Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10463
- Subject:
- NR_047673.1
- Aligned Length:
- 3127
- Identities:
- 1907
- Gaps:
- 1219
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GGAGTTTGGAGGGGAGAGGGGAAGGTGGCTGGCCGGGTGGCTGAAATCAAAAATTCAATTGCGCACTGGGTTGT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GATGAGAAATCTAATCAGATCTTTGGCGAAGGGGCCGGCCGGAAGGATGGAGAGTGGGGGGGAAGTTGCTCCCC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AAATTCTTCGAAGGGGAGGCTGGGGAGAGGAATTGACCATGTAAAAGGAGACTTTTTTTTTTGGTGGTGGTGGC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TGTTGGGTGCCTTGCAAAAATGAAGGATGCAGGACGCAGCTTTCTCCTGGAACCGAACGCAATGGATAAACTGA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TTGTGCAAGAGAGAAGGAAGAACGAAGCTTTTTCTTGTGAGCCCTGGATCTTAACACAAATGTGTATATGTGCA 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 CACAGGGAGCATTCAAGAATGAAATAAACCAGAGTTAGACCCGCGGGGGTTGGTGTGTTCTGACATAAATAAAT 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 AATCTTAAAGCAGCTGTTCCCCTCCCCCCCCCCAAAAAAAAGGATGATTGGAAATGAAGAACCGAGGATTCACA 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 AAGAAAAAAGTATGTTCATTTTTCTCTATAAAGGAGAAAGTGAGCCAAGGAGATATTTTTGGAATGAAAAGTTT 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 GGGGCTTTTTTAGTAAAGTAAAGAACTGGTGTGGTGGTGTTTTCTTTTCTTTTTGAATTTCCCACAAGAGGAGA 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 GGAAATTAATAATACATCTGCAAAGAAATTTCAGAGAAGAAAAGTTGACCGCGGCAGATTGAGGCATTGATTGG 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 GGGAGAGAAACCAGCAGAGCACAGTTGGATTTGTGCCTATGTTGACTAAAATTGACGGATAATTGCAGTTGGAT 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 TTTTCTTCATCAACCTCCTTTTTTTTTAATTTTTATTCCTTTTGGTATCAAGATCATGCGTTTTCTCTTGTTCT 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 TAACCACCTGGATTTCCATCTGGATGTTGCTGTGATCAGTCTGAAATACAATTGGCAAACGCACTGCCTACTTA 962
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 963 CAGCATAGAGACCCCCAGTGGAGAGCTAGACTGTTTGAATTCCAGAAGGACCAACACCAGATAAATTATGAATG 1036
Query 1 ---------ATGACCTTACATCCACAGCAGATAATGATAGGTCCTAGGTTTAACAGGGCCCTATTTGACCCCCT 65
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTGAACAAGATGACCTTACATCCACAGCAGATAATGATAGGTCCTAGGTTTAACAGGGCCCTATTTGACCCCCT 1110
Query 66 GCTTGTGGTGCTGCTGGCTCTTCAACTTCTTGTGGTGGCTGGTCTGGTGCGGGCTCAGACCTGCCCTTCTGTGT 139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCTTGTGGTGCTGCTGGCTCTTCAACTTCTTGTGGTGGCTGGTCTGGTGCGGGCTCAGACCTGCCCTTCTGTGT 1184
Query 140 GCTCCTGCAGCAACCAGTTCAGCAAGGTGATTTGTGTTCGGAAAAACCTGCGTGAGGTTCCGGATGGCATCTCC 213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCTCCTGCAGCAACCAGTTCAGCAAGGTGATTTGTGTTCGGAAAAACCTGCGTGAGGTTCCGGATGGCATCTCC 1258
