Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10083
- Subject:
- NM_028142.4
- Aligned Length:
- 1157
- Identities:
- 994
- Gaps:
- 19
Alignment
Query 1 ATGGCAGCGCTGACAC-----TGAGGGGTGTCCGGGAGCTGCTGAAGCGTGTGGACCTCGCGACGGTCCCGCGG 69
|||||.|||| | |.||..||||.|||.||||||||||||..||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTGCGC-----CCGTCTTAAGATGTGTTCGGAAGCTGCTGAAGCTCGTGGACTTCACGCCGGTCCCGCGG 69
Query 70 AGACATCGATATAAGAAGAAATGGGCTGCCACAGAGCCCAAATTCCCTGCTGTTCGACTGGCTTTGCAGAATTT 143
|||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.||..|||||.|.||...|||.||.|||.||||||||||
Sbjct 70 AGATATCGATATAAGAAGAAATGGGCTACCACAGAACCACAATTCACGGCCAGTCGGCTTGCTCTGCAGAATTT 143
Query 144 TGACATGGCTTACAGTGTGCAGTTTGGAGATCTTTGGCCATCAATCCGTGTCAGTCTCCTCTCAGAGCAGAAGT 217
|||||||.|.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 144 TGACATGACCTACAGTGTACAGTTTGGGGATCTTTGGCCATCAATCCGTGTTAGTCTTCTCTCAGAGCAGAAGT 217
Query 218 ATGGTGCACTGGTCAATAACTTTGCTGCCTGGGATCATGTAAGTGCTAAGCTGGAGCAGCTGAGTGCCAAGGAT 291
||||||||.||||||||||.||||||||.||||||..|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 218 ATGGTGCATTGGTCAATAATTTTGCTGCTTGGGATAGTGTGAGTGCTAAGCTGGAGCAGCTGAGTGCCAAGGAC 291
Query 292 TTTGTGAATGAAGCCATCTCCCACTGGGAACTGCAGTCTGAGGGTGGCCAATCTGCAGCCCCATCCCCTGCCTC 365
||.||.|.||||||||||||.|||..|.|||||.||.|||||.||||||..|||.||.|.|||||||
Sbjct 292 TTCGTCAGTGAAGCCATCTCTCACCAGAAACTGGAGCCTGAGAGTGGCCTCTCTCCAACTCCATCCC------- 358
Query 366 CTGGGCCTGCAGTCCGAACCTTCGATGCTTCACTTTTGACAGAGGGGATATCAGTCGCTTCCCTCCTGCCAGAC 439
.||.||||||.||.||.||||||||||||||||||..|||||||||..||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 359 --TGGACTGCAGCCCAAATCTTCGATGCTTCACTTTTTCCAGAGGGGACGTCAGCCGCTTTCCTCCTGCCAGAC 430
Query 440 CTGGCAGCCTGGGTGTCATGGAGTACTACCTGATGGATGCTGCCTCCTTGCTGCCTGTTCTGGCCCTCGGCCTG 513
.|||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||
Sbjct 431 TTGGCAGCCTGGGTCTCATGGACTACTACCTGATGGATGCTGCCTCCTTGCTCCCTGTCCTGGCTCTTGGTCTG 504
Query 514 CAGCCTGGGGACATCGTGCTTGACCTATGTGCAGCTCCTGGGGGAAAGACACTAGCGTTGCTTCAGACTGGCTG 587
||||.|||.||||..||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.||
Sbjct 505 CAGCATGGAGACACTGTGCTTGATCTGTGTGCTGCTCCTGGGGGCAAAACGCTGGCATTACTTCAGACGGGTTG 578
Query 588 TTGCCGCAATCTTGCTGCCAATGATCTCTCCCCGTCCCGAATAGCCAGACTACAGAAGATCCTTCACAGCTATG 661
||||||.|||||.||||||||.||.||||||.|.|||||||.||.||||||.||||||.||||||||||.||||
Sbjct 579 TTGCCGTAATCTAGCTGCCAACGACCTCTCCACTTCCCGAACAGGCAGACTGCAGAAGGTCCTTCACAGTTATG 652
Query 662 TGCCTGAAGAGATCAGGGATGGAAATCAAGTTCGAGTTACCTCATGGGATGGCAGGAAATGGGGAGAACTGGAG 735
|||||.||||.||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 653 TGCCTCAAGATATTAGGGAAGGGAACCAAGTCCGAGTTACCTCATGGGATGGCAGGAAGTGGGGAGAACTGGAG 726
Query 736 GGGGACACCTATGACCGGGTGCTGGTGGATGTGCCCTGTACCACAGACCGCCACTCCCTTCATGAGGAGGAGAA 809
||||||||||||||..|||||.|.||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 727 GGGGACACCTATGATAGGGTGTTAGTAGATGTGCCATGTACCACGGACCGCCATTCCCTTCATGAGGAAGAGAA 800
Query 810 CAACATCTTTAAGCGGTCAAGGAAGAAGGAGCGACAGATATTGCCTGTGCTGCAAGTGCAGCTTCTTGCGGCTG 883
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 801 CAACATCTTTCAGCGGTCAAGGAAGAAGGAGCGACAGATGTTGCCTATGCTGCAGGTGCAGCTTCTTGCGGCTG 874
Query 884 GACTCCTTGCCACCAAACCAGGAGGCCATGTTGTCTATTCTACCTGCTCACTCTCACACTTACAGAACGAGTAT 957
|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 875 GACTCCTTGCCACCAAACCAGGAGGTCACGTTGTCTATTCAACTTGCTCACTGTCTCACTTACAGAATGAGTAT 948
Query 958 GTGGTGCAAGGTGCCATTGAGCTCCTGGCCAATCAATACAGCATCCAGGTACGGGTGGAAGATCTGACTCACTT 1031
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||.||||.|..||||||||.|||.|||||||
Sbjct 949 GTGGTGCAAGGTGCCATTGAGCTTCTGGCCAATCAATACAACATCAAGGTTCAAGTGGAAGACCTGTCTCACTT 1022
Query 1032 CCGAAGGGTTTTCATGGACACATTTTGTTTCTTCTCATCCTGTCAGGTTGGGGAGCTGGTAATACCAAACCTCA 1105
|||||.|.||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023 CCGAAAGCTTTTCATGGACACATTCTGTTTCTTCCCATCCTGCCAGGTTGGGGAGCTGGTAATACCAAACCTCA 1096
Query 1106 TGGCCAATTTTGGCCCCATGTACTTCTGCAAAATGCGTAGGCTGACA 1152
|||.|||||||||.||.|||||||||||||||.|||.|||||||.||
Sbjct 1097 TGGTCAATTTTGGACCTATGTACTTCTGCAAACTGCATAGGCTGCCA 1143