Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10432
• Subject: XM_017320829.1
• Aligned Length: 1426
• Identities: 1270
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGACTACTATCTTGACTTACCCCTTTAAAAATCTT-CCCACTGCATCAAAATGGGCCCTCAGATTTTCCATAA  73
            ||||||||.|||||||||| ||.||||.|.||.||| .|.|||.|||||||||||||.|||||||.|||.||||
Sbjct    1  ATGACTACCATCTTGACTT-CCACTTTTAGAAACTTGTCAACTACATCAAAATGGGCTCTCAGATCTTCTATAA  73

Query   74  GACCTCTGAGCTGTTCCTCCCAGCTACGAGCTGCCCCAGCTGTCCAGACCAAAACGAAGAAGACGTTAGCCAAA  147
            ||||||||||||||||.|||||.||.|...||||||||||||||||||||||..|.||||||||.|||||.|||
Sbjct   74  GACCTCTGAGCTGTTCTTCCCAACTGCACTCTGCCCCAGCTGTCCAGACCAAGTCAAAGAAGACTTTAGCAAAA  147

Query  148  CCCAATATAAGGAATGTTGTGGTGGTGGATGGTGTTCGCACTCCATTTTTGCTGTCTGGCACTTCATATAAAGA  221
            ||||||||.|.||||.|||||||||||||.||.||.||||.|||||||.|||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  148  CCCAATATGAAGAATATTGTGGTGGTGGAAGGGGTCCGCATTCCATTTCTGCTGTCAGGCACTTCGTATAAAGA  221

Query  222  CCTGATGCCACATGATTTGGCTAGAGCAGCGCTTACGGGTTTGTTGCATCGGACCAGTGTCCCTAAGGAAGTAG  295
            |||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||.|.|.||.|||||.||.|
Sbjct  222  CCTAATGCCACATGACTTGGCTAGAGCTGCACTTTCGGGTTTGTTGCATCGGACCAATATTCCAAAGGATGTTG  295

Query  296  TTGATTATATCATCTTTGGTACAGTTATTCAGGAAGTGAAAACAAGCAATGTGGCTAGAGAGGCTGCCCTTGGA  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  296  TTGATTATATCATCTTTGGTACAGTTATTCAGGAAGTGAAAACAAGCAATGTGGCTAGAGAGGCTGCCCTGGGA  369

Query  370  GCTGGCTTCTCTGACAAGACTCCTGCTCACACTGTCACCATGGCTTGTATCTCTGCCAACCAAGCCATGACCAC  443
            ||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||
Sbjct  370  GCTGGCTTCTCTGATAAGACTCCAGCTCACACTGTCACCATGGCTTGTATCTCTTCAAACCAAGCCATGACCAC  443

Query  444  AGGTGTTGGCTTGATTGCTTCTGGCCAGTGTGATGTGATCGTGGCAGGTGGTGTTGAGTTGATGTCCGATGTCC  517
            ||.||||||..||||.||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  444  AGCTGTTGGTCTGATAGCTTCTGGCCAGTGTGATGTCGTCGTGGCTGGTGGTGTTGAGTTAATGTCTGATGTCC  517

Query  518  CTATTCGTCACTCAAGGAAAATGAGAAAACTGATGCTTGATCTCAATAAGGCCAAATCTATGGGCCAGCGACTG  591
            ||||||||||.|||||.||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||..||.||||||||||.|||
Sbjct  518  CTATTCGTCATTCAAGAAATATGAGGAAAATGATGCTTGATCTCAATAAAGCCAAGACTCTGGGCCAGCGCCTG  591

Query  592  TCTTTAATCTCTAAATTCCGATTTAATTTCCTAGCACCTGAGCTCCCTGCGGTTTCTGAGTTCTCCACCAGTGA  665
            ||.|||.||..|||||||.||||.|||||.||..|.||||||||||||||.||..|||||||||||||.|.|||
Sbjct  592  TCCTTACTCAGTAAATTCAGATTGAATTTTCTGTCCCCTGAGCTCCCTGCAGTGGCTGAGTTCTCCACTAATGA  665