Query 214 ACCAACACACGGCTGCTGAACCTCCATGAGAACCAAATCCAGATCATCAAAGTGAACAGCTTCAAGCACTTGAG 287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACCAACACACGGCTGCTGAACCTCCATGAGAACCAAATCCAGATCATCAAAGTGAACAGCTTCAAGCACTTGAG 1332
Query 288 ACACTTGGAAATCCTACAGTTGAGTAGGAACCATATCAGAACCATTGAAATTGGGGCTTTCAATGGTCTGGCGA 361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACACTTGGAAATCCTACAGTTGAGTAGGAACCATATCAGAACCATTGAAATTGGGGCTTTCAATGGTCTGGCGA 1406
Query 362 ACCTCAACACTCTGGAACTCTTTGACAATCGTCTTACTACCATCCCGAATGGAGCTTTTGTATACTTGTCTAAA 435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ACCTCAACACTCTGGAACTCTTTGACAATCGTCTTACTACCATCCCGAATGGAGCTTTTGTATACTTGTCTAAA 1480
Query 436 CTGAAGGAGCTCTGGTTGCGAAACAACCCCATTGAAAGCATCCCTTCTTATGCTTTTAACAGAATTCCTTCTTT 509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTGAAGGAGCTCTGGTTGCGAAACAACCCCATTGAAAGCATCCCTTCTTATGCTTTTAACAGAATTCCTTCTTT 1554
Query 510 GCGCCGACTAGACTTAGGGGAATTGAAAAGACTTTCATACATCTCAGAAGGTGCCTTTGAAGGTCTGTCCAACT 583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCGCCGACTAGACTTAGGGGAATTGAAAAGACTTTCATACATCTCAGAAGGTGCCTTTGAAGGTCTGTCCAACT 1628
Query 584 TGAGGTATTTGAACCTTGCCATGTGCAACCTTCGGGAAATCCCTAACCTCACACCGCTCATAAAACTAGATGAG 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGAGGTATTTGAACCTTGCCATGTGCAACCTTCGGGAAATCCCTAACCTCACACCGCTCATAAAACTAGATGAG 1702
Query 658 CTGGATCTTTCTGGGAATCATTTATCTGCCATCAGGCCTGGCTCTTTCCAGGGTTTGATGCACCTTCAAAAACT 731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CTGGATCTTTCTGGGAATCATTTATCTGCCATCAGGCCTGGCTCTTTCCAGGGTTTGATGCACCTTCAAAAACT 1776
Query 732 GTGGATGATACAGTCCCAGATTCAAGTGATTGAACGGAATGCCTTTGACAACCTTCAGTCACTAGTGGAGATCA 805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTGGATGATACAGTCCCAGATTCAAGTGATTGAACGGAATGCCTTTGACAACCTTCAGTCACTAGTGGAGATCA 1850
Query 806 ACCTGGCACACAATAATCTAACATTACTGCCTCATGACCTCTTCACTCCCTTGCATCATCTAGAGCGGATACAT 879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACCTGGCACACAATAATCTAACATTACTGCCTCATGACCTCTTCACTCCCTTGCATCATCTAGAGCGGATACAT 1924
Query 880 TTACATCACAACCCTTGGAACTGTAACTGTGACATACTGTGGCTCAGCTGGTGGATAAAAGACATGGCCCCGTC 953
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1925 TTACATCACAACCCTTGGAACTGTAACTGTGACATACTGTGGCTCAGCTGGTGGATAAAAGACATGGCCCCCTC 1998
Query 954 GAACACAGCTTGTTGTGCCCGGTGTAACACTCCTCCCAATCTAAAGGGGAGGTACATTGGAGAGCTCGACCAGA 1027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GAACACAGCTTGTTGTGCCCGGTGTAACACTCCTCCCAATCTAAAGGGGAGGTACATTGGAGAGCTCGACCAGA 2072
Query 1028 ATTACTTCACATGCTATGCTCCGGTGATTGTGGAGCCCCCTGCAGACCTCAATGTCACTGAAGGCATGGCAGCT 1101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 ATTACTTCACATGCTATGCTCCGGTGATTGTGGAGCCCCCTGCAGACCTCAATGTCACTGAAGGCATGGCAGCT 2146
Query 1102 GAGCTGAAATGTCGGGCCTCCACATCCCTGACATCTGTATCTTGGATTACTCCAAATGGAACAGTCATGACACA 1175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GAGCTGAAATGTCGGGCCTCCACATCCCTGACATCTGTATCTTGGATTACTCCAAATGGAACAGTCATGACACA 2220
