Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10463
• Subject: XM_006499479.3
• Aligned Length: 1920
• Identities: 1777
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ------------ATGACCTTACATCCACAGCAGATAATGATAGGTCCTAGGTTTAACAGGGCCCTATTTGACCC  62
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTGAACAAGATGACCTTACATCCACAGCAGATAATGATAGGTCCTAGGTTTAACAGGGCCCTATTTGACCC  74

Query   63  CCTGCTTGTGGTGCTGCTGGCTCTTCAACTTCTTGTGGTGGCTGGTCTGGTGCGGGCTCAGACCTGCCCTTCTG  136
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  CCTGCTTGTGGTGCTGTTGGCTCTTCAACTTCTTGTGGTGGCTGGTTTGGTTCGTGCTCAAACCTGCCCTTCAG  148

Query  137  TGTGCTCCTGCAGCAACCAGTTCAGCAAGGTGATTTGTGTTCGGAAAAACCTGCGTGAGGTTCCGGATGGCATC  210
            |||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  TGTGCTCTTGTAGCAACCAGTTCAGCAAGGTGATTTGTGTTCGGAAAAACCTTCGTGAAGTTCCGGATGGCATC  222

Query  211  TCCACCAACACACGGCTGCTGAACCTCCATGAGAACCAAATCCAGATCATCAAAGTGAACAGCTTCAAGCACTT  284
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  TCCACCAACACAAGGCTGCTGAACCTCCATGAGAACCAAATCCAGATCATTAAAGTGAACAGCTTCAAGCATTT  296

Query  285  GAGACACTTGGAAATCCTACAGTTGAGTAGGAACCATATCAGAACCATTGAAATTGGGGCTTTCAATGGTCTGG  358
            |||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  297  GAGGCACTTAGAAATCCTCCAGTTGAGCAGGAACCATATTCGAACCATTGAAATCGGGGCCTTCAATGGTCTGG  370

Query  359  CGAACCTCAACACTCTGGAACTCTTTGACAATCGTCTTACTACCATCCCGAATGGAGCTTTTGTATACTTGTCT  432
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  CCAACCTCAACACCCTGGAACTCTTTGACAATCGTCTTACTACCATACCGAATGGAGCTTTTGTATATTTGTCT  444

Query  433  AAACTGAAGGAGCTCTGGTTGCGAAACAACCCCATTGAAAGCATCCCTTCTTATGCTTTTAACAGAATTCCTTC  506
            |||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  AAACTGAAGGAGCTCTGGTTGAGGAACAACCCTATTGAAAGCATCCCTTCCTATGCTTTTAACAGAATCCCTTC  518

Query  507  TTTGCGCCGACTAGACTTAGGGGAATTGAAAAGACTTTCATACATCTCAGAAGGTGCCTTTGAAGGTCTGTCCA  580
            |||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTGCGCCGCCTGGACTTAGGGGAATTGAAAAGGCTTTCATACATCTCAGAAGGTGCCTTTGAAGGTCTGTCCA  592

Query  581  ACTTGAGGTATTTGAACCTTGCCATGTGCAACCTTCGGGAAATCCCTAACCTCACACCGCTCATAAAACTAGAT  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.
Sbjct  593  ACTTGAGGTATTTGAACCTTGCCATGTGCAACCTTCGGGAAATCCCTAACCTCACACCACTCATCAAACTTGAC  666

Query  655  GAGCTGGATCTTTCTGGGAATCATTTATCTGCCATCAGGCCTGGCTCTTTCCAGGGTTTGATGCACCTTCAAAA  728
            |||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCTAGATCTTTCTGGGAACCATTTGTCTGCAATCAGGCCTGGCTCTTTTCAGGGGTTGATGCACCTTCAAAA  740

Query  729  ACTGTGGATGATACAGTCCCAGATTCAAGTGATTGAACGGAATGCCTTTGACAACCTTCAGTCACTAGTGGAGA  802
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACTGTGGATGATACAGTCTCAGATTCAAGTGATTGAACGGAATGCCTTTGATAACCTTCAGTCACTAGTGGAGA  814

Query  803  TCAACCTGGCACACAATAATCTAACATTACTGCCTCATGACCTCTTCACTCCCTTGCATCATCTAGAGCGGATA  876
            |.|||.||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  815  TAAACTTGGCACACAACAATCTAACATTATTGCCTCATGACCTCTTCACACCCTTGCATCATCTAGAGAGGATA  888

Query  877  CATTTACATCACAACCCTTGGAACTGTAACTGTGACATACTGTGGCTCAGCTGGTGGATAAAAGACATGGCCCC  950
            ||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  889  CACCTCCATCACAACCCGTGGAACTGTAACTGTGATATCCTGTGGCTCAGCTGGTGGATAAGAGACATGGCCCC  962

