Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_10279
Subject:
NM_001001877.1
Aligned Length:
649
Identities:
573
Gaps:
47

Alignment

Query   1  ATGGCACATGTTTCTTCAGAAACTCAAGATGTTTCCCCCAAAGATGAATTAACTGCTTCAGAAGCCTCCACTAG  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCACATGTTTCTTCAGAAACTCAAGATGTTTCCCCCAAAGATGAATTAACTGCTTCAGAAGCCTCCACTAG  74

Query  75  GTCTCCATTGTGTGAACACACCTTCCCTGGGGACTCAGACTTACGGTCAATGATTGAAGAACATGCTTTTCAGG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GTCTCCATTGTGTGAACACACCTTCCCTGGGGACTCAGACTTACGGTCAATGATTGAAGAACATGCTTTTCAGG  148

Query 149  TTTTGTCACAAGGATCCTTGTTAGAAAGTCCAAGTTACACAGTTTGTGTCTCTGAGCCAGATAAAGATGATGAT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TTTTGTCACAAGGATCCTTGTTAGAAAGTCCAAGTTACACAGTTTGTGTCTCTGAGCCAGATAAAGATGATGAT  222

Query 223  TTTCTTTCTCTGAACTTTCCCAGGAAACTTTGGAAAATAGTGGAAAGTGACCAATTCAAGTCTATTTCATGGGA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  TTTCTTTCTCTGAACTTTCCCAGGAAACTTTGGAAAATAGTGGAAAGTGACCAATTCAAGTCTATTTCATGGGA  296

Query 297  TGAGAATGGAACTTGCATAGTGATTAATGAAGAACTCTTCAAGAAAGAAATTTTGGAAACAAAGGCTCCTTACA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TGAGAATGGAACTTGCATAGTGATTAATGAAGAACTCTTCAAGAAAGAAATTTTGGAAACAAAGGCTCCTTACA  370

Query 371  GAATATTTCAAACTGATGCTATCAAAAGTTTTGTTCGACAGCTCAACCTTTATGGATTTAGTAAAATTCAACAG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  GAATATTTCAAACTGATGCTATCAAAAGTTTTGTTCGACAGCTCAACCTTTATGGATTTAGTAAAATTCAACAG  444

Query 445  AATTTTCAAAGATCTGCCTTTCTAGCCACCTTTCTGTCAGAAGAGAAAGAATCGTCTGTCTTAAGCAAGCTTCA  518
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.| 
Sbjct 445  AATTTTCAAAGATCTGCCTTTCTAGCCACCTTTCTGTCAGAAGAGAAAGAATCGTCTGTCTTAAGCAAGATAC-  517

Query 519  TGTCTTTGTGTTTCACCACAGTCTATTTGGAGCAACATTCGGAGAACATCACTTT-------CAGCCATGCCCT  585
                    |.|||||||.|.|         |.|||.||| .|||.|.|||..||       |||..||    |
Sbjct 518  ---------GCTTCACCAAAAT---------GAAACTTTC-CAGATCTTCAACTTATGAAAACAGGTAT----T  568

Query 586  TTACCATCTGGTAACAAGGCTCCCATTTCTACTTGGAGTGGAGATTCCTGGTTGCTG  642
           |    ||.|.|.||     ||..|||||..|....||||.|| |||.||..      
Sbjct 569  T----ATGTTGCAA-----CTTACATTTAAAAGATGAGTCGA-ATTACTCA------  609