Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10805
- Subject:
- NM_007680.4
- Aligned Length:
- 3052
- Identities:
- 1920
- Gaps:
- 875
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCTACTGAGGGCACGACTGGCTCAGGGAGCAGAGTGGTGGCGGGCATGGTGTGCAGTCTGTGGCTCCTGGT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCTAGGGTCATCAGTTCTAGCTCTGGAAGAGGTGCTGCTGGATACCACAGGAGAGACCTCTGAGATTGGCTGGC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TCACCTACCCGCCAGGTGGGTGGGATGAGGTGAGTGTTCTAGATGACCAGCGCCGTCTGACTCGGACCTTCGAA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GCATGCCACGTTGCAGGGCTCCCTCCTGGTTCTGGCCAGGACAATTGGCTGCAGACACACTTTGTGGAACGGCG 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 AGGGGCCCAGAGGGCACACATCCGCCTTCACTTCTCTGTACGAGCCTGTTCCAGCCTGGGTGTGAGTGGGGGTA 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 CCTGCCGAGAGACCTTCACCCTTTACTACCGGCAGGCTGATGAGCCAGACGGCCCCGACAGTATTGCGGCCTGG 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 CACCTCAAACGCTGGACCAAAGTGGACACAATTGCCGCAGATGAGAGCTTCCCTGCCTCCTCTTCCTCTTCCTC 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 ATGGGCTGTGGGACCCCACAGGACCGGTCAGCGGGTGGGACTGCAGCTGAATGTCAAAGAGCGCAGCTTTGGTC 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 CTCTCACTCAGCGTGGCTTCTATGTGGCCTTCCAGGACACAGGGGCCTGCCTGGCCCTTGTGGCAGTCAAGCTC 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 TTCTCCTACACCTGTCCCTCCGTCCTGCGTGCCTTTGCCTCTTTTCCTGAGACACAGGCCAGTGGAGCTGGAGG 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 GGCTTCCTTAGTGGCAGCTGTGGGCACCTGTGTAGCTCATGCAGAACCAGAGGAGGATGGAGTAGGAGGCCAGG 814
Query 1 -----------------------------------------------ATGGTAGCTGTCGGGGGCTGCCGCTGC 27
|||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 815 CAGGGGGCAGCCCCCCAAGGTTACACTGTAATGGCGAAGGCAGGTGGATGGTAGCTGTGGGAGGCTGCCGCTGC 888
Query 28 CAGCCTGGATACCAACCAGCACGAGGAGACAAGGCCTGCCAAGCCTGCCCACGGGGGCT-CTATAAGTCTTCT- 99
|||||||||.||||.||.||.||.|||||||||..||||||||||||||| .|.|||.| |||||||.| .||
Sbjct 889 CAGCCTGGACACCAGCCTGCTCGTGGAGACAAGCTCTGCCAAGCCTGCCC-TGAGGGATCCTATAAGGC-CCTG 960
Query 100 GCTGGGAATGCTCCCTGCTCACCATGCCCTGCCCGCAGTCACGCTCCCAACCCAGCAGCCCCCGTTTGCCCCTG 173
||||||||||.||||||.|||||.||.||.||||||||.|||.|.||..||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 961 GCTGGGAATGTTCCCTGTTCACCGTGTCCAGCCCGCAGCCACTCCCCTGACCCTGCAGCCCCAGTTTGCCCATG 1034
Query 174 CCTGGAGGGCTTCTACCGGGCCAGTTCCGACCCACCAGAGGCCCCCTGCACTGGTCCTCCATCGGCTCCCCAGG 247
.||..|.|||||||||.||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1035 TCTCCAAGGCTTCTACAGGGCCAGTTCGGACCCACCAGAGGCTCCCTGCACTGGTCCTCCATCGGCTCCCCGGG 1108
Query 248 AGCTTTGGTTTGAGGTGCAAGGCTCAGCACTCATGCTACACTGGCGCCTGCCTCGGGAGCTGGGGGGTCGAGGG 321
||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||.|||||||||.||.||||||
Sbjct 1109 AGCTATGGTTTGAGGTGCAAGGCTCGGCACTCATGCTGCACTGGCGTCTGCCTCAGGAGCTGGGTGGACGAGGG 1182
Query 322 GACCTGCTCTTCAATGTCGTGTGCAAGGAGTGTGAAGGCCGCCAGGA-ACCTGCCAGCGGTGGTGGGGGCACTT 394
||.||||||||||||||.||||||||||||||||.|||.|.| ||| |.| ||||| .|||||||.|..|
Sbjct 1183 GATCTGCTCTTCAATGTTGTGTGCAAGGAGTGTGGAGGTCAC--GGAGAGC--CCAGC---AGTGGGGGGATGT 1249
