Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10747
- Subject:
- NM_152245.3
- Aligned Length:
- 2316
- Identities:
- 1700
- Gaps:
- 615
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGAAGCTCACCAGGCCGTGGCCTTCCAGTTCACGGTGACCCCAGACGGGGTCGACTTCCGGCTCAGTCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGAGGCCCTGAAACACGTCTACCTGTCTGGGATCAACTCCTGGAAGAAACGCCTGATCCGCATCAAGAATGGCA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TCCTCAGGGGCGTGTACCCTGGCAGCCCCACCAGCTGGCTGGTCGTCATCATGGCAACAGTGGGTTCCTCCTTC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TGCAACGTGGACATCTCCTTGGGGCTGGTCAGTTGCATCCAGAGATGCCTCCCTCAGGGGTGTGGCCCCTACCA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GACCCCGCAGACCCGGGCACTTCTCAGCATGGCCATCTTCTCCACGGGCGTCTGGGTGACGGGCATCTTCTTCT 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 TCCGCCAAACCCTGAAGCTGCTTCTCTGCTACCATGGGTGGATGTTTGAGATGCATGGCAAGACCAGCAACTTG 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 ACCAGGATCTGGGCTATGTGTATCCGCCTTCTATCCAGCCGGCACCCTATGCTCTACAGCTTCCAGACATCTCT 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 GCCCAAGCTTCCTGTGCCCAGGGTGTCAGCCACAATTCAGCGGTACCTAGAGTCTGTGCGCCCCTTGTTGGATG 592
Query 1 -----------------ATGGAGTTGCTGGCCAAAGAATTCCAGGACAAGACTGCCCCCAGGCTGCAGAAATAC 57
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGAGGAATATTACCGCATGGAGTTGCTGGCCAAAGAATTCCAGGACAAGACTGCCCCCAGGCTGCAGAAATAC 666
Query 58 CTGGTGCTCAAGTCATGGTGGGCAAGTAACTATGTGAGTGACTGGTGGGAAGAGTACATCTACCTTCGAGGCAG 131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTGGTGCTCAAGTCATGGTGGGCAAGTAACTATGTGAGTGACTGGTGGGAAGAGTACATCTACCTTCGAGGCAG 740
Query 132 GAGCCCTCTCATGGTGAACAGCAACTATTATGTCATGGACCTTGTGCTCATCAAGAATACAGACGTGCAGGCAG 205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAGCCCTCTCATGGTGAACAGCAACTATTATGTCATGGACCTTGTGCTCATCAAGAATACAGACGTGCAGGCAG 814
Query 206 CCCGCCTGGGAAACATCATCCACGCCATGATCATGTATCGCCGTAAACTGGACCGTGAAGAAATCAAGCCTGTG 279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCCGCCTGGGAAACATCATCCACGCCATGATCATGTATCGCCGTAAACTGGACCGTGAAGAAATCAAGCCTGTG 888
Query 280 ATGGCACTGGGCATAGTGCCTATGTGCTCCTACCAGATGGAGAGGATGTTCAACACCACTCGGATCCCGGGCAA 353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATGGCACTGGGCATAGTGCCTATGTGCTCCTACCAGATGGAGAGGATGTTCAACACCACTCGGATCCCGGGCAA 962
Query 354 GGACACAGATGTGCTACAGCACCTCTCAGACAGCCGGCACGTGGCTGTCTACCACAAGGGACGCTTCTTCAAGC 427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGACACAGATGTGCTACAGCACCTCTCAGACAGCCGGCACGTGGCTGTCTACCACAAGGGACGCTTCTTCAAGC 1036
Query 428 TGTGGCTCTATGAGGGCGCCCGTCTGCTCAAGCCTCAGGATCTGGAGATGCAGTTCCAGAGGATCCTGGACGAC 501
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGTGGCTCTATGAGGGCGCCCGTCTGCTCAAGCCTCAGGATCTGGAGATGCAGTTCCAGAGGATCCTGGACGAC 1110
Query 502 CCCTCCCCACCTCAGCCTGGGGAGGAGAAGCTGGCAGCCCTCACTGCAGGAGGAAGGGTGGAGTGGGCGCAGGC 575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCCTCCCCACCTCAGCCTGGGGAGGAGAAGCTGGCAGCCCTCACTGCAGGAGGAAGGGTGGAGTGGGCGCAGGC 1184
Query 576 ACGCCAGGCCTTCTTTAGCTCTGGAAAGAATAAGGCTGCCTTGGAGGCCATCGAGCGTGCCGCTTTCTTCGTGG 649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ACGCCAGGCCTTCTTTAGCTCTGGAAAGAATAAGGCTGCCTTGGAGGCCATCGAGCGTGCCGCTTTCTTCGTGG 1258
