Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10214
• Subject: XM_017015198.1
• Aligned Length: 1629
• Identities: 1530
• Gaps: 99

Alignment

Query    1  ---ATGTTTGGTGGCTATGAGACTATAGAAGCATACGAAGATGATCTTTATCGAGATGAGTCATCTAGTGAACT  71
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGTTTGGTGGCTATGAGACTATAGAAGCATACGAAGATGATCTTTATCGAGATGAGTCATCTAGTGAACT  74

Query   72  GAGTGTTGATAGTGAGGTGGAATTTCAACTCTATAGCCAAATTCATTATGCCCAAGATCTTGATGATGTCATCA  145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGTGTTGATAGTGAGGTGGAATTTCAACTCTATAGCCAAATTCATTATGCCCAAGATCTTGATGATGTCATCA  148

Query  146  GGGAGGAAGAGCATGAAGAAAAGAACTCTGGGAATTCGGAATCTTCGAGTAGTAAACCAAATCAGAAGAAGCTA  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGAGGAAGAGCATGAAGAAAAGAACTCTGGGAATTCGGAATCTTCGAGTAGTAAACCAAATCAGAAGAAGCTA  222

Query  220  ATCGTCCTTTCAGATAGTGAGGTCATCCAGCTGTCAGATGGGTCAGAGGTCATCACTTTGTCTGATGAAGACAG  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCGTCCTTTCAGATAGTGAGGTCATCCAGCTGTCAGATGGGTCAGAGGTCATCACTTTGTCTGATGAAGACAG  296

Query  294  TATTTATAGATGTAAAGGAAAGAATGTTAGAGTTCAAGCACAAGAAAATGCCCATGGTCTTTCTTCTTCTCTTC  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TATTTATAGATGTAAAGGAAAGAATGTTAGAGTTCAAGCACAAGAAAATGCCCATGGTCTTTCTTCTTCTCTTC  370

Query  368  AATCTAATGAGCTGGTTGATAAGAAATGCAAGAGTGATATTGAGAAGCCTAAATCTGAAGAGAGATCAGGTGTA  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATCTAATGAGCTGGTTGATAAGAAATGCAAGAGTGATATTGAGAAGCCTAAATCTGAAGAGAGATCAGGTGTA  444

Query  442  ATCCGAGAGGTCATGATTATAGAGGTCAGTTCAAGTGAAGAGGAAGAGAGCACCATTTCAGAAGGTGATAATGT  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATCCGAGAGGTCATGATTATAGAGGTCAGTTCAAGTGAAGAGGAAGAGAGCACCATTTCAGAAGGTGATAATGT  518

Query  516  GGAAAGCTGGATGCTACTGGGATGTGAAGTAGATGATAAAGATGATGATATCCTTCTCAACCTTGTGGGATGTG  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAAAGCTGGATGCTACTGGGATGTGAAGTAGATGATAAAGATGATGATATCCTTCTCAACCTTGTGGGATGTG  592

Query  590  AAAACTCTGTTACTGAAGGAGAAGATGGTATAAACTGGTCCATCAGTGACAAAGACATTGAGGCCCAGATAGCT  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAACTCTGTTACTGAAGGAGAAGATGGTATAAACTGGTCCATCAGTGACAAAGACATTGAGGCCCAGATAGCT  666

Query  664  AATAACCGAACACCTGGAAGATGGACCCAGCGGTACTATTCAGCCAACAAAAACATTATCTGTAGAAATTGTGA  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATAACCGAACACCTGGAAGATGGACCCAGCGGTACTATTCAGCCAACAAAAACATTATCTGTAGAAATTGTGA  740

Query  738  CAAACGTGGTCATTTATCAAAAAACTGCCCCTTACCACGAAAAGTTCGTCGCTGCTTCCTGTGCTCCAGGAGAG  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAACGTGGTCATTTATCAAAAAACTGCCCCTTACCACGAAAAGTTCGTCGCTGCTTCCTGTGCTCCAGGAGAG  814