Query 395 GTCACCGCTGCAGGGATGAGGTCCACTTCGACCCTCGCCAGAGAGGCCTGACTGAGAGCCGAGTGTTAGTGGGG 468
|||.||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1250 GTCGCCGCTGCAGGGACGAGGTGCATTTCGACCCCCGCCAGAGGGGACTGACTGAGAGTCGAGTGTTAGTTGGG 1323
Query 469 GGACTCCGGGCACACGTACCCTACATCTTAGAGGTGCAGGCTGTTAATGGGGTGTCTGAGCTCAGCCCTGACCC 542
||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 GGGCTCCGAGCACACGTGCCATACATCTTGGAAGTGCAGGCTGTCAATGGGGTGTCTGAGCTCAGCCCTGACCC 1397
Query 543 TCCTCAGGCTGCAGCCATCAATGTCAGCACCAGCCATGAAGTGCCCTCTGCTGTCCCTGTGGTGCACCAGGTGA 616
|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||.||||||||||||
Sbjct 1398 TCCCCAGGCAGCAGCCATCAATGTCAGCACCAGCCACGAAGTCCCTTCTGCAGTCCCTGTGATGCACCAGGTGA 1471
Query 617 GCCGGGCATCCAACAGCATCACGGTGTCCTGGCCGCAGCCCGACCAGACCAATGGGAACATCCTGGACTATCAG 690
||||||||.|||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1472 GCCGGGCAGCCAACAGCATCACAGTATCCTGGCCACAGCCTGAGCAAACAAATGGGAACATCCTCGACTACCAG 1545
Query 691 CTCCGCTACTATGACCAGGCAGAAGACGAATCCCACTCCTTCACCCTGACCAGCGAGACCAACACTGCCACCGT 764
||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1546 CTGCGCTACTATGACCAGGCAGAAGATGAATCCCACTCCTTCACCATGACCAGTGAGACCAACACTGCCACTGT 1619
Query 765 GACACAGCTGAGCCCTGGCCACATCTATGGTTTCCAGGTGCGGGCCCGGACTGCTGCCGGCCACGGCCCCTACG 838
|||||.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1620 GACACGGTTGAGCCCTGGCCACATCTATGGCTTCCAGGTGCGGGCACGGACTGCAGCTGGCCACGGCCCCTATG 1693
Query 839 GGGGCAAAGTCTATTTCCAGACACTTCCTCAAGGGGAGCTGTCTTCCCAGCTTCCGGA-AAGACTCTCCTTGGT 911
||||||||||||||||.||||||.|.||||||||.||||||||.|||||||||||.|| ||| ||.||||||||
Sbjct 1694 GGGGCAAAGTCTATTTTCAGACATTGCCTCAAGGTGAGCTGTCCTCCCAGCTTCCAGAGAAG-CTGTCCTTGGT 1766
Query 912 GATCGGCTCCATCCTGGGGGCTTTGGCCTTCCTCCTGCTGGCAGCCATCACCGTGCTGGCGGTCGTCTTCCAGC 985
|||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||.|||||||||
Sbjct 1767 GATTGGTTCCATCCTGGGGGCCTTGGCCTTCCTTCTACTGGCAGCCATCACTGTACTGGCTGTCATCTTCCAGC 1840
Query 986 GGAAGCGGCGTGGGACTGGCTACACGGAGCAGCTGCAGCAATACAGCAGCCCAGGACTCGGGGTGAAGTATTAC 1059
|||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1841 GGAAGCGCCGTGGGACCGGCTACACAGAACAACTGCAACAATACAGCAGCCCAGGACTTGGAGTGAAGTATTAC 1914
Query 1060 ATCGACCCCTCCACCTACGAGGACCCCTGTCAGGCCATCCGAGAACTTGCCCGGGAAGTCGATCCTGCTTATAT 1133
||.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||.||||.|||||.||.||.||.||.|||.|.|||||
Sbjct 1915 ATTGACCCTTCTACATACGATGACCCCTGCCAGGCCATCAGAGAGCTTGCTCGAGAGGTTGACCCTACATATAT 1988
Query 1134 CAAGATTGAGGAGGTCATTGGGACAGGCTCTTTTGGAGAAGTGCGCCAGGGCCGCCTGCAGCCACGGGGACGGA 1207
|||||||||.||.|||||||||.||||.||.||||||||||||||.|.||||||.|||||.||.||||||.|||
Sbjct 1989 CAAGATTGAAGAAGTCATTGGGGCAGGTTCCTTTGGAGAAGTGCGTCGGGGCCGACTGCAACCCCGGGGAAGGA 2062
Query 1208 GGGAGCAGACTGTGGCCATCCAGGCCCTGTGGGCCGGGGGCGCCGAAAGCCTGCAGATGACCTTCCTGGGCCGG 1281
||||.||..|||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||.||.||||||.||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2063 GGGAACAAGCTGTGGCTATCCAGGCCTTGTGGGCAGGGGGTGCTGAGAGCCTGAAGATGACCTTTCTGGGTCGG 2136
Query 1282 GCCGCAGTGCTGGGTCAGTTCCAGCACCCCAACATCCTGCGGCTGGAGGGCGTGGTCACCAAGAGCCGACCCCT 1355
