Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10432
• Subject: XM_024452830.1
• Aligned Length: 1442
• Identities: 1375
• Gaps: 67

Alignment

Query    1  ATGACTACTATCTTGACTTACCCCTTTAAAAATCTTCCCACTGCATCAAAATGGGCCCTCAGATTTT-------  67
                                                              |||||||||||||||||       
Sbjct    1  --------------------------------------------------ATGGGCCCTCAGATTTTTTTATTT  24

Query   68  ----------CCATAAGACCTCTGAGCTGTTCCTCCCAGCTACGAGCTGCCCCAGCTGTCCAGACCAAAACGAA  131
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   25  TGTCTTCCAGCCATAAGACCTCTGAGCTGTTCCTCCCAGCTACGAGCTGCCCCAGCTGTCCAGACCAAAACGAA  98

Query  132  GAAGACGTTAGCCAAACCCAATATAAGGAATGTTGTGGTGGTGGATGGTGTTCGCACTCCATTTTTGCTGTCTG  205
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   99  GAAGACGTTAGCCAAACCCAATATAAGGAATGTTGTGGTGGTGGATGGTGTTCGCACTCCATTTTTGCTGTCTG  172

Query  206  GCACTTCATATAAAGACCTGATGCCACATGATTTGGCTAGAGCAGCGCTTACGGGTTTGTTGCATCGGACCAGT  279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  173  GCACTTCATATAAAGACCTGATGCCACATGATTTGGCTAGAGCAGCGCTTACGGGTTTGTTGCATCGGACCAGT  246

Query  280  GTCCCTAAGGAAGTAGTTGATTATATCATCTTTGGTACAGTTATTCAGGAAGTGAAAACAAGCAATGTGGCTAG  353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  247  GTCCCTAAGGAAGTAGTTGATTATATCATCTTTGGTACAGTTATTCAGGAAGTGAAAACAAGCAATGTGGCTAG  320

Query  354  AGAGGCTGCCCTTGGAGCTGGCTTCTCTGACAAGACTCCTGCTCACACTGTCACCATGGCTTGTATCTCTGCCA  427
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  321  AGAGGCTGCCCTTGGAGCTGGCTTCTCTGACAAGACTCCTGCTCACACTGTCACCATGGCTTGTATCTCTGCCA  394

Query  428  ACCAAGCCATGACCACAGGTGTTGGCTTGATTGCTTCTGGCCAGTGTGATGTGATCGTGGCAGGTGGTGTTGAG  501
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  395  ACCAAGCCATGACCACAGGTGTTGGCTTGATTGCTTCTGGCCAGTGTGATGTGATCGTGGCAGGTGGTGTTGAG  468

Query  502  TTGATGTCCGATGTCCCTATTCGTCACTCAAGGAAAATGAGAAAACTGATGCTTGATCTCAATAAGGCCAAATC  575
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  469  TTGATGTCCGATGTCCCTATTCGTCACTCAAGGAAAATGAGAAAACTGATGCTTGATCTCAATAAGGCCAAATC  542

Query  576  TATGGGCCAGCGACTGTCTTTAATCTCTAAATTCCGATTTAATTTCCTAGCACCTGAGCTCCCTGCGGTTTCTG  649
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  543  TATGGGCCAGCGACTGTCTTTAATCTCTAAATTCCGATTTAATTTCCTAGCACCTGAGCTCCCTGCGGTTTCTG  616

Query  650  AGTTCTCCACCAGTGAGACCATGGGCCACTCTGCAGACCGACTGGCCGCTGCCTTTGCTGTTTCTCGGCTGGAA  723
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  617  AGTTCTCCACCAGTGAGACCATGGGCCACTCTGCAGACCGACTGGCCGCTGCCTTTGCTGTTTCTCGGCTGGAA  690

Query  724  CAGGATGAATATGCACTGCGCTCTCACAGTCTAGCCAAGAAGGCACAGGATGAAGGACTCCTTTCTGATGTGGT  797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  691  CAGGATGAATATGCACTGCGCTCTCACAGTCTAGCCAAGAAGGCACAGGATGAAGGACTCCTTTCTGATGTGGT  764

Query  798  ACCCTTCAAAGTACCAGGAAAAGATACAGTTACCAAAGATAATGGCATCCGTCCTTCCTCACTGGAGCAGATGG  871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  765  ACCCTTCAAAGTACCAGGAAAAGATACAGTTACCAAAGATAATGGCATCCGTCCTTCCTCACTGGAGCAGATGG  838

Query  872  CCAAACTAAAACCTGCATTCATCAAGCCCTACGGCACAGTGACAGCTGCAAATTCTTCTTTCTTGACTGATGGT  945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  839  CCAAACTAAAACCTGCATTCATCAAGCCCTACGGCACAGTGACAGCTGCAAATTCTTCTTTCTTGACTGATGGT  912

Query  946  GCATCTGCAATGTTAATCATGGCGGAGGAAAAGGCTCTGGCCATGGGTTATAAGCCGAAGGCATATTTGAGGGA  1019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  913  GCATCTGCAATGTTAATCATGGCGGAGGAAAAGGCTCTGGCCATGGGTTATAAGCCGAAGGCATATTTGAGGGA  986

Query 1020  TTTTATGTATGTGTCTCAGGATCCAAAAGATCAACTATTACTTGGACCAACATATGCTACTCCAAAAGTTCTAG  1093
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  987  TTTTATGTATGTGTCTCAGGATCCAAAAGATCAACTATTACTTGGACCAACATATGCTACTCCAAAAGTTCTAG  1060

Query 1094  AAAAGGCAGGATTGACCATGAATGATATTGATGCTTTTGAATTTCATGAAGCTTTCTCGGGTCAGATTTTGGCA  1167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1061  AAAAGGCAGGATTGACCATGAATGATATTGATGCTTTTGAATTTCATGAAGCTTTCTCGGGTCAGATTTTGGCA  1134

Query 1168  AATTTTAAAGCCATGGATTCTGATTGGTTTGCAGAAAACTACATGGGTAGAAAAACCAAGGTTGGATTGCCTCC  1241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135  AATTTTAAAGCCATGGATTCTGATTGGTTTGCAGAAAACTACATGGGTAGAAAAACCAAGGTTGGATTGCCTCC  1208

Query 1242  TTTGGAGAAGTTTAATAACTGGGGTGGATCTCTGTCCCTGGGACACCCATTTGGAGCCACTGGCTGCAGGTTGG  1315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1209  TTTGGAGAAGTTTAATAACTGGGGTGGATCTCTGTCCCTGGGACACCCATTTGGAGCCACTGGCTGCAGGTTGG  1282

Query 1316  TCATGGCTGCTGCCAACAGATTACGGAAAGAAGGAGGCCAGTATGGCTTAGTGGCTGCGTGTGCAGCTGGAGGG  1389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1283  TCATGGCTGCTGCCAACAGATTACGGAAAGAAGGAGGCCAGTATGGCTTAGTGGCTGCGTGTGCAGCTGGAGGG  1356

Query 1390  CAGGGCCATGCTATGATAGTGGAAGCTTATCCAAAA  1425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1357  CAGGGCCATGCTATGATAGTGGAAGCTTATCCAAAA  1392