Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10814
- Subject:
- XM_005260327.2
- Aligned Length:
- 1549
- Identities:
- 1342
- Gaps:
- 188
Alignment
Query 1 ATGGTAGAACTAGTGATCTCACCCAGCCTCACTGTAAACAGCGATTGTCTGGATAAACTGAAGTTTAACCGTGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTAGAACTAGTGATCTCACCCAGCCTCACTGTAAACAGCGATTGTCTGGATAAACTGAAGTTTAACCGTGC 74
Query 75 TGACGCTGCTGTGTGGACTCTGAGTGACAGACAAGGCATCACCAAATCGGCCCCCCTGAGAGTGTCCCAGCTCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGACGCTGCTGTGTGGACTCTGAGTGACAGACAAGGCATCACCAAATCGGCCCCCCTGAGAGTGTCCCAGCTCT 148
Query 149 TCTCCAGATCTTGCCCACGTGTCCTCCCCCGCCAGCCTTCCACAGCCATGGCAGCCTACGGCCAGACGCAGTAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCTCCAGATCTTGCCCACGTGTCCTCCCCCGCCAGCCTTCCACAGCCATGGCAGCCTACGGCCAGACGCAGTAC 222
Query 223 AGTGCGGGGATCCAGCAGGCTACCCCCTATACAGCTTACCCACCTCCAGCACAAGCCTATGGAATCCCTTCCTT 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 223 AGTGCGGGGATCCAGCAGGCTACCCCCTATACAGCTTACCCACCTCCAGCACAAGCCTATGGAATCCCTTCCTA 296
Query 297 CAGCACCTCACCCACTGGACAGAGCCCATACACCT---ACCAGATGCACGGCACAACAGGGTTCTATCAAGGAG 367
||||| ||| .|||||| |.|||.|| |||| |||
Sbjct 297 CAGCA--TCA------AGACAGA----AGACAGCTTGAACCA-------------------TTC---------- 329
Query 368 GAAATGGACTGGGCAACGCAGCCGGTTTCGGGAGTGTGCACCAGGACTATCCTTCCTACCCCGGCTTCCCCCAG 441
..||||.|| |||| ||| |||||
Sbjct 330 ------CCCTGGCCA----------------GAGT--------GGA------TTCCT----------------- 350
Query 442 AGCCAGTACCCCCAG-TATTACGGCTCATCCTACAACCCTCCCTACGTCCCGGCCAGCAGCATCTGCCCTTCGC 514
||| ||| ||||| ||||.||.||.|.||.|
Sbjct 351 ------------CAGCTAT---GGCTC------------------------------CAGCTTCAGCACCTCAC 379
Query 515 CC-CTCTCCACGTCCACCTACGTCCTCCAGGAG-GCATCTCACAACGTCCCCAACCAGAGTTCCGAGTCACTTG 586
|| ||...|| ||| .||| ||| ||.|||||| ||
Sbjct 380 CCACTGGACA--------------------GAGCCCAT---ACA------CCTACCAGA-------------TG 411
Query 587 C-TGGTGAATACAACACACACAATGGACCTTCCACACCAGCGAAAGAGGGAGACACAGACAGGCCGCACCGGGC 659
| .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 412 CACGGTGAATACAACACACACAATGGACCTTCCACACCAGCGAAAGAGGGAGACACAGACAGGCCGCACCGGGC 485
Query 660 CTCCGACGGGAAGCTCCGAGGCCGGTCTAAGAGGAGCAGTGACCCGTCCCCGGCAGGGGACAATGAGATTGAGC 733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 486 CTCCGACGGGAAGCTCCGAGGCCGGTCTAAGAGGAGCAGTGACCCGTCCCCGGCAGGGGACAATGAGATTGAGC 559
Query 734 GTGTGTTCGTGTGGGACTTGGATGAGACAATAATTATTTTTCACTCCTTACTCACGGGGACATTTGCATCCAGA 807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 560 GTGTGTTCGTGTGGGACTTGGATGAGACAATAATTATTTTTCACTCCTTACTCACGGGGACATTTGCATCCAGA 633
Query 808 TACGGGAAGGACACCACGACGTCCGTGCGCATTGGCCTTATGATGGAAGAGATGATCTTCAACCTTGCAGATAC 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 634 TACGGGAAGGACACCACGACGTCCGTGCGCATTGGCCTTATGATGGAAGAGATGATCTTCAACCTTGCAGATAC 707
Query 882 ACATCTGTTCTTCAATGACCTGGAGGATTGTGACCAGATCCACGTTGATGACGTCTCATCAGATGACAATGGCC 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 708 ACATCTGTTCTTCAATGACCTGGAGGATTGTGACCAGATCCACGTTGATGACGTCTCATCAGATGACAATGGCC 781
Query 956 AAGATTTAAGCACATACAACTTCTCCGCTGACGGCTTCCACAGTTCGGCCCCAGCAGCCAACCTGTGCCTGGGC 1029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 782 AAGATTTAAGCACATACAACTTCTCCGCTGACGGCTTCCACAGTTCGGCCCCAGGAGCCAACCTGTGCCTGGGC 855
Query 1030 TCTGGCGTGCACGGCGGCGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCCTTCCGCTACCGGCGGGTGAAGGAGATGTACAA 1103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 856 TCTGGCGTGCACGGCGGCGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCCTTCCGCTACCGGCGGGTGAAGGAGATGTACAA 929
Query 1104 TACCTACAAGAACAACGTTGGTGGGTTGATAGGCACTCCCAAAAGGGAGACCTGGCTACAGCTCCGAGCTGAGC 1177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 930 TACCTACAAGAACAACGTTGGTGGGTTGATAGGCACTCCCAAAAGGGAGACCTGGCTACAGCTCCGAGCTGAGC 1003
Query 1178 TGGAAGCTCTCACAGACCTCTGGCTGACCCACTCCCTGAAGGCACTAAACCTCATCAACTCCCGGCCCAACTGT 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1004 TGGAAGCTCTCACAGACCTCTGGCTGACCCACTCCCTGAAGGCACTAAACCTCATCAACTCCCGGCCCAACTGT 1077
Query 1252 GTCAATGTGCTGGTCACCACCACTCAACTAATTCCTGCCCTGGCCAAAGTCCTGCTATATGGCCTGGGGTCTGT 1325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 GTCAATGTGCTGGTCACCACCACTCAACTAATTCCTGCCCTGGCCAAAGTCCTGCTATATGGCCTGGGGTCTGT 1151
Query 1326 GTTTCCTATTGAGAACATCTACAGTGCAACCAAGACAGGGAAGGAGAGCTGCTTCGAGAGGATAATGCAGAGAT 1399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152 GTTTCCTATTGAGAACATCTACAGTGCAACCAAGACAGGGAAGGAGAGCTGCTTCGAGAGGATAATGCAGAGAT 1225
Query 1400 TCGGCAGAAAAGCTGTCTACGTGGTGATCGGTGATGGTGTGGAAGAGGAGCAAGGAGCGAAAAAGCACAACATG 1473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226 TCGGCAGAAAAGCTGTCTACGTGGTGATCGGTGATGGTGTGGAAGAGGAGCAAGGAGCGAAAAAGCACAACATG 1299
Query 1474 CCTTTCTGGCGGATATCCTGCCACGCAGACCTGGAGGCACTGAGGCACGCCCTGGAGCTGGAGTATTTA 1542
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1300 CCTTTCTGGCGGATATCCTGCCACGCAGACCTGGAGGCACTGAGGCACGCCCTGGAGCTGGAGTATTTA 1368