Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10172
• Subject: NM_001145356.1
• Aligned Length: 1185
• Identities: 1115
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ATGTTACCGGCTGTTGGATCTGTGGATGAGGAAGAGGATCCTGCGGAGGAGGATTGTCCTGAATTGGTTCCCAT  74
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTACCGGCTGTTGGATCTGCGGATGAGGAGGAGGATCCTGCGGAGGAGGATTGTCCTGAATTGGTTCCCAT  74

Query   75  TGAGACGACGCAAAGCGAGGAGGAGGAAAAGTCTGGCCTCGGCGCCAAGATCCCAGTCACAATTATCACCGGGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAGACGACGCAAAGCGAGGAGGAGGAAAAGTCTGGCCTCGGCGCCAAGATCCCAGTCACAATTATCACCGGGT  148

Query  149  ATTTAGGTGCTGGGAAGACAACACTTCTGAACTATATTTTGACAGAGCAACATAGTAAAAGAGTAGCGGTCATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATTTAGGTGCTGGGAAGACAACACTTCTGAACTATATTTTGACAGAGCAACATAGTAAAAGAGTAGCGGTCATT  222

Query  223  TTAAATGAATCTGGGGAAGGAAGTGCGCTGGAGAAATCCTTAGCTGTCAGCCAAGGTGGAGAGCTCTATGAAGA  296
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTAAATGAATTTGGGGAAGGAAGTGCGCTGGAGAAATCCTTAGCTGTCAGCCAAGGTGGAGAGCTCTATGAAGA  296

Query  297  GTGGCTGGAACTTAGAAACGGTTGCCTCTGCTGTTCAGTGAAGGACAATGGCCTTAGAGCTATTGAGAATTTGA  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTGGCTGGAACTTAGAAACGGTTGCCTCTGCTGTTCAGTGAAGGACAGTGGCCTTAGAGCTATTGAGAATTTGA  370

Query  371  TGCAAAAGAAGGGGAAATTTGATTACATACTGTTAGAGACCACTGGATTAGCAGACCCTGGTGCAGTGGCTTCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCAAAAGAAGGGGAAATTTGATTACATACTGTTAGAGACCACTGGATTAGCAGACCCTGGTGCAGTGGCTTCT  444

Query  445  ATGTTTTGGGTTGATGCTGAATTAGGGAGTGATATTTACCTTGATGGTATCATAACTATTGTGGATTCAAAATA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGTTTTGGGTTGATGCTGAATTAGGGAGTGATATTTATCTTGATGGTATCATAACTATTGTGGATTCAAAATA  518

Query  519  TGGATTAAAACATTTAACAGAAGAGAAACCTGATGGCCTTATCAATGAAGCTACTAGGCAAGTTGCTTTGGCAG  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGATTAAAACATTTAACAGAAGAGAAACCTGATGGCCTTATCAATGAAGCTACTAGACAAGTTGCTTTGGCAG  592

Query  593  ATATCATTCTCATTAATAAAATAGACTTGGTTCCAGAAGAAGATGTAAAGAAATTAAGAACGACAATTAGATCC  666
            ||..|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGCCATTCTCATTAATAAAACAGACCTGGTTCCAGAAGAAGATGTAAAGAAATTAAGAACGACAATTAGATCC  666

Query  667  ATAAATGGACTAGGACAAATCTTAGAAACACAAAGATCAAGAGTTGATCTCTCTAATGTATTAGATCTTCATGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                    
Sbjct  667  ATAAATGGACTAGGACAAATCTTAGAAACACAAAGATC------------------------------------  704

Query  741  CTTTGATAGTCTCTCTGGAATAAGTTTGCAGAAAAAACTTCAGCATGTGCCAGGAACACAACCTCACCTTGATC  814
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  705  ---------------------AAGTTTGCAGAAAAAACTTCAGCATGTGCCAGGAACACAACCTCACCTTGATC  757

Query  815  AGAGTATTGTTACAATCACATTTGAAGTACCAGGAAATGCAAAGGAAGAACATCTTAATATGTTTATTCAGAAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  758  AGAGTATTGTTACAATCACATTTGAAGTACCAGGAAATGCAAAGGAAGAACATCTTAATATGTTTATTCAGAAT  831

Query  889  CTCCTGTGGGAAAAGAATGTGAGAAACAAGGACAATCACTGCATGGAGGTCATAAGGCTGAAGGGATTGGTGTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  832  CTCCTGTGGGAAAAGAATGTGAGAAACAAGGACAATCACTGCATGGAGGTCATAAGGCTGAAGGGATTGGTGTC  905

Query  963  AATCAAAGACAAATCACAACAAGTGATTGTCCAGGGTGTCCATGAGCTCTATGATCTGGAGGAGACTCCAGTGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  906  AATCAAAGACAAATCACAACAAGTGATTGTCCAGGGTGTCCATGAGCTCTATGATCTGGAGGAGACTCCAGTGA  979

Query 1037  GCTGGAAGGATGACACTGAGAGAACAAATCGATTGGTCCTCATTGGCAGAAATTTAGATAAGGATATCCTTAAA  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  980  GCTGGAAGGATGACACTGAGAGAACAAATCGATTGGTCCTCCTTGGCAGAAATTTAGATAAGGATATCCTTAAA  1053

Query 1111  CAGCTGTTTATAGCTACTGTGACAGAAACAGAAAAGCAGTGGACAACACATTTCAAAGAAGATCAAGTTTGTAC  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1054  CAGCTGTTTATAGCTACTGTGACAGAAACAGAAAAGCAGTGGACAACACGTTTCCAAGAAGATCAAGTTTGTAC  1127

Query 1185  A  1185
            |
Sbjct 1128  A  1128