Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10129
• Subject: NM_001003760.5
• Aligned Length: 1902
• Identities: 1898
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCACCCAAAAAGAAGATTGTCAAAAAGAACAAAGGAGATATCAATGAGATGACTATAATCGTAGAAGATAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCACCCAAAAAGAAGATTGTCAAAAAGAACAAAGGAGATATCAATGAGATGACTATAATCGTAGAAGATAG  74

Query   75  CCCCCTAAACAAACTGAATGCTTTGAATGGGCTCCTAGAGGGAGGCAATGGCCTTAGCTGCATTTCTTCTGAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCCCTAAACAAACTGAATGCTTTGAATGGGCTCCTAGAGGGAGGCAATGGCCTTAGCTGCATTTCTTCTGAAC  148

Query  149  TAACAGATGCTTCTTATGGCCCCAACCTCTTGGAAGGTTTAAGTAAAATGCGGCAGGAGAACTTCTTATGTGAC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  149  TAACAGATGCTTCTTATGGCCCCAACCTCTTGGAAGGTTTAAGTAAAATGCGGCAGGAGAACTTCCTATGTGAC  222

Query  223  TTAGTCATTGGTACCAAAACCAAATCCTTTGATGTTCATAAGTCAGTCATGGCTTCATGCAGTGAGTATTTTTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTAGTCATTGGTACCAAAACCAAATCCTTTGATGTTCATAAGTCAGTCATGGCTTCATGCAGTGAGTATTTTTA  296

Query  297  CAACATCCTAAAAAAAGACCCGTCAATTCAGAGGGTGGATCTCAATGATATCTCACCACTAGGCCTGGCCACTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAACATCCTAAAAAAAGACCCGTCAATTCAGAGGGTGGATCTCAATGATATCTCACCACTAGGCCTGGCCACTG  370

Query  371  TCATTGCATATGCCTACACTGGAAAGCTCACTCTCTCCTTGTATACAATAGGAAGCATTATTTCTGCTGCTGTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCATTGCATATGCCTACACTGGAAAGCTCACTCTCTCCTTGTATACAATAGGAAGCATTATTTCTGCTGCTGTT  444

Query  445  TATCTTCAGATCCATACTCTTATAAAGATGTGCAGTGATTTTCTGATACGGGAGATGAGTGTTGAGAATTGCAT  518
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATCTTCAGATCCATACTCTTGTAAAGATGTGCAGTGATTTTCTGATACGGGAGATGAGTGTTGAGAATTGCAT  518

Query  519  GTATGTTGTTAATATTGCTGAAACATACTCCCTAAAAAATGCAAAAGCAGCAGCCCAGAAATTTATTCGGGATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTATGTTGTTAATATTGCTGAAACATACTCCCTAAAAAATGCAAAAGCAGCAGCCCAGAAATTTATTCGGGATA  592

Query  593  ACTTCCTTGAATTTGCAGAATCGGATCAGTTTATGAAACTTACATTTGAACAAATTAATGAACTTCTTATAGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTTCCTTGAATTTGCAGAATCGGATCAGTTTATGAAACTTACATTTGAACAAATTAATGAACTTCTTATAGAT  666

Query  667  GATGACTTACAGTTGCCTTCTGAGATAGTAGCATTCCAGATTGCAATGAAATGGTTAGAATTTGACCAAAAGAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATGACTTACAGTTGCCTTCTGAGATAGTAGCATTCCAGATTGCAATGAAATGGTTAGAATTTGACCAAAAGAG  740

Query  741  AGTAAAATACGCTGCAGATCTTTTGAGCAATATTCGCTTTGGTACCATCTCTGCACAAGACCTGGTCAATTATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTAAAATACGCTGCAGATCTTTTGAGCAATATTCGCTTTGGTACCATCTCTGCACAAGACCTGGTCAATTATG  814

Query  815  TTCAATCCGTACCAAGAATGATGCAAGATGCTGATTGTCACAGACTTCTCGTAGATGCTATGAACTACCACTTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCAATCCGTACCAAGAATGATGCAAGATGCTGATTGTCACAGACTTCTCGTAGATGCTATGAACTACCACTTG  888

Query  889  CTTCCATATCATCAAAACACATTGCAATCTAGGCGAACAAGAATCCGAGGTGGCTGCCGAGTCCTCGTCACTGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTCCATATCATCAAAACACATTGCAATCTAGGCGAACAAGAATCCGAGGTGGCTGCCGAGTCCTCGTCACTGT  962

