Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10476
- Subject:
- XM_006526287.3
- Aligned Length:
- 1351
- Identities:
- 1093
- Gaps:
- 41
Alignment
Query 1 ---ATGGAAGAGAGTGGAATAGAGACAACACCACCTGGGACTCCTCCACCAAATCCTGCAGGGCTGGCTGCTAC 71
||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||.|...||||||||||..||||||| |
Sbjct 1 ATGATGGAAGAAAGTGGAATCGAGACCACGCCGCCTGGAACCCCTCCCCTGCATCCTGCAGGCTTGGCTGC--C 72
Query 72 -TGCTATGTCTTCTACCCCTGTTCCATTAGCGGCAACCAGTTCTTTTTCTTCTCCAAATGTATCCTCCATGGAG 144
||| |.||.||....|.||..|.|||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||.||....||||||
Sbjct 73 GTGC-----CCTCCACTGAAGCTCACTCAGCTGCAACCAGTTCCTTCTCGTCTCCCAACGTGTCGGGAATGGAG 141
Query 145 TC-CTTCCCACCACTCGCATACTCTACTCCTCAGCCGCCCCTTCCTCCTGTGAGGCCTTCAGCACCATTACCTT 217
|| ||.||| ||||.||..||.||.||.||||||||..||||.||.||||||..|||.||.||.|||...||.|
Sbjct 142 TCTCTGCCC-CCACACGTGTATTCCACGCCTCAGCCCTCCCTGCCCCCTGTGCAGCCGTCCGCGCCACCTCCCT 214
Query 218 TTGTGCCTC-----CTCCTGCAGTTCCTTCTG-TCCCACCACT---TGTTACTTCTATGCC-ACCTCCTGTTTC 281
||||| || ||||.|| ||||||.| |||| || ||..||||||.|||| .||||| ||.||
Sbjct 215 TTGTG--TCGATGTCTCCGGC---TCCTTCCGTTCCC----CTGAGTGGCACTTCTGTGCCGCCCTCC-GTGTC 278
Query 282 TCCATCAACTGCTGCTGCCTTCGGTAATCCTCCTGTATCTCACTTCCCACCTTCAACTTCTGCCCCAAACACTC 355
||||||..||||..||||||||.|....|||||..|.||.||||||||.|||.|.||.||||||.|.....|||
Sbjct 279 TCCATCGCCTGCCACTGCCTTCAGCGGCCCTCCGATGTCCCACTTCCCGCCTGCGACCTCTGCCTCGGGTGCTC 352
Query 356 TTTTACCTGCACCCCCTTCGGGTCCTCCTATATCAGGATTTTCTGTTGGTTCAACTTATGACATTACAAGGGGA 429
|..|..|||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||.||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct 353 TCCTGTCTGCACCGCCTTCAGGGCCTCCGATATCAGGGTTTTCTGTCGGTACAACCTACGACATCACGAGGGGA 426
Query 430 CATGCTGGGAGAGCTCCCCAGACACCCCTGATGCCATCATTTTCTGCACCTTCAGGAACAGGTCTTTTGCCAAC 503
|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|..||||||.|.||||||.|
Sbjct 427 CATGCTGGGAGGGCGCCCCAGACACCTCTGATGCCGTCATTTTCTGCACCTCCGGTTACAGGTATCTTGCCAGC 500
Query 504 TCCTATTACTCAGCAAGCCAGTTTGACATCTCTGGCACAGGGAACTGGAACCACATCAGCCATTACTTTCCCAG 577
.||.|||||||||||||||||..||||.||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 501 CCCCATTACTCAGCAAGCCAGCATGACGTCTCTGGCCCAGGGACCTGGAACCACATCAGCCATTACTTTCCCGG 574
Query 578 AGGAGCAAGAAGACCCTAGAATTACTAGAGGTCAGGATGAAGCATCTGCTGGTGGAATCTGGGGTTTTATTAAG 651
