Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10735
• Subject: XM_017315608.1
• Aligned Length: 660
• Identities: 523
• Gaps: 63

Alignment

Query   1  ATGCTGGGGTTTTTGTCCGCACGCCAAACGGGTTTGGAGGACCCTCTTCGCCTTCGGAGAGCAGAGTCAACACG  74
           |||.||.|.|||||||||||.||.||..|||||||||||||||||||||||.|.||.|||||..||||.|||||
Sbjct   1  ATGTTGAGCTTTTTGTCCGCTCGACAGTCGGGTTTGGAGGACCCTCTTCGCTTGCGTAGAGCGCAGTCCACACG  74

Query  75  GAGAGTTTTGGGACTGGAATTAAATAAAGACAGAGATGTTGAAAGAATCCACGGCGGTGGAATTAACACCCTTG  148
           |||.||..||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||.||||..||||||||||.|
Sbjct  75  GAGGGTCCTGGGGCTGGAGTTAAACAAAGACAGGGATGTGGAAAGAATCCATGGCAGTGGGGTTAACACCCTCG  148

Query 149  ACATTGAACCTGTTGAAGGGAGATACATGTTATCAGGTGGTTCAGATGGTGTGATTGTACTTTATGACCTTGAG  222
           |||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||.|||||||.||||||||||||
Sbjct 149  ACATTGAGCCCGTTGAAGGAAGATACATGTTGTCAGGTGGCTCCGATGGCGTGGTTGTACTCTATGACCTTGAG  222

Query 223  AACTCCAGCAGACAATCTTATTACACATGTAAAGCAGTGTGTTCCATTGGCAGAGATCATCCTGATGTTCACAG  296
           |||.||||||||||..|..||||||||||||||||||||||||||.||||||||...|||||.||||||||||.
Sbjct 223  AACGCCAGCAGACAGCCCCATTACACATGTAAAGCAGTGTGTTCCGTTGGCAGAAGCCATCCCGATGTTCACAA  296

Query 297  ATACAGTGTGGAGACTGTACAGTGGTATCCTCATGACACTGGCATGTTCACATCAAGCTCATTTGATAAAACTC  370
           ||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297  ATACAGCGTGGAGACTGTTCAGTGGTATCCTCATGACACTGGCATGTTCACATCCAGCTCATTTGATAAAACTC  370

Query 371  TGAAAGTATGGGATACAAATACATTACAAACTGCAGATGTATTTAATTTTGAGGAAACAGTTTACAGTCATCAT  444
           |||||||.|||||||||||.|||||.||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 371  TGAAAGTGTGGGATACAAACACATTGCAGGCTGCAGATGTGTTTAATTTTGAGGAAACAGTTTACAGTCATCAC  444

Query 445  ATGTCTCCAGTCTCCACCAAGCACTGTTTGGTAGCAGTTGGTACTAGAGGACCCAAAGTACAACTTTGTGACTT  518
           |||||.||||...||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445  ATGTCCCCAGCAGCCACCAAGCACTGTCTGGTAGCAGTTGGAACAAGAGGACCCAAGGTACAACTTTGTGACTT  518

Query 519  GAAGTCTGGATCCTGTTCTCACATTCTACAGGGT------------ATTTT--TATTTTATT--TCA-AACGGC  575
           .|||||||||||||||||||||||||||||||||            ||.||  .|.|||..|  ||| .|||.|
Sbjct 519  AAAGTCTGGATCCTGTTCTCACATTCTACAGGGTCACAGACAGGAAATCTTGGCAGTTTCCTGGTCACCACGCC  592

Query 576  A--ACTA---CTT-----------------------TGAGTAAACGATTCAATAAAAAGAAACGTTAC  615
           |  ||||   |||                       ||||||   |.|.| |||              
Sbjct 593  ATGACTATATCTTGGCAACAGCAAGGTGCACATGTATGAGTA---GGTGC-ATA--------------  642