Query  666  GACCATGGGCCACTCTGCAGACCGACTGGCCGCTGCCTTTGCTGTTTCTCGGCTGGAACAGGATGAATATGCAC  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct  666  GACCATGGGCCACTCTGCAGACCGACTGGCTGCTGCCTTTGCTGTTTCTCGAATGGAACAGGATGAATATGCAC  739

Query  740  TGCGCTCTCACAGTCTAGCCAAGAAGGCACAGGATGAAGGACTCCTTTCTGATGTGGTACCCTTCAAAGTACCA  813
            ||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct  740  TGCGTTCTCATAGTCTGGCCAAGAAGGCACAGGATGAAGGACACCTTTCTGATATTGTACCCTTCAAAGTACCA  813

Query  814  GGAAAAGATACAGTTACCAAAGATAATGGCATCCGTCCTTCCTCACTGGAGCAGATGGCCAAACTAAAACCTGC  887
            |||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  814  GGAAAGGACACAGTTACCAAAGATAATGGGATCCGTCCTTCCTCACTGGAGCAAATGGCCAAACTAAAACCTGC  887

Query  888  ATTCATCAAGCCCTACGGCACAGTGACAGCTGCAAATTCTTCTTTCTTGACTGATGGTGCATCTGCAATGTTAA  961
            .||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||.|||||.|||.|||
Sbjct  888  GTTCATCAAACCCTATGGCACAGTGACAGCTGCAAATTCTTCTTTCCTGACTGATGGCGCTTCTGCGATGCTAA  961

Query  962  TCATGGCGGAGGAAAAGGCTCTGGCCATGGGTTATAAGCCGAAGGCATATTTGAGGGATTTTATGTATGTGTCT  1035
            |||||.|.|||||.|..||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  962  TCATGTCAGAGGACAGAGCTCTGGCCATGGGTTATAAACCAAAGGCATATTTGAGGGATTTTATATATGTGTCC  1035

Query 1036  CAGGATCCAAAAGATCAACTATTACTTGGACCAACATATGCTACTCCAAAAGTTCTAGAAAAGGCAGGATTGAC  1109
            ||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||
Sbjct 1036  CAGGATCCGAAAGATCAGCTTTTACTCGGACCAACATATGCTACTCCAAAAGTTTTAGAAAAGGCAGGGTTAAC  1109

Query 1110  CATGAATGATATTGATGCTTTTGAATTTCATGAAGCTTTCTCGGGTCAGATTTTGGCAAATTTTAAAGCCATGG  1183
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 1110  CATGAATGATATCGATGCTTTTGAATTTCATGAAGCCTTCTCAGGCCAGATTTTAGCTAACTTTAAAGCCATGG  1183

Query 1184  ATTCTGATTGGTTTGCAGAAAACTACATGGGTAGAAAAACCAAGGTTGGATTGCCTCCTTTGGAGAAGTTTAAT  1257
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||..||||||.||||||||||||||
Sbjct 1184  ATTCTGATTGGTTTGCACAAAACTACATGGGTAGGAAAACCAAGGTTGGATCACCTCCTCTGGAGAAGTTTAAT  1257

Query 1258  AACTGGGGTGGATCTCTGTCCCTGGGACACCCATTTGGAGCCACTGGCTGCAGGTTGGTCATGGCTGCTGCCAA  1331
            |.||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||..||.||||||||||.||||||||
Sbjct 1258  ATCTGGGGCGGATCACTGTCTCTGGGGCACCCTTTTGGAGCCACTGGCTGTCGGCTGGTCATGGCAGCTGCCAA  1331

Query 1332  CAGATTACGGAAAGAAGGAGGCCAGTATGGCTTAGTGGCTGCGTGTGCAGCTGGAGGGCAGGGCCATGCTATGA  1405
            ||||.|..||||.||.|||||||||||||..|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1332  CAGACTGAGGAAGGATGGAGGCCAGTATGCTTTAGTGGCTGCCTGTGCAGCTGGAGGACAGGGTCATGCTATGA  1405

Query 1406  TAGTGGAAGCTTATCCAAAA  1425
            |.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1406  TTGTGGAAGCTTACCCCAAA  1425