAGGGGGA  593

Query  741  CACCTATGACCGGGTGCTGGTGGATGTGCCCTGTACCACAGACCGCCACTCCCTTCATGAGGAGGAGAACAACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  594  CACCTATGACCGGGTGCTGGTGGATGTGCCCTGTACCACAGACCGCCACTCCCTTCATGAGGAGGAGAACAACA  667

Query  815  TCTTTAAGCGGTCAAGGAAGAAGGAGCGACAGATATTGCCTGTGCTGCAAGTGCAGCTTCTTGCGGCTGGACTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  668  TCTTTAAGCGGTCAAGGAAGAAGGAGCGACAGATATTGCCTGTGCTGCAAGTGCAGCTTCTTGCGGCTGGACTC  741

Query  889  CTTGCCACCAAACCAGGAGGCCATGTTGTCTATTCTACCTGCTCACTCTCACACTTACAGAACGAGTATGTGGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  742  CTTGCCACCAAACCAGGAGGCCATGTTGTCTATTCTACCTGCTCACTCTCACACTTACAGAACGAGTATGTGGT  815

Query  963  GCAAGGTGCCATTGAGCTCCTGGCCAATCAATACAGCATCCAGGTACGGGTGGAAGATCTGACTCACTTCCGAA  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  816  GCAAGGTGCCATTGAGCTCCTGGCCAATCAATACAGCATCCAGGTACAGGTGGAAGATCTGACTCACTTCCGAA  889

Query 1037  GGGTTTTCATGGACACATTTTGTTTCTTCTCATCCTGTCAGGTTGGGGAGCTGGTAATACCAAACCTCATGGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  890  GGGTTTTCATGGACACATTTTGTTTCTTCTCATCCTGTCAGGTTGGGGAGCTGGTAATACCAAACCTCATGGCC  963

Query 1111  AATTTTGGCCCCATGTACTTCTGCAAAATGCGTAGGCTGACA  1152
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  964  AATTTTGGCCCCATGTACTTCTGCAAAATGCGTAGGCTGACA  1005