Query 1176 TGGGGCGTACAAAGTGCGGATAGCTGTGCTCAGTGATGGTACGTTAAATTTCACAAATGTAACTGTGCAAGATA 1249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TGGGGCGTACAAAGTGCGGATAGCTGTGCTCAGTGATGGTACGTTAAATTTCACAAATGTAACTGTGCAAGATA 2294
Query 1250 CAGGCATGTACACATGTATGGTGAGTAATTCCGTTGGGAATACTACTGCTTCAGCCACCCTGAATGTTACTGCA 1323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CAGGCATGTACACATGTATGGTGAGTAATTCCGTTGGGAATACTACTGCTTCAGCCACCCTGAATGTTACTGCA 2368
Query 1324 GCAACCACTACTCCTTTCTCTTACTTTTCAACCGTCACAGTAGAGACTATGGAACCGTCTCAGGATGAGGCACG 1397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GCAACCACTACTCCTTTCTCTTACTTTTCAACCGTCACAGTAGAGACTATGGAACCGTCTCAGGATGAGGCACG 2442
Query 1398 GACCACAGATAACAATGTGGGTCCCACTCCAGTGGTCGACTGGGAGACCACCAATGTGACCACCTCTCTCACAC 1471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GACCACAGATAACAATGTGGGTCCCACTCCAGTGGTCGACTGGGAGACCACCAATGTGACCACCTCTCTCACAC 2516
Query 1472 CACAGAGCACAAGGTCGACAGAGAAAACCTTCACCATCCCAGTGACTGATATAAACAGTGGGATCCCAGGAATT 1545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CACAGAGCACAAGGTCGACAGAGAAAACCTTCACCATCCCAGTGACTGATATAAACAGTGGGATCCCAGGAATT 2590
Query 1546 GATGAGGTCATGAAGACTACCAAAATCATCATTGGGTGTTTTGTGGCCATCACACTCATGGCTGCAGTGATGCT 1619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GATGAGGTCATGAAGACTACCAAAATCATCATTGGGTGTTTTGTGGCCATCACACTCATGGCTGCAGTGATGCT 2664
Query 1620 GGTCATTTTCTACAAGATGAGGAAGCAGCACCATCGGCAAAACCATCACGCCCCAACAAGGACTGTTGAAATTA 1693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GGTCATTTTCTACAAGATGAGGAAGCAGCACCATCGGCAAAACCATCACGCCCCAACAAGGACTGTTGAAATTA 2738
Query 1694 TTAATGTGGATGATGAGATTACGGGAGACACACCCATGGAAAGCCACCTGCCCATGCCTGCTATCGAGCATGAG 1767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TTAATGTGGATGATGAGATTACGGGAGACACACCCATGGAAAGCCACCTGCCCATGCCTGCTATCGAGCATGAG 2812
Query 1768 CACCTAAATCACTATAACTCATACAAATCTCCCTTCAACCACACAACAACAGTTAACACAATAAATTCAATACA 1841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CACCTAAATCACTATAACTCATACAAATCTCCCTTCAACCACACAACAACAGTTAACACAATAAATTCAATACA 2886
Query 1842 CAGTTCAGTGCATGAACCGTTATTGATCCGAATGAACTCTAAAGACAATGTACAAGAGACTCAAATC------- 1908
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 CAGTTCAGTGCATGAACCGTTATTGATCCGAATGAACTCTAAAGACAATGTACAAGAGACTCAAATCTAAAACA 2960
Query 1909 -------------------------------------------------------------------------- 1908
Sbjct 2961 TTTACAGAGTTACAAAAAACAAACAATCAAAAAAAAAGACAGTTTATTAAAAATGACACAAATGACTGGGCTAA 3034
Query 1909 -------------------------------------------------------------------------- 1908
Sbjct 3035 ATCTACTGTTTCAAAAAAGTGTCTTTACAAAAAAACAAAAAAGAAAAGAAATTTATTTATTAAAAATTCTATTG 3108
Query 1909 ------------------- 1908
Sbjct 3109 TGATCTAAAGCAGACAAAA 3127