Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10441
• Subject: NM_001166057.2
• Aligned Length: 1479
• Identities: 1284
• Gaps: 192

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGGCCACCTGACCCTCGTTTTGGCTGGGGAATGAAACCCTGAAGGTGCCGCTGGCGCTCTTTGCCTT  74
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGGCCACCGGACCCTCGTTTTGGCTGGGGAATGAAACCCTGAAGGTGCCGCTGGCGCTCTTTGCCTT  74

Query   75  GAACCGGCAGCGCCTGTGTGAGCGGCTGCGGAAGAACCCTGCTGTGCAGGCCGGCTCCATCGTGGTCCTGCAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAACCGGCAGCGCCTGTGTGAGCGGCTGCGGAAGAACCCTGCTGTGCAGGCCGGCTCCATCGTGGTCCTGCAGG  148

Query  149  GCGGGGAGGAGACTCAGCGCTACTGCACCGACACCGGGGTCCTCTTCCGCCAGGAGTCCTTCTTTCACTGGGCG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct  149  GCGGGGAGGAGACTCAGCGCTACTGCACCGACACCGGGGTCCTCTTCCGCC-----------------------  199

Query  223  TTCGGTGTCACTGAGCCAGGCTGCTATGGTGTCATCGATGTTGACACTGGGAAGTCGACCCTGTTTGTGCCCAG  296
                                                                                      
Sbjct  200  --------------------------------------------------------------------------  199

Query  297  GCTTCCTGCCAGCCATGCCACCTGGATGGGAAAGATCCATTCCAAGGAGCACTTCAAGGAGAAGTATGCCGTGG  370
                                                                                      
Sbjct  200  --------------------------------------------------------------------------  199

Query  371  ACGACGTCCAGTACGTAGATGAGATTGCCAGCGTCCTGACGTCACAGAAGCCCTCTGTCCTCCTCACTTTGCGT  444
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  200  ---------------------AGATTGCCAGCGTCCTGACGTCACAGAAGCCCTCTGTCCTCCTCACTTTGCGT  252

Query  445  GGCGTCAACACGGACAGCGGCAGTGTCTGCAGGGAGGCCTCCTTTGACGGCATCAGCAAGTTCGAAGTCAACAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  253  GGCGTCAACACGGACAGCGGCAGTGTCTGCAGGGAGGCCTCCTTTGACGGCATCAGCAAGTTCGAAGTCAACAA  326

Query  519  TACCATTCTTCACCCAGAGATCGTTGAGTGCCGAGTGTTTAAGACGGATATGGAGCTGGAGGTTCTGCGCTATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  327  TACCATTCTTCACCCAGAGATCGTTGAGTGCCGAGTGTTTAAGACGGATATGGAGCTGGAGGTTCTGCGCTATA  400

Query  593  CCAATAAAATCTCCAGCGAGGCCCACCGTGAGGTAATGAAGGCTGTAAAAGTGGGAATGAAAGAATATGAGTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  401  CCAATAAAATCTCCAGCGAGGCCCACCGTGAGGTAATGAAGGCTGTAAAAGTGGGAATGAAAGAATATGAGTTG  474

Query  667  GAAAGCCTCTTCGAGCACTACTGCTACTCCCGGGGCGGCATGCGCCACAGCTCCTACACCTGCATCTGCGGCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  475  GAAAGCCTCTTCGAGCACTACTGCTACTCCCGGGGCGGCATGCGCCACAGCTCCTACACCTGCATCTGCGGCAG  548

Query  741  TGGTGAGAACTCAGCCGTGCTACACTACGGACACGCCGGAGCTCCCAACGACCGAACGATCCAGAATGGGGATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  549  TGGTGAGAACTCAGCCGTGCTACACTACGGACACGCCGGAGCTCCCAACGACCGAACGATCCAGAATGGGGATA  622

Query  815  TGTGCCTGTTCGACATGGGCGGTGAGTATTACTGCTTCGCTTCCGACATCACCTGCTCCTTTCCCGCCAACGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  623  TGTGCCTGTTCGACATGGGCGGTGAGTATTACTGCTTCGCTTCCGACATCACCTGCTCCTTTCCCGCCAACGGC  696

Query  889  AAGTTCACTGCAGACCAGAAGGCCGTCTATGAGGCAGTGCTGCGGAGCTCCCGTGCCGTCATGGGTGCCATGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  697  AAGTTCACTGCAGACCAGAAGGCCGTCTATGAGGCAGTGCTGCGGAGCTCCCGTGCCGTCATGGGTGCCATGAA  770

Query  963  GCCAGGTGTCTGGTGGCCTGACATGCACCGCCTGGCTGACCGCATCCACCTGGAGGAGCTGGCCCACATGGGCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  771  GCCAGGTGTCTGGTGGCCTGACATGCACCGCCTGGCTGACCGCATCCACCTGGAGGAGCTGGCCCACATGGGCA  844

Query 1037  TCCTGAGCGGCAGCGTGGACGCCATGGTCCAGGCTCACCTGGGGGCCGTGTTTATGCCTCACGGGCTTGGCCAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  845  TCCTGAGCGGCAGCGTGGACGCCATGGTCCAGGCTCACCTGGGGGCCGTGTTTATGCCTCACGGGCTTGGCCAC  918

Query 1111  TTCCTGGGCATTGACGTGCACGACGTGGGAGGCTACCCAGAGGGCGTGGAGCGCATCGACGAGCCCGGCCTGCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  919  TTCCTGGGCATTGACGTGCACGACGTGGGAGGCTACCCAGAGGGCGTGGAGCGCATCGACGAGCCCGGCCTGCG  992

Query 1185  GAGCCTGCGCACTGCACGGCACCTGCAGCCAGGCATGGTGCTCACCGTGGAGCCGGGCATCTACTTCATCGACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  993  GAGCCTGCGCACTGCACGGCACCTGCAGCCAGGCATGGTGCTCACCGTGGAGCCGGGCATCTACTTCATCGACC  1066

Query 1259  ACCTCCTGGATGAGGCCCTGGCGGACCCGGCCCGCGCCTCCTTCTTTAACCGCGAGGTCCTGCAGCGCTTTCGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1067  ACCTCCTGGATGAGGCCCTGGCGGACCCGGCCCGCGCCTCCTTCCTTAACCGCGAGGTCCTGCAGCGCTTTCGC  1140

Query 1333  GGTTTTGGCGGGGTCCGCATCGAGGAGGACGTCGTGGTGACTGACAGCGGCATAGAGCTGCTGACCTGCGTGCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141  GGTTTTGGCGGGGTCCGCATCGAGGAGGACGTCGTGGTGACTGACAGCGGCATAGAGCTGCTGACCTGCGTGCC  1214

Query 1407  CCGCACTGTGGAAGAGATTGAAGCATGCATGGCAGGCTGTGACAAGGCCTTTACCCCCTTCTCTGGCCCCCAG  1479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1215  CCGCACTGTGGAAGAGATTGAAGCATGCATGGCAGGCTGTGACAAGGCCTTTACCCCCTTCTCTGGCCCCAAG  1287