Query 650 CCCTGGATGAGGAATCCTACTCCTATGACCCCGAAGATGAGGCCAGCCTCAGCCTCTATGGCAAGGCCCTGCTA 723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCCTGGATGAGGAATCCTACTCCTATGACCCCGAAGATGAGGCCAGCCTCAGCCTCTATGGCAAGGCCCTGCTA 1332
Query 724 CATGGCAACTGCTACAACAGGTGGTTTGACAAATCCTTCACTCTCATTTCCTTCAAGAATGGCCAGTTGGGTCT 797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CATGGCAACTGCTACAACAGGTGGTTTGACAAATCCTTCACTCTCATTTCCTTCAAGAATGGCCAGTTGGGTCT 1406
Query 798 CAATGCAGAGCATGCGTGGGCAGATGCTCCCATCATTGGGCACCTCTGGGAGTTTGTCCTGGGCACAGACAGCT 871
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAATGCAGAGCATGCGTGGGCAGATGCTCCCATCATTGGGCACCTCTGGGAGTTTGTCCTGGGCACAGACAGCT 1480
Query 872 TCCACCTGGGCTACACGGAGACCGGGCACTGCCTGGGCAAACCGAACCCTGCGCTCGCACCTCCTACACGGCTG 945
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCCACCTGGGCTACACGGAGACCGGGCACTGCCTGGGCAAACCGAACCCTGCGCTCGCACCTCCTACACGGCTG 1554
Query 946 CAGTGGGACATTCCAAAA------CAGGCGGTCATCAAGAGTTCCTACCAGGTGGCCAAGGCGTTGGCAGACGA 1013
|||||||||||||||||| ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CAGTGGGACATTCCAAAACAGTGCCAGGCGGTCATCGAGAGTTCCTACCAGGTGGCCAAGGCGTTGGCAGACGA 1628
Query 1014 CGTGGAGTTGTACTGCTTCCAGTTCCTGCCCTTTGGCAAAGGCCTCATCAAGAAGTGCCGGACCAGCCCTGATG 1087
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CGTGGAGTTGTACTGCTTCCAGTTCCTGCCCTTTGGCAAAGGCCTCATCAAGAAGTGCCGGACCAGCCCTGATG 1702
Query 1088 CCTTTGTGCAGATCGCGCTGCAGCTGGCTCACTTCCGGGACAGGGGTAAGTTCTGCCTGACCTATGAGGCCTCA 1161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCTTTGTGCAGATCGCGCTGCAGCTGGCTCACTTCCGGGACAGGGGTAAGTTCTGCCTGACCTATGAGGCCTCA 1776
Query 1162 ATGACCAGAATGTTCCGGGAGGGACGGACTGAGACTGTGCGTTCCTGTACCAGCGAGTCCACAGCCTTTGTGCA 1235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ATGACCAGAATGTTCCGGGAGGGACGGACTGAGACTGTGCGTTCCTGTACCAGCGAGTCCACAGCCTTTGTGCA 1850
Query 1236 GGCCATGATGGAGGGGTCCCACACAAAAGCAGACCTGCGAGATCTCTTCCAGAAGGCTGCTAAGAAGCACCAGA 1309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGCCATGATGGAGGGGTCCCACACAAAAGCAGACCTGCGAGATCTCTTCCAGAAGGCTGCTAAGAAGCACCAGA 1924
Query 1310 ATATGTACCGCCTGGCCATGACCGGGGCAGGGATCGACAGGCACCTCTTCTGCCTTTACTTGGTCTCCAAGTAC 1383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATATGTACCGCCTGGCCATGACCGGGGCAGGGATCGACAGGCACCTCTTCTGCCTTTACTTGGTCTCCAAGTAC 1998
Query 1384 CTAGGAGTCAGCTCTCCTTTCCTTGCTGAGGTGCTCTCGGAACCCTGGCGTCTCTCCACCAGCCAGATCCCCCA 1457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTAGGAGTCAGCTCTCCTTTCCTTGCTGAGGTGCTCTCGGAACCCTGGCGTCTCTCCACCAGCCAGATCCCCCA 2072
Query 1458 ATCCCAGATCCGCATGTTCGACCCAGAGCAGCACCCCAATCACCTGGGCGCTGGAGGTGGCTTTGGCCCTGTAG 1531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 ATCCCAGATCCGCATGTTCGACCCAGAGCAGCACCCCAATCACCTGGGCGCTGGAGGTGGCTTTGGCCCTGTAG 2146
Query 1532 CAGATGATGGCTATGGAGTTTCCTACATGATTGCAGGCGAGAACACGATCTTCTTCCACATCTCCAGCAAGTTC 1605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CAGATGATGGCTATGGAGTTTCCTACATGATTGCAGGCGAGAACACGATCTTCTTCCACATCTCCAGCAAGTTC 2220
Query 1606 TCAAGCTCAGAGACGAACGCCCAGCGCTTTGGAAACCACATCCGCAAAGCCCTGCTGGACATTGCTGATCTTTT 1679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TCAAGCTCAGAGACGAACGCCCAGCGCTTTGGAAACCACATCCGCAAAGCCCTGCTGGACATTGCTGATCTTTT 2294
Query 1680 CCAAGTTCCCAAGGCCTACAGC 1701
||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CCAAGTTCCCAAGGCCTACAGC 2316