Query  963  TGGGGGACGCCCAGGCCTTACTGAGAAGTCCCTTAGCAGAGACATCCTGTATAGAGACCCTGAAAATGGATGGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGGGGACGCCCAGGCCTTACTGAGAAGTCCCTTAGCAGAGACATCTTGTATAGAGACCCTGAAAATGGATGGA  1036

Query 1037  GCAAGCTTACGGAAATGCCAGCCAAAAGTTTTAATCAGTGTGTGGCTGTGATGGATGGATTTCTTTATGTAGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCAAGCTTACGGAAATGCCAGCCAAAAGTTTTAATCAGTGTGTGGCTGTGATGGATGGATTTCTTTATGTAGCC  1110

Query 1111  GGTGGTGAAGACCAGAATGATGCAAGAAATCAAGCCAAGCATGCAGTCAGCAATTTCTGCAGATACGATCCCCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGTGGTGAAGACCAGAATGATGCAAGAAATCAAGCCAAGCATGCAGTCAGCAATTTCTGCAGATACGATCCCCG  1184

Query 1185  CTTCAACACCTGGATACACCTGGCCAGCATGAACCAGAAGCGCACGCACTTCAGCCTGAGCGTGTTCAACGGGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTTCAACACCTGGATACACCTGGCCAGCATGAACCAGAAGCGCACGCACTTCAGCCTGAGCGTGTTCAACGGGC  1258

Query 1259  TCGTGTACGCCGCGGGCGGCCGCAACGCAGAAGGAAGCCTGGCCTCGCTGGAGTGCTACGTGCCCTCCACCAAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCGTGTACGCCGCGGGCGGCCGCAACGCAGAAGGAAGCCTGGCCTCGCTGGAGTGCTACGTGCCCTCCACCAAT  1332

Query 1333  CAGTGGCAGCCGAAGACGCCCCTGGAGGTGGCGCGCTGCTGCCACGCTAGCGCGGTCGCCGACGGCCGCGTGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGTGGCAGCCGAAGACGCCCCTGGAGGTGGCGCGCTGCTGCCACGCTAGCGCGGTCGCCGACGGCCGCGTGCT  1406

Query 1407  GGTGACCGGAGGCTACATCGCCAACGCCTACTCGCGCTCTGTGTGCGCCTACGACCCGGCCAGCGACTCGTGGC  1480
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGTGACCGGAGGCTACATAGCCAACGCCTACTCGCGCTCTGTGTGCGCCTACGACCCGGCCAGCGACTCGTGGC  1480

Query 1481  AGGAGCTGCCGAACCTCAGCACACCCCGGGGCTGGCACTGCGCGGTCACGCTGAGCGACAGAGTGTACGTGATG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGAGCTGCCGAACCTCAGCACACCCCGGGGCTGGCACTGCGCGGTCACGCTGAGCGACAGAGTGTACGTGATG  1554

Query 1555  GGCGGCAGCCAGCTGGGGCCGCGCGGGGAGCGCGTGGACGTGCTCACCGTGGAGTGCTACAGCCCCGCGACCGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGCGGCAGCCAGCTGGGGCCGCGCGGGGAGCGCGTGGACGTGCTCACCGTGGAGTGCTACAGCCCCGCGACCGG  1628

Query 1629  CCAGTGGAGCTACGCGGCGCCGCTGCAGGTGGGAGTGAGCACTGCGGGCGTCTCGGCGCTGCATGGCCGCGCCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCAGTGGAGCTACGCGGCGCCGCTGCAGGTGGGAGTGAGCACTGCGGGCGTCTCGGCGCTGCATGGCCGCGCCT  1702

Query 1703  ACCTGGTGGGGGGCTGGAACGAGGGCGAGAAGAAGTACAAGAAGTGCATCCAGTGCTTCAGCCCCGAGCTCAAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACCTGGTGGGGGGCTGGAACGAGGGCGAGAAGAAGTACAAGAAGTGCATCCAGTGCTTCAGCCCCGAGCTCAAC  1776

Query 1777  GAGTGGACGGAGGACGACGAGCTACCCGAGGCCACTGTCGGCGTGTCCTGCTGCACCCTCTCGATGCCCAACAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAGTGGACGGAGGACGACGAGCTACCCGAGGCCACTGTCGGCGTGTCCTGCTGCACCCTCTCGATGCCCAACAA  1850

Query 1851  CGTGACTCGGGAATCCCGGGCCAGTTCGGTATCTTCTGTGCCAGTCAGTATC  1902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CGTGACTCGGGAATCCCGGGCCAGTTCGGTATCTTCTGTGCCAGTCAGTATC  1902