Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10887
• Subject: NM_031243.3
• Aligned Length: 1059
• Identities: 746
• Gaps: 312

Alignment

Query    1  ---------------------------ATGG---------AGAGAGAAAAGGAACAGTTCCGTAAGCTCTTTAT  38
                                       .|||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAAAACTTTAGAAACTGTTCCTTTGGAGAGGAAAAAGAGAGAAAAGGAACAGTTCCGTAAGCTCTTTAT  74

Query   39  TGGTGGCTTAAGCTTTGAAACCACAGAAGAAAGTTTGAGGAACTACTACGAACAATGGGGAAAGCTTACAGACT  112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGTGGCTTAAGCTTTGAAACCACAGAAGAAAGTTTGAGGAACTACTACGAACAATGGGGAAAGCTTACAGACT  148

Query  113  GTGTGGTAATGAGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGTTTTGTAACTTTTTCATCCATGGCTGAG  186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTGTGGTAATGAGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGTTTTGTAACTTTTTCATCCATGGCTGAG  222

Query  187  GTTGATGCTGCCATGGCTGCAAGACCTCATTCAATTGATGGGAGAGTAGTTGAGCCAAAACGTGCTGTAGCAAG  260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTTGATGCTGCCATGGCTGCAAGACCTCATTCAATTGATGGGAGAGTAGTTGAGCCAAAACGTGCTGTAGCAAG  296

Query  261  AGAGGAATCTGGAAAACCAGGGGCTCATGTAACTGTGAAGAAGCTGTTTGTTGGCGGAATTAAAGAAGATACTG  334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAGGAATCTGGAAAACCAGGGGCTCATGTAACTGTGAAGAAGCTGTTTGTTGGCGGAATTAAAGAAGATACTG  370

Query  335  AGGAACATCACCTTAGAGATTACTTTGAGGAATATGGAAAAATTGATACCATTGAGATAATTACTGATAGGCAG  408
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAACATCACCTTAGAGATTACTTTGAGGAATATGGAAAAATTGATACCATTGAGATAATTACTGATAGGCAG  444

Query  409  TCTGGAAAGAAAAGAGGCTTTGGCTTTGTTACTTTTGATGACCATGATCCTGTGGATAAAATCGTATTGCAGAA  482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTGGAAAGAAAAGAGGCTTTGGCTTTGTTACTTTTGATGACCATGATCCTGTGGATAAAATCGTATTGCAGAA  518

Query  483  ATACCATACCATCAATGGTCATAATGCAGAAGTAAGAAAGGCTTTGTCTAGACAAGAAATGC------------  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct  519  ATACCATACCATCAATGGTCATAATGCAGAAGTAAGAAAGGCTTTGTCTAGACAAGAAATGCAGGAAGTTCAGA  592

Query  545  --------------------------------------------------------------------------  544
                                                                                      
Sbjct  593  GTTCTAGGAGTGGAAGAGGAGGCAACTTTGGCTTTGGGGATTCACGTGGTGGCGGTGGAAATTTCGGACCAGGA  666

Query  545  --------------------------------------------------------------------------  544
                                                                                      
Sbjct  667  CCAGGAAGTAACTTTAGAGGAGGATCTGATGGATATGGCAGTGGACGTGGATTTGGGGATGGCTATAATGGGTA  740

Query  545  ---AGGAGGACCTGGAGGTGGCAATTTTGGAGGTAGCCCCGGTTATGGAGGAGGAAGAGGAGGATATGGTGGTG  615
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGAGGAGGACCTGGAGGTGGCAATTTTGGAGGTAGCCCCGGTTATGGAGGAGGAAGAGGAGGATATGGTGGTG  814

Query  616  GAGGACCTGGATATGGCAACCAGGGTGGGGGCTACGGAGGTGGTTATGACAACTATGGAGGAGGAAATTATGGA  689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGGACCTGGATATGGCAACCAGGGTGGGGGCTACGGAGGTGGTTATGACAACTATGGAGGAGGAAATTATGGA  888

Query  690  AGTGGAAATTACAATGATTTTGGAAATTATAACCAGCAACCTTCTAACTACGGTCCAA----------------  747
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct  889  AGTGGAAATTACAATGATTTTGGAAATTATAACCAGCAACCTTCTAACTACGGTCCAATGAAGAGTGGAAACTT  962

Query  748  --------------------------------------------------------------------------  747
                                                                                      
Sbjct  963  TGGTGGTAGCAGGAACATGGGGGGACCATATGGTGGAGGAAACTATGGTCCAGGAGGCAGTGGAGGAAGTGGGG  1036

Query  748  -----------------------  747
                                   
Sbjct 1037  GTTATGGTGGGAGGAGCCGATAC  1059