Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10634
• Subject: NM_023138.5
• Aligned Length: 1203
• Identities: 980
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ATGCTGGCCCGGAGGAAGCCGATGCTGCCGGCGCTCACCATCAACCCTACCATCGCCGAGGGCCCGTCCCCAAC  74
            |||||||||||||||||||||.||.|.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGCTGGCCCGGAGGAAGCCGGTGTTACCGGCACTCACTATCAACCCTACCATCGCCGAGGGCCCGTCCCCCAC  74

Query   75  CAGCGAGGGCGCCTCCGAGGCAAACCTGGTGGACCTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTGGAACTTGACGAGCAGC  148
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||
Sbjct   75  CAGCGAGGGCGCCTCTGAGGCAAACCTGGTGGACCTCCAGAAGAAGCTGGAAGAGCTGGACCTGGATGAGCAGC  148

Query  149  A---GAAGCGGCTGGAAGCCTTTCTCACCCAGAAAGCCAAGGTCGGCGAACTCAAAGACGATGACTTCGAAAGG  219
            |   ||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct  149  AAAGGAAGCGGCTGGAGGCCTTCCTTACCCAGAAGGCTAAGGTCGGTGAGCTCAAGGACGACGACTTTGAGAGG  222

Query  220  ACCTCAGAGCTGGACGCGGGCAACGGCGGGGTGGTCACCAAAGTCCAGCACAGACCCTCGGGCCTCATCATGGC  293
            |.|||||||||||..||.|||||.|||||.|||||||||||.|.||.|||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct  223  ATCTCAGAGCTGGGTGCCGGCAATGGCGGAGTGGTCACCAAGGCCCGGCATAGGCCGTCAGGCCTCATCATGGC  296

Query  294  CAGGAAGCTGATCCACCTTGAGATCAAGCCGGCCATCCGGAACCAGATCATCCGCGAGCACCAGGTCCTGCACG  367
            |||.||||||||||||||.||||||||.||||||.|.||.||||||||||||||.||||..|||||.|||||||
Sbjct  297  CAGAAAGCTGATCCACCTGGAGATCAAACCGGCCGTGCGCAACCAGATCATCCGGGAGCTGCAGGTGCTGCACG  370

Query  368  AGTGCAACTCACCGTACATCGTGGGCTTCTACGGGGCCTTCTACTGTGACAGGGAGATCAGCATCTGCATGGAG  441
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||.|.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTGCAACTCGCCCTACATCGTGGGCTTCTATGGGGCCTTCTACAGCGACGGCGAGATCAGCATCTGCATGGAG  444

Query  442  CACATGGATGGCGGCTCCCTGGACCAGGGGCTGAAAGAGGCCAAGAGGATTCCCGAGGACATCCTGGGGAAAGT  515
            |||||||||||.|||||.||||||||||..|||||.|||||||||.|||||||.||.||||||.|||||||.||
Sbjct  445  CACATGGATGGTGGCTCACTGGACCAGGTACTGAAGGAGGCCAAGCGGATTCCTGAAGACATCTTGGGGAAGGT  518

Query  516  CAGCATTGCGGTTCTCCGGGGCTTGGCGTACCTCCGAGAGAAGCACCAGATCATGCACCGAAATGTGAAGCCCT  589
            ||||||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  519  CAGCATTGCGGTGCTCCGGGGCCTGGCCTACCTCCGAGAGAAGCACCAGATCATGCACAGAGATGTGAAGCCCT  592

Query  590  CCAACATCCTCGTGAACTCTAGAGGGGAGATCAAGCTGTGTGACTTCGGGGTGAGCGGCCAGCTCATCGACTCC  663
            ||||||||||.|||||||||.|.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  593  CCAACATCCTGGTGAACTCTCGCGGGGAGATTAAGCTGTGTGACTTCGGGGTGAGCGGCCAGCTGATCGACTCC  666

Query  664  ATGGCCAACTCCTTCATGGGCACGCGCTCCTACATGGCTCCGGAGCGGTTGCAGGGCACACATTACTCGGTGCA  737
            |||||||||||.||..|.||.|||||||||||||||.|.||.||||||.||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct  667  ATGGCCAACTCGTTTGTAGGGACGCGCTCCTACATGTCCCCAGAGCGGCTGCAGGGCACCCACTACTCTGTGCA  740

Query  738  GTCGGTCATCTGGAGCATGGACCTGTCCCTGGTGGAGCTGGCCATCGAAAGGTACCCCATCCCCCCGCCCGACG  811
            |||||.||||||||||||||..|||||.|||||||||||||||||||..|||||.|||||.|||||.||.||.|
Sbjct  741  GTCGGACATCTGGAGCATGGGGCTGTCGCTGGTGGAGCTGGCCATCGGGAGGTATCCCATTCCCCCACCTGATG  814

Query  812  CCAAGGAGCTGGAGGCCATCTTTGGCCAGCCCGTGGTCGACAGGGAAGAAGGAGAGCCTCACAGCATCTCCTCT  885
            |||||||.||.|||||||.||||||||.|||.|||||.|||.|||.|||.|||||.||.||.||..|||||.|.
Sbjct  815  CCAAGGAACTAGAGGCCAGCTTTGGCCGGCCTGTGGTGGACGGGGCAGACGGAGAACCCCATAGTGTCTCCCCG  888

Query  886  TGGCCAGGGTCCCCCGGGCGCCCCAACAG---CGGTTACGGGATGGACAGCCTGCCCGCCATGGCCATCTTCGA  956
            .||||..||.||||.||.|||||||.|||   .|||.|.|||||||||||||..||.||||||||||||||.||
Sbjct  889  AGGCCCAGGCCCCCTGGACGCCCCATCAGTGTAGGTCATGGGATGGACAGCCGACCGGCCATGGCCATCTTTGA  962

Query  957  ACTGCTGGACTATATTGTGAAAGAGCCGCCTCCTAAGCTGCCCAACGGTGTGTTCACCCCCGACTTCCAGGAGT  1030
            .|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||..||||||||||.|.|.|||||||||||||
Sbjct  963  GCTGCTGGACTACATAGTGAACGAGCCACCTCCCAAGCTGCCCAGTGGTGTGTTCAGCTCAGACTTCCAGGAGT  1036

Query 1031  TTGTCAATAAATGCCTCATCAAAAACCCAACGGAGCGGGCGGACCTAAAGATGCTCACAAACCACGCCTTCATC  1104
            ||||.||||||||.|||||.||.||||||.|.|||||.||.||.||.|||.||||.|..|||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGTGAATAAATGTCTCATTAAGAACCCAGCAGAGCGAGCAGATCTGAAGCTGCTGATGAACCACGCCTTCATC  1110

Query 1105  AAGCGGTCCGAGGTGAAAGAAGCGGATTTTGCCTGC--------------------------------------  1140
            |||||.||.||||.|.|.||||.|||.||.|||.||                                      
Sbjct 1111  AAGCGCTCTGAGGGGGAGGAAGTGGACTTCGCCGGCTGGCTGTGCAGAACCCTGCGGCTGAAGCAGCCCAGCAC  1184

Query 1141  -------------------  1140
                               
Sbjct 1185  ACCCACGCGGACTGCAGTG  1203