Query  812  GACATCTCCTGTATTCCTGTCCAGCCCCCCTTTGCGAATACTGTCCTGTGCCTAAGATGTTGGACCACTCATGT  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GACATCTCCTGTATTCCTGTCCAGCCCCCCTTTGCGAATACTGTCCTGTGCCTAAGATGTTGGACCACTCATGT  888

Query  886  CTTTTCAGACATTCCTGGGATAAACAGTGTGACCGATGTCATATGCTAGGCCACTATACAGATGCTTGCACAGA  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTTTCAGACATTCCTGGGATAAACAGTGTGACCGATGTCATATGCTAGGCCACTATACAGATGCTTGCACAGA  962

Query  960  AATCTGGAGGCAGTATCACCTAACGACCAAACCTGGACCACCCAAAAAGCCGAAGACCCCTTCAAGACCATCAG  1033
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  963  AATCTGGAGGCAGTATCACCTAACG-------------------------------------------------  987

Query 1034  CCTTAGCATATTGCTATCACTGCGCGCAAAAAGGCCATTATGGACACGAATGTCCAGAAAGAGAAGTGTATGAC  1107
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  988  -----------------------------------------------GAATGTCCAGAAAGAGAAGTGTATGAC  1014

Query 1108  CCGTCTCCAGTATCTCCATTCATCTGCTACTATGATGACAAATATGAAATTCAGGAGAGAGAAAAGAGACTAAA  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  CCGTCTCCAGTATCTCCATTCATCTGCTACTATGATGACAAATATGAAATTCAGGAGAGAGAAAAGAGACTAAA  1088

Query 1182  ACAAAAAATAAAAGTACTCAAGAAAAATGGGGTTATCCCAGAGCCATCCAAGCTACCTTATATAAAAGCAGCAA  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  ACAAAAAATAAAAGTACTCAAGAAAAATGGGGTTATCCCAGAGCCATCCAAGCTACCTTATATAAAAGCAGCAA  1162

Query 1256  ATGAGAACCCCCACCATGATATAAGGAAGGGCCGTGCCTCATGGAAAAGCAACAGGTGGCCTCAAGAAAATAAA  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  ATGAGAACCCCCACCATGATATAAGGAAGGGCCGTGCCTCATGGAAAAGCAACAGGTGGCCTCAAGAAAATAAA  1236

Query 1330  GAAACACAAAAAGAAATGAAGAACAAGAATAGAAACTGGGAGAAGCACAGGAAGGCTGACAGACATCGTGAAGT  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  GAAACACAAAAAGAAATGAAGAACAAGAATAGAAACTGGGAGAAGCACAGGAAGGCTGACAGACATCGTGAAGT  1310

Query 1404  GGATGAGGATTTTCCCAGGGGCCCCAAAACCTACTCTTCTCCTGGCAGTTTTAAAACCCAGAAGCCTTCTAAGC  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  GGATGAGGATTTTCCCAGGGGCCCCAAAACCTACTCTTCTCCTGGCAGTTTTAAAACCCAGAAGCCTTCTAAGC  1384

Query 1478  CCTTTCACCGTTCATCACATTACCACACGTCAAGAGAAGACAAGTCTCCCAAGGAAGGCAAGAGGGGCAAGCAG  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385  CCTTTCACCGTTCATCACATTACCACACGTCAAGAGAAGACAAGTCTCCCAAGGAAGGCAAGAGGGGCAAGCAG  1458

Query 1552  AAGAAAAAGGAGAGGTGCTGGGAAGATGATGACAATGATAACTTATTTCTTATTAAGCAGAGAAAAAAAAAGTC  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459  AAGAAAAAGGAGAGGTGCTGGGAAGATGATGACAATGATAACTTATTTCTTATTAAGCAGAGAAAAAAAAAGTC  1532

Query 1626  T  1626
            |
Sbjct 1533  T  1533