Query  951  GTCGAACACAGCTTGTTGTGCCCGGTGTAACACTCCTCCCAATCTAAAGGGGAGGTACATTGGAGAGCTCGACC  1024
            .||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  963  CTCCAACACAGCTTGCTGTGCCAGGTGTAACACTCCCCCCAACCTGAAAGGGAGGTACATCGGAGAGCTGGACC  1036

Query 1025  AGAATTACTTCACATGCTATGCTCCGGTGATTGTGGAGCCCCCTGCAGACCTCAATGTCACTGAAGGCATGGCA  1098
            ||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAATTACTTTACATGCTATGCTCCCGTAATTGTGGAGCCCCCTGCAGACCTCAATGTCACTGAAGGCATGGCA  1110

Query 1099  GCTGAGCTGAAATGTCGGGCCTCCACATCCCTGACATCTGTATCTTGGATTACTCCAAATGGAACAGTCATGAC  1172
            ||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTGAGCTGAAATGTCGGGCTTCTACGTCCCTGACTTCCGTATCTTGGATTACTCCAAATGGAACAGTCATGAC  1184

Query 1173  ACATGGGGCGTACAAAGTGCGGATAGCTGTGCTCAGTGATGGTACGTTAAATTTCACAAATGTAACTGTGCAAG  1246
            .||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCACGGGGCATACAAAGTGCGGATAGCTGTGCTCAGCGACGGTACTTTAAATTTCACAAATGTAACTGTGCAAG  1258

Query 1247  ATACAGGCATGTACACATGTATGGTGAGTAATTCCGTTGGGAATACTACTGCTTCAGCCACCCTGAATGTTACT  1320
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 1259  ACACAGGCATGTACACATGTATGGTGAGTAATTCTGTTGGCAACACCACTGCTTCTGCCACCTTGAATGTTACT  1332

Query 1321  GCAGCAACCACTACTCCTTTCTCTTACTTTTCAACCGTCACAGTAGAGACTATGGAACCGTCTCAGGATGAGGC  1394
            ||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1333  GCGGCAACCACTACTCCGTTCTCGTACTTTTCAACTGTAACAGTAGAGACTATGGAACCTTCTCAGGATGAGGC  1406

Query 1395  ACGGACCACAGATAACAATGTGGGTCCCACTCCAGTGGTCGACTGGGAGACCACCAATGTGACCACCTCTCTCA  1468
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1407  ACGGACCACAGATAACAATGTGGGCCCCACTCCAGTGATCGATTGGGAGACCACCAATGTAACCACATCTCTTA  1480

Query 1469  CACCACAGAGCACAAGGTCGACAGAGAAAACCTTCACCATCCCAGTGACTGATATAAACAGTGGGATCCCAGGA  1542
            |.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 1481  CGCCACAGAGCACAAGGTCGACAGAAAAAACATTCACCATCCCAGTAACTGACATCAACAGCGGAATCCCAGGA  1554

Query 1543  ATTGATGAGGTCATGAAGACTACCAAAATCATCATTGGGTGTTTTGTGGCCATCACACTCATGGCTGCAGTGAT  1616
            |||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1555  ATTGATGAGGTCATGAAAACAACTAAAATCATTATTGGGTGTTTTGTGGCCATCACACTCATGGCTGCCGTGAT  1628

Query 1617  GCTGGTCATTTTCTACAAGATGAGGAAGCAGCACCATCGGCAAAACCATCACGCCCCAACAAGGACTGTTGAAA  1690
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCTGGTCATTTTCTACAAGATGAGGAAACAGCACCATCGGCAAAACCACCATGCTCCAACAAGGACTGTTGAAA  1702

Query 1691  TTATTAATGTGGATGATGAGATTACGGGAGACACACCCATGGAAAGCCACCTGCCCATGCCTGCTATCGAGCAT  1764
            |.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1703  TCATTAACGTGGATGATGAGATCACTGGGGACACGCCCATGGAAAGCCACCTGCCCATGCCTGCGATTGAGCAT  1776

Query 1765  GAGCACCTAAATCACTATAACTCATACAAATCTCCCTTCAACCACACAACAACAGTTAACACAATAAATTCAAT  1838
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAGCACCTAAACCACTATAACTCTTACAAATCTCCCTTCAACCACACAACAACAGTAAACACAATAAATTCAAT  1850

Query 1839  ACACAGTTCAGTGCATGAACCGTTATTGATCCGAATGAACTCTAAAGACAATGTACAAGAGACTCAAATC  1908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1851  ACACAGTTCAGTGCATGAACCGTTATTGATCCGAATGAACTCTAAAGACAATGTACAAGAGACTCAGATA  1920