Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10758
• Subject: XM_005269567.3
• Aligned Length: 1544
• Identities: 1318
• Gaps: 214

Alignment

Query    1  ATGAGACCAGGACTTCCAGGCCCCACAGGGTTGTGCGCTCAGACCTCAAGTAGGGGCCAGAAGAGTGTACTGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACAGAAGGAAT----CTTGTGGAATTTGGCAGTTGTACCATTTTCTTAGCAGAAAACAGGAGCCCAGGTGGGAG  144
                     ||    ||||||||                      |.||||.|||                   
Sbjct    1  ---------ATGGCCCTTGTGGA----------------------TAAGCACAAA-------------------  24

Query  145  CCATGTGTGTCGGGTTCCTCGTCAGGTGACGGTGCTGTTGCGGATCTCGCGGATGAGCTGAGGGGGTATCCAG-  217
                                ||||.|.|||.|.|.|    .|||                          ||| 
Sbjct   25  --------------------GTCAAGAGACAGCGAT----TGGA--------------------------CAGA  48

Query  218  CTTTGTGCTGCACGCTTCCTGTCCACTCATACAGGTCGTGGGCTGGTATCCGCCCCCAGATCATGAACGGCCCC  291
            .|||||                                   |..||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   49  ATTTGT-----------------------------------GAAGGTATCCGCCCCCAGATCATGAACGGCCCC  87

Query  292  CTGCACCCCCGCCCCCTGGTGGCGCTGCTGGACGGCCGCGACTGCACTGTGGAGATGCCCATCCTGAAGGACCT  365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   88  CTGCACCCCCGCCCCCTGGTGGCGCTGCTGGACGGCCGCGACTGCACTGTGGAGATGCCCATCCTGAAGGACCT  161

Query  366  GGCCACTGTGGCCTTCTGTGACGCGCAGTCGACGCAGGAAATCCACGAGAAGGTTCTAAACGAAGCCGTGGGCG  439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  162  GGCCACTGTGGCCTTCTGTGACGCGCAGTCGACGCAGGAAATCCACGAGAAGGTTCTAAACGAAGCCGTGGGCG  235

Query  440  CCATGATGTACCACACCATCACCCTCACCAGGGAGGACCTGGAGAAGTTCAAGGCCCTGAGAGTGATCGTGCGG  513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  236  CCATGATGTACCACACCATCACCCTCACCAGGGAGGACCTGGAGAAGTTCAAGGCCCTGAGAGTGATCGTGCGG  309

Query  514  ATAGGCAGTGGCTATGACAACGTGGACATCAAGGCTGCCGGCGAGCTCGGAATTGCCGTGTGCAACATCCCGTC  587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  310  ATAGGCAGTGGCTATGACAACGTGGACATCAAGGCTGCCGGCGAGCTCGGAATTGCCGTGTGCAACATCCCGTC  383

Query  588  TGCAGCCGTGGAAGAGACAGCGGACTCTACCATCTGCCACATCCTCAACCTGTACCGGAGGAACACGTGGCTGT  661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  384  TGCAGCCGTGGAAGAGACAGCGGACTCTACCATCTGCCACATCCTCAACCTGTACCGGAGGAACACGTGGCTGT  457

Query  662  ACCAGGCACTGCGGGAAGGCACGCGGGTTCAGAGCGTGGAGCAGATCCGCGAGGTGGCCTCGGGAGCGGCCCGC  735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  458  ACCAGGCACTGCGGGAAGGCACGCGGGTTCAGAGCGTGGAGCAGATCCGCGAGGTGGCCTCGGGAGCGGCCCGC  531

Query  736  ATCCGTGGGGAGACGCTGGGCCTCATTGGCTTTGGTCGCACGGGGCAGGCGGTTGCAGTTCGAGCCAAGGCCTT  809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  532  ATCCGTGGGGAGACGCTGGGCCTCATTGGCTTTGGTCGCACGGGGCAGGCGGTTGCAGTTCGAGCCAAGGCCTT  605

Query  810  TGGATTCAGCGTCATATTTTATGACCCCTACTTGCAGGATGGGATCGAGCGGTCCCTGGGCGTGCAGAGGGTCT  883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  606  TGGATTCAGCGTCATATTTTATGACCCCTACTTGCAGGATGGGATCGAGCGGTCCCTGGGCGTGCAGAGGGTCT  679

Query  884  ACACCCTGCAGGATTTGCTGTATCAGAGCGACTGCGTCTCCTTGCACTGCAATCTCAACGAACATAACCACCAC  957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  680  ACACCCTGCAGGATTTGCTGTATCAGAGCGACTGCGTCTCCTTGCACTGCAATCTCAACGAACATAACCACCAC  753

Query  958  CTCATCAATGACTTTACCATAAAGCAGATGAGGCAGGGAGCATTCCTTGTGAACGCAGCCCGTGGCGGCCTGGT  1031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  754  CTCATCAATGACTTTACCATAAAGCAGATGAGGCAGGGAGCATTCCTTGTGAACGCAGCCCGTGGCGGCCTGGT  827

Query 1032  GGACGAGAAAGCCTTAGCACAAGCCCTCAAGGAGGGCAGGATACGAAGGGCAGCCCTCGACGTGCATGAGTCAG  1105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  828  GGACGAGAAAGCCTTAGCACAAGCCCTCAAGGAGGGCAGGATACGAGGGGCAGCCCTCGACGTGCATGAGTCAG  901

Query 1106  AGCCCTTCAGCTTTGCTCAGGGTCCGTTGAAAGATGCCCCGAATCTCATCTGCACTCCTCACACTGCCTGGTAC  1179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  902  AGCCCTTCAGCTTTGCTCAGGGTCCGTTGAAAGATGCCCCGAATCTCATCTGCACTCCTCACACTGCCTGGTAC  975

Query 1180  AGTGAGCAGGCGTCACTGGAGATGAGGGAGGCAGCTGCCACCGAGATCCGCCGAGCCATCACAGGTCGCATCCC  1253
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  976  AGTGAGCAGGCGTCACTGGAGATGAGGGAGGCAGCTGCCACCGAGATCCGCCGAGCCATCACAGGTCGCATCCC  1049

Query 1254  AGAAAGCTTAAGAAATTGTGTGAACAAGGAATTCTTTGTCACATCAGCGCCTTGGTCAGTAATAGACCAGCAAG  1327
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050  AGAAAGCTTAAGAAATTGTGTGAACAAGGAATTCTTTGTCACATCAGCGCCTTGGTCAGTAATAGACCAGCAAG  1123

Query 1328  CAATTCATCCTGAGCTCAATGGTGCCACATACAGATATCCGCCAGGCATCGTGGGTGTGGCTCCAGGAGGACTT  1401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124  CAATTCATCCTGAGCTCAATGGTGCCACATACAGATATCCGCCAGGCATCGTGGGTGTGGCTCCAGGAGGACTT  1197

Query 1402  CCTGCAGCCATGGAAGGGATCATCCCTGGAGGCATCCCAGTGACTCACAACCTCCCGACAGTGGCACATCCTTC  1475
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198  CCTGCAGCCATGGAAGGGATCATCCCTGGAGGCATCCCAGTGACTCACAACCTCCCGACAGTGGCACATCCTTC  1271

Query 1476  CCAAGCGCCCTCTCCCAACCAGCCCACAAAACACGGGGACAATCGAGAGCACCCCAACGAGCAA  1539
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1272  CCAAGCGCCCTCTCCCAACCAGCCCACAAAACACGGGGACAATCGAGAGCACCCCAACGAGCAA  1335