Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10208
• Subject: XM_017005557.2
• Aligned Length: 1849
• Identities: 1733
• Gaps: 116

Alignment

Query    1  ---ATGAACAAGCTTTACATCGGGAACCTGAGCCCCGCCGTCACCGCCGACGACCTCCGGCAGCTCTTTGGGGA  71
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGAACAAGCTTTACATCGGGAACCTGAGCCCCGCCGTCACCGCCGACGACCTCCGGCAGCTCTTTGGGGA  74

Query   72  CAGGAAGCTGCCCCTGGCGGGACAGGTCCTGCTGAAGTCCGGCTACGCCTTCGTGGACTACCCCGACCAGAACT  145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGGAAGCTGCCCCTGGCGGGACAGGTCCTGCTGAAGTCCGGCTACGCCTTCGTGGACTACCCCGACCAGAACT  148

Query  146  GGGCCATCCGCGCCATCGAGACCCTCTCGGGTAAAGTGGAATTGCATGGGAAAATCATGGAAGTTGATTACTCA  219
            |||||||||||||||||||||||||||||                                             
Sbjct  149  GGGCCATCCGCGCCATCGAGACCCTCTCG---------------------------------------------  177

Query  220  GTCTCTAAAAAGCTAAGGAGCAGGAAAATTCAGATTCGAAACATCCCTCCTCACCTGCAGTGGGAGGTGTTGGA  293
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  178  ----------------GGAGCAGGAAAATTCAGATTCGAAACATCCCTCCTCACCTGCAGTGGGAGGTGTTGGA  235

Query  294  TGGACTTTTGGCTCAATATGGGACAGTGGAGAATGTGGAAC---------------------------------  334
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 
Sbjct  236  TGGACTTTTGGCTCAATATGGGACAGTGGAGAATGTGGAACAAGCCTAAAGAAGTAATTCAGAAGAACACACAA  309

Query  335  -------------------AAGTCAACACAGACACAGAAACCGCCGTTGTCAACGTCACATATGCAACAAGAGA  389
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  310  TCCAGTGATGTTTGCAACAAAGTCAACACAGACACAGAAACCGCCGTTGTCAACGTCACATATGCAACAAGAGA  383

Query  390  AGAAGCAAAAATAGCCATGGAGAAGCTAAGCGGGCATCAGTTTGAGAACTACTCCTTCAAGATTTCCTACATCC  463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  384  AGAAGCAAAAATAGCCATGGAGAAGCTAAGCGGGCATCAGTTTGAGAACTACTCCTTCAAGATTTCCTACATCC  457

Query  464  CGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCCCCTCAGCGAGCCCAGCGTGGGGACCACTCTTCCCGGGAGCAAGGC  537
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  458  CGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCCCCTCAGCGAGCCCAGCGTGGGGACCACTCTTCCCGGGAGCAAGGC  531

Query  538  CACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAGACAGATTGATTTCCCGCTGCGGATCCTGGTCCCCACCCAGTTTGT  611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  532  CACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAGACAGATTGATTTCCCGCTGCGGATCCTGGTCCCCACCCAGTTTGT  605

Query  612  TGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGACCATAAAGAACATCACTAAGCAGACCCAGTCCCGGGTAGATATCC  685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  606  TGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGACCATAAAGAACATCACTAAGCAGACCCAGTCCCGGGTAGATATCC  679

Query  686  ATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAGAAGCCTGTCACCATCCATGCCACCCCAGAGGGGACTTCTGAAGCA  759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  680  ATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAGAAGCCTGTCACCATCCATGCCACCCCAGAGGGGACTTCTGAAGCA  753

Query  760  TGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAAAGAGGCAGATGAGACCAAACTAGCCGAAGAGATTCCTCTGAAAAT  833
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  754  TGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAAAGAGGCAGATGAGACCAAACTAGCCGAAGAGATTCCTCTGAAAAT  827

Query  834  CTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGACTGATTGGAAAAGAAGGCAGAAATTTGAAGAAAATTGAACATGAAA  907
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  828  CTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGACTGATTGGAAAAGAAGGCAGAAATTTGAAGAAAATTGAACATGAAA  901