||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||..|
Sbjct 2137 GCAGCACTGCTGGGCCAGTTCCAGCACCCCAATATCCTGCGGCTGGAAGGTGTAGTCACTAAGAGTCGGCCTGT 2210
Query 1356 CATGGTGCTGACGGAGTTCATGGAGCTTGGCCCCCTGGACAGCTTCCTCAGGCAGCGGGAGGGCCAGTTCAGCA 1429
||||||||||||.||..|||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 2211 CATGGTGCTGACAGAACTCATGGAACTTGGTCCCCTGGACAGCTTTCTTAGGCAGCGAGAGGGCCAGTTCAGTA 2284
Query 1430 GCCTGCAGCTGGTGGCCATGCAGCGGGGAGTGGCTGCTGCCATGCAGTACCTGTCCAGCTTTGCCTTCGTCCAT 1503
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 2285 GCCTGCAGCTGGTGGCCATGCAGCGGGGTGTGGCTGCTGCCATGCAGTACTTGTCCAGCTTTGCCTTTGTTCAC 2358
Query 1504 CGCTCGCTGTCTGCCCACAGCGTGCTGGTGAATAGCCACTTGGTGTGCAAGGTGGCCCGTCTTGGCCACAGTCC 1577
||..|.||.||.||||..||.|||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2359 CGAGCACTCTCGGCCCGAAGTGTGCTAGTGAATAGCCACCTGGTGTGTAAGGTGGCACGTCTCGGCCACAGTCC 2432
Query 1578 TCAGGGCCCAAGTTGTTTGCTTCGCTGGGCAGCCCCAGAGGTCATTGCACATGGAAAGCATACAACATCCAGTG 1651
||||||..||||||..||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||.||.|
Sbjct 2433 TCAGGGTTCAAGTTCCTTGCTTCGCTGGGCAGCCCCAGAGGTCATTACACATGGAAAGTATACAACATCTAGCG 2506
Query 1652 ATGTCTGGAGCTTTGGGATACTCATGTGGGAAGTGATGAGTTATGGAGAACGGCCTTACTGGGACATGAGTGAG 1725
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||..|||
Sbjct 2507 ATGTCTGGAGCTTTGGCATACTCATGTGGGAAGTGATGAGCTATGGAGAACGGCCCTACTGGGACATGAACGAG 2580
Query 1726 CAGGAGGTACTAAATGCAATAGAGCAGGAGTTCCGGCTGCCCCCGCCTCCAGGCTGTCCTCCTGGATTACATCT 1799
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||.|||||||
Sbjct 2581 CAGGAGGTACTAAATGCAATAGAGCAAGAGTTCCGGCTGCCCCCACCTCCAGGGTGCCCCCCTGGACTACATCT 2654
Query 1800 ACTTATGTTGGACACTTGGCAGAAGGACCGTGCCCGGCGGCCTCATTTTGACCAGCTGGTGGCTGCATTTGACA 1873
|||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2655 ACTGATGCTAGACACTTGGCAGAAGGACCGTGCCCGTCGGCCTCATTTTGACCAGCTGGTAGCTGCATTTGACA 2728
Query 1874 AGATGATCCGCAAGCCAGATACCCTGCAGGCTGGCGGGGACCCAGGGGAAAGGCCTTCCCAGGCCCTTCTGACC 1947
|||||||.||||||||.|||||.||.|||||||..||||.|.|.|||||.||||||||||||||.|||||||.|
Sbjct 2729 AGATGATTCGCAAGCCTGATACTCTCCAGGCTGAAGGGGGCTCCGGGGACAGGCCTTCCCAGGCTCTTCTGAAC 2802
Query 1948 CCTGTGGCCCTGGACTTTCCTTGTCTGGACTCACCCCAGGCCTGGCTTTCAGCCATTGGACTGGAGTGCTACCA 2021
|||||||||.|||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2803 CCTGTGGCCTTGGACTTCCCTTGCCTGGACTCTCCCCAGGCCTGGCTTTCAGCCATTGGACTAGAGTGCTACCA 2876
Query 2022 GGACAACTTCTCCAAGTTTGGCCTCTGTACCTTCAGTGATGTGGCTCAGCTCAGCCTAGAAGACCTGCCTGCCC 2095
|||||||||||||||||||||.||.|..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||
Sbjct 2877 GGACAACTTCTCCAAGTTTGGTCTTTCCACCTTCAGTGATGTGGCTCAGCTCAGCCTGGAAGACCTGCCAGGCC 2950
Query 2096 TGGGCATCACCCTGGCTGGCCACCAGAAGAAGCTGCTGCACCACATCCAGCTCCTTCAGCAACACCTGAGGCAG 2169
|||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||.||||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2951 TGGGCATCACCCTAGCTGGCCACCAGAAGAAACTTCTGCACAACATTCAGCTCCTCCAGCAGCACCTGAGGCAG 3024
Query 2170 CAGGGCTCAGTGGAGGTC 2187
|..|||||||||||.||.
Sbjct 3025 CCAGGCTCAGTGGAAGTG 3042