Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10874
• Subject: NM_002117.6
• Aligned Length: 1102
• Identities: 1010
• Gaps: 20

Alignment

Query    1  ATGCGGGTCACGGCGCCCCGAACCGTCCTCCTGCTGCTCTCGGGAGCCCTGGCCCTGACCGAGACCTGGGCCGG  74
            ||||||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct    1  ATGCGGGTCATGGCGCCCCGAGCCCTCCTCCTGCTGCTCTCGGGAGGCCTGGCCCTGACCGAGACCTGGGCCTG  74

Query   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCTACACCGCCATGTCCCGGCCCGGCCGCGGGGAGCCCCGCTTCATCTCAGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCGACACCGCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGAGAGCCCCGCTTCATCTCAGTGG  148

Query  149  GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGAGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCGAGAGAGGAGCCGCGGGCGCCG  222
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCGAGAGGGGAGCCGCGGGCGCCG  222

Query  223  TGGATAGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGAACACACAGATCTGCAAGACCAACACACAGACTTACCG  296
            |||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||..|.||||..|.|..|||||.||.||||
Sbjct  223  TGGGTGGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGGAGACACAGAAGTACAAGCGCCAGGCACAGGCTGACCG  296

Query  297  AGAGAGCCTGCGGAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGCCGGGTCTCACACCCTCCAGAGGATGTACG  370
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct  297  AGTGAGCCTGCGGAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGACGGGTCTCACACCCTCCAGAGGATGTCTG  370

Query  371  GCTGCGACGTGGGGCCGGACGGGCGCCTCCTCCGCGGGCATGACCAGTACGCCTACGACGGCAAGGATTACATC  444
            ||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCTGCGACCTGGGGCCCGACGGGCGCCTCCTCCGCGGGTATGACCAGTCCGCCTACGACGGCAAGGATTACATC  444

Query  445  GCCCTGAACGAGGACCTGAGCTCCTGGACCGCGGCGGACACGGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTGGGAGGC  518
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  445  GCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCCGCGGACACCGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTTGGAGGC  518

Query  519  GGCCCGTGAGGCGGAGCAGCTGAGAGCCTACCTGGAGGGCCTGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGGAGA  592
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCCCGTGCGGCGGAGCAGCTGAGAGCCTACCTGGAGGGCACGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGGAGA  592

Query  593  ACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCGGACCCCCCAAAGACACATGTGACCCACCACCCCATCTCTGACCATGAG  666
            |||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  593  ACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCAGAACCCCCAAAGACACACGTGACCCACCACCCCCTCTCTGACCATGAG  666

Query  667  GCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGCGAGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  GCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGGGAGGA  740

Query  741  CCAAACTCAGGACACCGAGCTTGTGGAGACCAGACCAGCAGGAGATAGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTGTGG  814
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCAGACCCAGGACACCGAGCTTGTGGAGACCAGGCCAGCAGGAGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTGTGG  814

Query  815  TGGTGCCTTCTGGAGAAGAGCAGAGATACACATGCCATGTACAGCATGAGGGGCTGCCGAAGCCCCTCACCCTG  888
            ||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.|.|||||.||||||||||...||||||||||||||
Sbjct  815  TGGTGCCTTCTGGACAAGAGCAGAGATACACGTGCCATATGCAGCACGAGGGGCTGCAAGAGCCCCTCACCCTG  888

Query  889  AGATGGGAGCCATCTTCCCAGTCCACCATCCCCATCGTGGGCATTGTTGCTGGCCTGGCTGTCCTAGCAGTTGT  962
            ||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||   .|||||
Sbjct  889  AGCTGGGAGCCATCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCATGGGCATCGTTGCTGGCCTGGCTGTCCT---GGTTGT  959

Query  963  ------GGTCATCGGAGCTGTGGTCGCTACTGTGATGTGTAGGAGGAAGAGCTCAGGTGGAAAAGGAGGGAGCT  1030
                  .|||.|.||||||||||||.|..||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  CCTAGCTGTCCTTGGAGCTGTGGTCACCGCTATGATGTGTAGGAGGAAGAGCTCAGGTGGAAAAGGAGGGAGCT  1033

Query 1031  ACTCTCAGGCTGCGTCCAGCGACAGTGCCCAGGGCTCTGATGTGTCTCTCA-CAGCT---------  1086
            .||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||.|||||||| || ||         
Sbjct 1034  GCTCTCAGGCTGCGTGCAGCAACAGTGCCCAGGGCTCTGATGAGTCTCTCATCA-CTTGTAAAGCC  1098