Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10873
• Subject: NM_002117.6
• Aligned Length: 1106
• Identities: 977
• Gaps: 19

Alignment

Query    1  ATGGCCGTCATGGCGCCCCGAACCCTCGTCCTGCTACTCTCGGGGGCCCTGGCCCTGACCCAGACCTGGGCGGG  74
            |||...|||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||||.|.|||||||||||||.||||||||||..|
Sbjct    1  ATGCGGGTCATGGCGCCCCGAGCCCTCCTCCTGCTGCTCTCGGGAGGCCTGGCCCTGACCGAGACCTGGGCCTG  74

Query   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCTACACCTCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGGGAGCCCCGCTTCATCGCCGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||
Sbjct   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCGACACCGCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGAGAGCCCCGCTTCATCTCAGTGG  148

Query  149  GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAG--CCAGAGGATGGAGCCGCGGGCGC  220
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |.|||||  ||||||||||||||
Sbjct  149  GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCGAGAGG--GGAGCCGCGGGCGC  220

Query  221  CGTGGATAGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGAACACACGGAATGT-GAAGGCCCACTCACAGACTGA  293
            |||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||.||| || .|||..|||..|||||.||||
Sbjct  221  CGTGGGTGGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGGAGACACAGAA-GTACAAGCGCCAGGCACAGGCTGA  293

Query  294  CCGAGAGAGCCTGCGGATCGCGCTCCGCTACTACAACCAGAGCGAGGACGGTTCTCACACCATCCAGAGGATGT  367
            |||||.|||||||||||.|..||.|.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||
Sbjct  294  CCGAGTGAGCCTGCGGAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGACGGGTCTCACACCCTCCAGAGGATGT  367

Query  368  ATGGCTGCGACGTGGGGCCGGACGGGCGCTTCCTCCGCGGGTACCAGCAGGACGCTTACGACGGCAAGGATTAC  441
            .||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||..|.|||..|||.||||||||||||||||||
Sbjct  368  CTGGCTGCGACCTGGGGCCCGACGGGCGCCTCCTCCGCGGGTATGACCAGTCCGCCTACGACGGCAAGGATTAC  441

Query  442  ATCGCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCTTGGACCGCGGCGGACATGGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTGGGA  515
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  442  ATCGCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCCGCGGACACCGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTTGGA  515

Query  516  GACGGCCCATGAGGCGGAGCAGTGGAGAGCCTACCTGGAGGGCCGGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGG  589
            |.||||||.||.||||||||||..|||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  GGCGGCCCGTGCGGCGGAGCAGCTGAGAGCCTACCTGGAGGGCACGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGG  589

Query  590  AGAACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCACGGACGCCCCCAAGACGCATATGACTCACCACGCTGTCTCTGACCAT  663
            ||||||||||||||||||||||||||.|.||..||||.|||||.||..||||.||||||.|..|||||||||||
Sbjct  590  AGAACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCAGAACCCCCAAAGACACACGTGACCCACCACCCCCTCTCTGACCAT  663

Query  664  GAGGCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGAGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGGGA  737
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  GAGGCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGGGA  737

Query  738  GGACCAGACCCAGGACACGGAGCTCGTGGAGACCAGGCCTGCAGGGGATGGGACCTTCCAGAAGTGGGCGTCTG  811
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||..|||
Sbjct  738  GGACCAGACCCAGGACACCGAGCTTGTGGAGACCAGGCCAGCAGGAGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTG  811

Query  812  TGGTGGTGCCTTCTGGACAGGAGCAGAGATACACCTGCCATGTGCAGCATGAGGGTCTGCCCAAGCCCCTCACC  885
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||.||||...|||||||||||
Sbjct  812  TGGTGGTGCCTTCTGGACAAGAGCAGAGATACACGTGCCATATGCAGCACGAGGGGCTGCAAGAGCCCCTCACC  885

Query  886  CTGAGATGGGAGCCGTCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCGTGGGCATCATTGCTGGCCTGGTTCTCTTTGG---  956
            |||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.|| .|||   
Sbjct  886  CTGAGCTGGGAGCCATCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCATGGGCATCGTTGCTGGCCTGGCTGTC-CTGGTTG  958

Query  957  ----AGCTGTGATCGCTGGAGCTGTGGTCGCTGCTGTGATGTGGAGGAGGAAGAGCTCAGATAGAAAAGGAGGG  1026
                |||||   ||..|||||||||||||.|.|||.|||||||.||||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct  959  TCCTAGCTG---TCCTTGGAGCTGTGGTCACCGCTATGATGTGTAGGAGGAAGAGCTCAGGTGGAAAAGGAGGG  1029

Query 1027  AGCTACTCTCAGGCTGCAAGCAGTGACAGTGCCCAGGGCTCTGATATGTCTCTCA-CAGCTTGTAAAGTG  1095
            ||||.||||||||||||..||||..||||||||||||||||||||..|||||||| || |||||||||..
Sbjct 1030  AGCTGCTCTCAGGCTGCGTGCAGCAACAGTGCCCAGGGCTCTGATGAGTCTCTCATCA-CTTGTAAAGCC  1098