Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10208
- Subject:
- NM_001291875.3
- Aligned Length:
- 1794
- Identities:
- 1389
- Gaps:
- 405
Alignment
Query 1 ATGAACAAGCTTTACATCGGGAACCTGAGCCCCGCCGTCACCGCCGACGACCTCCGGCAGCTCTTTGGGGACAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAAGCTGCCCCTGGCGGGACAGGTCCTGCTGAAGTCCGGCTACGCCTTCGTGGACTACCCCGACCAGAACTGGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCATCCGCGCCATCGAGACCCTCTCGGGTAAAGTGGAATTGCATGGGAAAATCATGGAAGTTGATTACTCAGTC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TCTAAAAAGCTAAGGAGCAGGAAAATTCAGATTCGAAACATCCCTCCTCACCTGCAGTGGGAGGTGTTGGATGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 ACTTTTGGCTCAATATGGGACAGTGGAGAATGTGGAACAAGTCAACACAGACACAGAAACCGCCGTTGTCAACG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TCACATATGCAACAAGAGAAGAAGCAAAAATAGCCATGGAGAAGCTAAGCGGGCATCAGTTTGAGAACTACTCC 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------ATGGAGAAGCTAAGCGGGCATCAGTTTGAGAACTACTCC 39
Query 445 TTCAAGATTTCCTACATCCCGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCCCCTCAGCGAGCCCAGCGTGGGGACCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 40 TTCAAGATTTCCTACATCCCGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCCCCTCAGCGAGCCCAGCGTGGGGACCA 113
Query 519 CTCTTCCCGGGAGCAAGGCCACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAGACAGATTGATTTCCCGCTGCGGATCC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 114 CTCTTCCCGGGAGCAAGGCCACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAGACAGATTGATTTCCCGCTGCGGATCC 187
Query 593 TGGTCCCCACCCAGTTTGTTGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGACCATAAAGAACATCACTAAGCAGACC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188 TGGTCCCCACCCAGTTTGTTGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGACCATAAAGAACATCACTAAGCAGACC 261
Query 667 CAGTCCCGGGTAGATATCCATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAGAAGCCTGTCACCATCCATGCCACCCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262 CAGTCCCGGGTAGATATCCATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAGAAGCCTGTCACCATCCATGCCACCCC 335
Query 741 AGAGGGGACTTCTGAAGCATGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAAAGAGGCAGATGAGACCAAACTAGCCG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 336 AGAGGGGACTTCTGAAGCATGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAAAGAGGCAGATGAGACCAAACTAGCCG 409
Query 815 AAGAGATTCCTCTGAAAATCTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGACTGATTGGAAAAGAAGGCAGAAATTTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 AAGAGATTCCTCTGAAAATCTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGACTGATTGGAAAAGAAGGCAGAAATTTG 483
Query 889 AAGAAAATTGAACATGAAACAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTGCAGGATTTGAGCATATACAACCCGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484 AAGAAAATTGAACATGAAACAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTGCAGGATTTGAGCATATACAACCCGGA 557
Query 963 AAGAACCATCACTGTGAAGGGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGAGATAGAGATTATGAAGAAGCTGCGTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 558 AAGAACCATCACTGTGAAGGGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGAGATAGAGATTATGAAGAAGCTGCGTG 631
Query 1037 AGGCCTTTGAAAATGATATGCTGGCTGTTAACCAACAAGCCAATCTGATCCCAGGGTTGAACCTCAGCGCACTT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 632 AGGCCTTTGAAAATGATATGCTGGCTGTTAACCAACAAGCCAATCTGATCCCAGGGTTGAACCTCAGCGCACTT 705
Query 1111 GGCATCTTTTCAACAGGACTGTCCGTGCTATCTCCACCAGCAGGGCCCCGCGGAGCTCCCCCCGCTGCCCCCTA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 706 GGCATCTTTTCAACAGGACTGTCCGTGCTATCTCCACCAGCAGGGCCCCGCGGAGCTCCCCCCGCTGCCCCCTA 779
Query 1185 CCACCCCTTCACTACCCACTCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCATCACCAGTTTGGCCCGTTCCCGCATC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 CCACCCCTTCACTACCCACTCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCATCACCAGTTTGGCCCGTTCCCGCATC 853
Query 1259 ATCACTCTTATCCAGAGCAGGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCCAGGCTGTGGGCGCCATCATCGGGAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 854 ATCACTCTTATCCAGAGCAGGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCCAGGCTGTGGGCGCCATCATCGGGAAG 927
Query 1333 AAGGGGGCACACATCAAACAGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATCAAGATTGCCCCTGCGGAAGGCCCAGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 928 AAGGGGGCACACATCAAACAGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATCAAGATTGCCCCTGCGGAAGGCCCAGA 1001
Query 1407 CGTCAGCGAAAGGATGGTCATCATCACCGGGCCACCGGAAGCCCAGTTCAAGGCCCAGGGACGGATCTTTGGGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002 CGTCAGCGAAAGGATGGTCATCATCACCGGGCCACCGGAAGCCCAGTTCAAGGCCCAGGGACGGATCTTTGGGA 1075
Query 1481 AACTGAAAGAGGAAAACTTCTTTAACCCCAAAGAAGAAGTGAAGCTGGAAGCGCATATCAGAGTGCCCTCTTCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076 AACTGAAAGAGGAAAACTTCTTTAACCCCAAAGAAGAAGTGAAGCTGGAAGCGCATATCAGAGTGCCCTCTTCC 1149
Query 1555 ACAGCTGGCCGGGTGATTGGCAAAGGTGGCAAGACCGTGAACGAACTGCAGAACTTAACCAGTGCAGAAGTCAT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1150 ACAGCTGGCCGGGTGATTGGCAAAGGTGGCAAGACCGTGAACGAACTGCAGAACTTAACCAGTGCAGAAGTCAT 1223
Query 1629 CGTGCCTCGTGACCAAACGCCAGATGAAAATGAGGAAGTGATCGTCAGAATTATCGGGCACTTCTTTGCTAGCC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1224 CGTGCCTCGTGACCAAACGCCAGATGAAAATGAGGAAGTGATCGTCAGAATTATCGGGCACTTCTTTGCTAGCC 1297
Query 1703 AGACTGCACAGCGCAAGATCAGGGAAATTGTACAACAGGTGAAGCAGCAGGAGCAGAAATACCCTCAGGGAGTC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1298 AGACTGCACAGCGCAAGATCAGGGAAATTGTACAACAGGTGAAGCAGCAGGAGCAGAAATACCCTCAGGGAGTC 1371
Query 1777 GCCTCACAGCGCAGCAAG 1794
||||||||||||||||||
Sbjct 1372 GCCTCACAGCGCAGCAAG 1389