||||.||.|||||.||.|||||||..|||||.||||||||.||..|||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 575 AGGAACAGGAAGATCCCAGAATTAACAGAGGCCAGGATGATGCCCCTGCTGGCGGGATCTGGGGTTTTATTAAG 648
Query 652 GGTGTGGCTGGGAATCCTATGGTGAAGTCTGTGCTTGATAAGACAAAACATTCAGTAGAAAGCATGATTACAAC 725
||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 649 GGCGTAGCTGGGAACCCTATGGTGAAATCTGTCCTGGATAAGACCAAGCATTCTGTAGAAAGCATGATCACCAC 722
Query 726 GCTGGACCCTGGCATGGCTCCCTATATCAAATCTGGAGGTGAACTGGATATTGTAGTGACCTCAAATAAAGAAG 799
||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 723 GCTGGATCCTGGCATGGCTCCATATATCAAATCTGGAGGTGAACTGGATATTGTCGTAACCTCAAATAAAGAAG 796
Query 800 TAAAAGTTGCTGCTGTCCGAGATGCCTTCCAGGAGGTCTTTGGCTTAGCTGTGGTTGTAGGGGAAGCTGGACAG 873
|.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 797 TGAAAGTGGCTGCTGTCCGAGATGCCTTCCAGGAGGTCTTTGGCTTAGCTGTGGTTGTTGGGGAAGCTGGACAG 870
Query 874 TCCAATATTGCCCCACAACCAGTGGGCTATGCAGCTGGATTAAAAGGTGCTCAGGAACGGATAGATAGCTTG-- 945
||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.|||.||
Sbjct 871 TCCAATATCGCCCCTCAGCCAGTCGGGTATGCAGCTGGATTGAAGGGCGCCCAGGAACGCATCGACAGCCTGAG 944
Query 946 --CGTCGAACTGGGGTGATCCATGAAAAACAGACAGCTGTGTCAGTAGAAAACTTCATTGCAGAATTGCTGCCT 1017
.|||| ||.|.||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||..||||||||
Sbjct 945 GAGGTCG----GGAGCGATCCACGAGAAACAGACGGCGGTGTCGGTAGAAAACTTCATTGCTGAGCTGCTGCCT 1014
Query 1018 GACAAATGGTTTGACATTGGTTGTTTGGTGGTTGAAGATCCTGTCCATGGCATTCATCTAGAAACATTTACACA 1091
|||||.|||||||||||.||.||..|||||||||||||.|||||.||||||||.|..||.|||.|.|||||.||
Sbjct 1015 GACAAGTGGTTTGACATCGGCTGCCTGGTGGTTGAAGACCCTGTGCATGGCATCCGCCTGGAAGCCTTTACCCA 1088
Query 1092 AGCCACACCAGTGCCTTTGGAATTTGTACAGCAGGCTCAAAGTCTAACTCCCCAGGACTATAATCTGAGGTGGT 1165
||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1089 AGCCACGCCCGTGCCTTTGGAGTTTGTGCAGCAGGCGCAAAGCCTGACTCCCCAGGACTACAATCTGAGGTGGT 1162
Query 1166 CAGGCCTTTTGGTGACAGTGGGTGAAGTCCTGGAAAAGAGTTTACTGAATGTCAGCCGGACTGATTGGCACATG 1239
||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1163 CAGGCCTTCTGGTGACAGTGGGGGAAGTCCTGGAAAAGAGCTTGCTCAATGTCAGCCGGACTGATTGGCACCTG 1236
Query 1240 GCATTTACTGGGATGTCCCGTCGGCAGATGATCTACAGTGCAGCCAGAGCGATAGCAGGCATGTATAAACAGCG 1313
||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||..||..|.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1237 GCTTTCACTGGCATGTCTCGCCGACAGATGATCTACAGTGCAGCCAAGGCCGTGGCGGGCATGTATAAGCAGCG 1310
Query 1314 CCTGCCACCCAGGACAGTG 1332
.||||||||||||.|..||
Sbjct 1311 GCTGCCACCCAGGCCCATG 1329