Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10114
• Subject: XM_006715730.1
• Aligned Length: 1379
• Identities: 1307
• Gaps: 55

Alignment

Query    1  ATGAAGAACCCAGAAGCCCAGCAGGATGTTTCAGTTTCCCAGGGATTTCGCATGTTGTTTTACACGATGAAACC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGAACCCAGAAGCCCAGCAGGATGTTTCAGTTTCCCAGGGATTTCGCATGTTGTTTTACACGATGAAACC  74

Query   75  CAGTGAAACTTCATTCCAAACATTAGAAGAGGTGCCTGATTATGTAAAAAAGGCAACTCCATTTTTCATTTCTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGTGAAACTTCATTCCAAACATTAGAAGAGGTGCCTGATTATGTAAAAAAGGCAACTCCATTTTTCATTTCTT  148

Query  149  TGATGCTGCTTGAACTTGTTGTCAGCTGGATTCTCAAAGGAAAGCCACCAGGTCGCCTGGATGATGCTTTAACG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGATGCTGCTTGAACTTGTTGTCAGCTGGATTCTCAAAGGAAAGCCACCAGGTCGCCTGGATGATGCTTTAACG  222

Query  223  TCAATCTCAGCTGGTGTTCTGTCTCGACTTCCAAGTCTATTTTTCAGGAGCATTGAACTGACCAGTTATATTTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCAATCTCAGCTGGTGTTCTGTCTCGACTTCCAAGTCTATTTTTCAGGAGCATTGAACTGACCAGTTATATTTA  296

Query  297  TATCTGGGAGAACTACAGGCTGTTCAATTTGCCTTGGGATTTTCCATGGACTTGGTATTCAGCCTTCTTAGGAG  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TATCTGGGAGAACTACAGGCTGTTCAATTTGCCTTGGGATTCTCCATGGACTTGGTATTCAGCCTTCTTAGGAG  370

Query  371  TTGACTTTGGCTACTACTGGTTCCATCGTATGGCTCATGAAGTTAATATTATGTGGGCCGGACACCAAACACAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGACTTTGGCTACTACTGGTTCCATCGTATGGCTCATGAAGTTAATATTATGTGGGCCGGACACCAAACACAT  444

Query  445  CATAGTTCTGAAGACTATAACTTATCCACAGCACTGAGACAGTCTGTCCTCCAGATATATACTTCCTGGATTTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATAGTTCTGAAGACTATAACTTATCCACAGCACTGAGACAGTCTGTCCTCCAGATATATACTTCCTGGATTTT  518

Query  519  CTACTCTCCCCTGGCCCTCTTCATACCCCCTTCAGTATATGCTGTTCATCTTCAATTCAATCTTCTTTACCAAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTACTCTCCCCTGGCCCTCTTCATACCCCCTTCAGTATATGCTGTTCATCTTCAATTCAATCTTCTTTACCAAT  592

Query  593  TTTGGATCCATACAGAGGTCATCAATAACCTTGGTCCTTTGGAACTGATTCTTAATACTCCTAGCCATCATAGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTGGATCCATACAGAGGTCATCAATAACCTTGGTCCTTTGGAACTGATTCTTAATACTCCTAGCCATCATAGG  666

Query  667  GTTCATCATGGCAGAAATCGTTATTGCATAGACAAAAATTATGCTGGTGTTCTTATTATTTGGGATAAAATTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTTCATCATGGCAGAAATCGTTATTGCATAGACAAAAATTATGCTGGTGTTCTTATTATTTGGGATAAAATTTT  740

Query  741  TGGGACATTTGAAGCAGAAAATGAAAAAGTTGTATATGGCTTAACACATCCCATTAATACATTTGAACCAATCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGGACATTTGAAGCAGAAAATGAAAAAGTTGTATATGGCTTAACACATCCCATTAATACATTTGAACCAATCA  814

Query  815  AAGTGCAGTTCCATCACTTATTTTCCATATGGACTACATTCTGGGCCACACCTGGATTCTTCAATAAGTTTTCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGTGCAGTTCCATCACTTATTTTCCATATGGACTACATTCTGGGCCACACCTGGATTCTTCAATAAGTTTTCT  888

Query  889  GTCATATTTAAGGGACCGGGATGGGGTCCAGGTAAACCAAGACTTGGTCTCAGTGAAGAAATTCCAGAGGTCAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTCATATTTAAGGGACCGGGATGGGGTCCAGGTAAACCAAGACTTGGTCTCAGTGAAGAAATTCCAGAGGTCAC  962

Query  963  CGGCAAAGAAGTTCCCTTCTCATCATCTTCATCTCAGCTATTAAAGATATATACAGTTGTACAGTTTGCTCTGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGGCAAAGAAGTTCCCTTCTCATCATCTTCATCTCAGCTATTAAAGATATATACAGTTGTACAGTTTGCTCTGA  1036

Query 1037  TGTTGGCATTTTATGAAGAGACCTTTGCAGATACAGCTGCACTGTCGCAAGTTACTCTCCTTCTGAGGGTTTGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGTTGGCATTTTATGAAGAGACCTTTGCAGATACAGCTGCACTGTCGCAAGTTACTCTCCTTCTGAGGGTTTGC  1110

Query 1111  TTCATTATCCTGACCTTGACTTCCATTGGATTTCTTCTGGATCAAAGACCCAAGGCAGCTATTATGGAAACTCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCATTATCCTGACCTTGACTTCCATTGGATTTCTTCTGGATCAAAGACCCAAGGCAGCTATTATGGAAACTCT  1184

Query 1185  CCGTTGCTTGATGTTCTTAATGCTGTACCGATTTGGTCACCTGAAGCCTCTTGTCCCTTCATTGTCATCTGCTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCGTTGCTTGATGTTCTTAATGCTGTACCGATTTGGTCACCTGAAGCCTCTTGTCCCTTCATTGTCATCTGCTT  1258

Query 1259  TTGAG----ATTGTTTTTTCCATTTG-CATTG-------------------CTTTCTGGGGAG---TTAGAAGC  1305
            |||||    |||.|.||.|  |..|| .||||                   ||||    ||||   ||..|||.
Sbjct 1259  TTGAGTCATATTCTGTTAT--AAGTGAAATTGGGCTCCAGGCCAAGGAGAACTTT----GGAGAACTTTTAAGT  1326

Query 1306  ATGAAACAACTCAC-CTCTCACCCTTGGAAA----------------  1335
            .||     |.|.|| .||||||...||||||                
Sbjct 1327  TTG-----AGTGACTGTCTCACAGCTGGAAACCACCCCAAAGTGCAT  1368