Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_10775
Subject:
NM_001127454.2
Aligned Length:
996
Identities:
885
Gaps:
111

Alignment

Query   1  ATGCAGAAGTGTGTGATCTCTGAGCACATGCAGGTCGAGGAGAAGTGTGGTGGCATCGTGGGCATCCAGACCAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGCAGAAGTGTGTGATCTCTGAGCACATGCAGGTCGAGGAGAAGTGTGGTGGCATCGTGGGCATCCAGACCAA  74

Query  75  GACGGTGCAGGTGTCAGCGACGGAGGATGGGAATGTCACCAAGGACTCCAACGTGGTGCTGGAGATCCCAGCTG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GACGGTGCAGGTGTCAGCGACGGAGGATGGGAATGTCACCAAGGACTCCAACGTGGTGCTGGAGATCCCAGCTG  148

Query 149  CCACCACCATTGCCTACGGTGTCATTGAGTTATACGTGAAACTGGACGGCCAGTTCGAGTTCTGCCTTCTCCGA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CCACCACCATTGCCTACGGTGTCATTGAGTTATACGTGAAACTGGACGGCCAGTTCGAGTTCTGCCTTCTCCGA  222

Query 223  GGGAAGCAAGGTGGCTTCGAGAACAAGAAGAGAATTGACTCTGTCTACCTGGACCCCCTGGTCTTTCGAGAGTT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GGGAAGCAAGGTGGCTTCGAGAACAAGAAGAGAATTGACTCTGTCTACCTGGACCCCCTGGTCTTTCGAGAGTT  296

Query 297  TGCATTCATAGACATGCCAGATGCTGCGCATGGGATATCTTCCCAGGATGGACCATTAAGTGTTTTAAAGCAAG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TGCATTCATAGACATGCCAGATGCTGCGCATGGGATATCTTCCCAGGATGGACCATTAAGTGTTTTAAAGCAAG  370

Query 371  CGACCCTGCTCCTGGAGAGGAATTTCCATCCATTTGCGGAGCTGCCTGAGCCACAACAGACAGCTTTGAGTGAC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  CGACCCTGCTCCTGGAGAGGAATTTCCATCCATTTGCGGAGCTGCCTGAGCCACAACAGACAGCTTTGAGTGAC  444

Query 445  ATCTTCCAGGCGGTCCTATTTGATGATGAACTACTCATGGTCCTGGAACCAGTGTGCGATGACCTGGTCAGCGG  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  ATCTTCCAGGCGGTCCTATTTGATGATGAACTACTCATGGTCCTGGAACCAGTGTGCGATGACCTGGTCAGCGG  518

Query 519  CCTCTCGCCCACAGTGGCGGTGCTGGGGGAGCTGAAGCCCCGGCAGCAGCAGGACCTTGTGGCCTTCCTGCAGC  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CCTCTCGCCCACAGTGGCGGTGCTGGGGGAGCTGAAGCCCCGGCAGCAGCAGGACCTTGTGGCCTTCCTGCAGC  592

Query 593  TGGTGGGGTGCAGCTTACAGGGTGGGTGTCCGGGCCCCGAGGATGCAGGCAGCAAGCAGCTGTTTATGACAGCC  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TGGTGGGGTGCAGCTTACAGGGTGGGTGTCCGGGCCCCGAGGATGCAGGCAGCAAGCAGCTGTTTATGACAGCC  666

Query 667  TACTTCTTGGTCAGTGCCCTCGCAGAAATGCCAGATAGCGCAGCAGCTCTGCTGGGCACTTGCTGCAAACTCCA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  TACTTCTTGGTCAGTGCCCTCGCAGAAATGCCAGATAGCGCAGCAGCTCTGCTGGGCACTTGCTGCAAACTCCA  740

Query 741  GATCATTCCCACACTGTGCCACTTGCTTCGTGCTCTGTCTGATGATGGAGTATCTGATCTTGAAGACCCAACCT  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  GATCATTCCCACACTGTGCCACTTGCTTCGTGCTCTGTCTGATGATGGAGTATCTGATCTTGAAGACCCAACCT  814

Query 815  TGACTCCCCTGAAAGATACAGAAAGGTTTGGGATTGTGCAGCGCTTGTTTGCCTCAGCTGACATTAGTCTG---  885
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 815  TGACTCCCCTGAAAGATACAGAAAGGTTTGGGATTGTGCAGCGCTTGTTTGCCTCAGCTGACATTAGTCTGGAG  888

Query 886  --------------------------------------------------------------------------  885
                                                                                     
Sbjct 889  AGACTGAAGTCATCTGTGAAAGCTGTCATTCTGAAGGACTCTAAAGTCTTCCCACTGCTTCTTTGTATAACCCT  962

Query 886  ----------------------------------  885
                                             
Sbjct 963  GAATGGACTCTGTGCTTTAGGCAGAGAACATTCA  996