Query  908  CAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTGCAGGATTTGAGCATATACAACCCGGAAAGAACCATCACTGTGAAG  981
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  902  CAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTGCAGGATTTGAGCATATACAACCCGGAAAGAACCATCACTGTGAAG  975

Query  982  GGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGAGATAGAGATTATGAAGAAGCTGCGTGAGGCCTTTGAAAATGATAT  1055
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  976  GGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGAGATAGAGATTATGAAGAAGCTGCGTGAGGCCTTTGAAAATGATAT  1049

Query 1056  GCTGGCTGTTAACCAACAAGCCAATCTGATCCCAGGGTTGAACCTCAGCGCACTTGGCATCTTTTCAACAGGAC  1129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050  GCTGGCTGTTAACCAACAAGCCAATCTGATCCCAGGGTTGAACCTCAGCGCACTTGGCATCTTTTCAACAGGAC  1123

Query 1130  TGTCCGTGCTATCTCCACCAGCAGGGCCCCGCGGAGCTCCCCCCGCTGCCCCCTACCACCCCTTCACTACCCAC  1203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124  TGTCCGTGCTATCTCCACCAGCAGGGCCCCGCGGAGCTCCCCCCGCTGCCCCCTACCACCCCTTCACTACCCAC  1197

Query 1204  TCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCATCACCAGTTTGGCCCGTTCCCGCATCATCACTCTTATCCAGAGCA  1277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198  TCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCATCACCAGTTTGGCCCGTTCCCGCATCATCACTCTTATCCAGAGCA  1271

Query 1278  GGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCCAGGCTGTGGGCGCCATCATCGGGAAGAAGGGGGCACACATCAAAC  1351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1272  GGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCCAGGCTGTGGGCGCCATCATCGGGAAGAAGGGGGCACACATCAAAC  1345

Query 1352  AGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATCAAGATTGCCCCTGCGGAAGGCCCAGACGTCAGCGAAAGGATGGTC  1425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1346  AGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATCAAGATTGCCCCTGCGGAAGGCCCAGACGTCAGCGAAAGGATGGTC  1419

Query 1426  ATCATCACCGGGCCACCGGAAGCCCAGTTCAAGGCCCAGGGACGGATCTTTGGGAAACTGAAAGAGGAAAACTT  1499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1420  ATCATCACCGGGCCACCGGAAGCCCAGTTCAAGGCCCAGGGACGGATCTTTGGGAAACTGAAAGAGGAAAACTT  1493

Query 1500  CTTTAACCCCAAAGAAGAAGTGAAGCTGGAAGCGCATATCAGAGTGCCCTCTTCCACAGCTGGCCGGGTGATTG  1573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494  CTTTAACCCCAAAGAAGAAGTGAAGCTGGAAGCGCATATCAGAGTGCCCTCTTCCACAGCTGGCCGGGTGATTG  1567

Query 1574  GCAAAGGTGGCAAGACCGTGAACGAACTGCAGAACTTAACCAGTGCAGAAGTCATCGTGCCTCGTGACCAAACG  1647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1568  GCAAAGGTGGCAAGACCGTGAACGAACTGCAGAACTTAACCAGTGCAGAAGTCATCGTGCCTCGTGACCAAACG  1641

Query 1648  CCAGATGAAAATGAGGAAGTGATCGTCAGAATTATCGGGCACTTCTTTGCTAGCCAGACTGCACAGCGCAAGAT  1721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1642  CCAGATGAAAATGAGGAAGTGATCGTCAGAATTATCGGGCACTTCTTTGCTAGCCAGACTGCACAGCGCAAGAT  1715

Query 1722  CAGGGAAATTGTACAACAGGTGAAGCAGCAGGAGCAGAAATACCCTCAGGGAGTCGCCTCACAGCGCAGCAAG  1794
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1716  CAGGGAAATTGTACAACAGGTGAAGCAGCAGGAGCAGAAATACCCTCAGGGAGTCGCCTCACAGCGCAGCAAG  1788