Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10887
- Subject:
- XM_006506373.3
- Aligned Length:
- 1059
- Identities:
- 705
- Gaps:
- 312
Alignment
Query 1 ---------------------------ATGG---------AGAGAGAAAAGGAACAGTTCCGTAAGCTCTTTAT 38
.||| ||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGAAAACTTTAGAAACTGTTCCTTTGGAGAGGAAAAAGAGAGAAAAGGAACAGTTCCGAAAGCTCTTTAT 74
Query 39 TGGTGGCTTAAGCTTTGAAACCACAGAAGAAAGTTTGAGGAACTACTACGAACAATGGGGAAAGCTTACAGACT 112
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 75 TGGTGGCTTAAGCTTTGAAACCACAGAAGAAAGTTTGAGAAACTACTATGAGCAATGGGGAAAGCTCACAGACT 148
Query 113 GTGTGGTAATGAGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGTTTTGTAACTTTTTCATCCATGGCTGAG 186
|||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 149 GTGTGGTTATGCGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCTTTGTAACTTTCTCATCCATGGCCGAG 222
Query 187 GTTGATGCTGCCATGGCTGCAAGACCTCATTCAATTGATGGGAGAGTAGTTGAGCCAAAACGTGCTGTAGCAAG 260
|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTTGACGCTGCCATGGCTGCAAGGCCCCATTCCATTGATGGCAGGGTAGTTGAGCCAAAACGTGCTGTAGCAAG 296
Query 261 AGAGGAATCTGGAAAACCAGGGGCTCATGTAACTGTGAAGAAGCTGTTTGTTGGCGGAATTAAAGAAGATACTG 334
||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 297 AGAGGAGTCTGGAAAACCAGGAGCCCATGTGACTGTGAAGAAGCTGTTTGTTGGTGGAATTAAGGAAGATACTG 370
Query 335 AGGAACATCACCTTAGAGATTACTTTGAGGAATATGGAAAAATTGATACCATTGAGATAATTACTGATAGGCAG 408
|||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 371 AGGAACACCACCTTAGAGATTACTTTGAAGAGTATGGAAAAATTGATACTATTGAAATAATTACCGATAGGCAG 444
Query 409 TCTGGAAAGAAAAGAGGCTTTGGCTTTGTTACTTTTGATGACCATGATCCTGTGGATAAAATCGTATTGCAGAA 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 445 TCTGGAAAGAAAAGAGGCTTTGGCTTTGTTACTTTTGATGACCATGATCCTGTGGATAAAATTGTCTTGCAAAA 518
Query 483 ATACCATACCATCAATGGTCATAATGCAGAAGTAAGAAAGGCTTTGTCTAGACAAGAAATGC------------ 544
|||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATATCACACCATAAATGGTCACAATGCAGAAGTTAGAAAGGCATTGTCTAGACAAGAAATGCAGGAAGTCCAAA 592
Query 545 -------------------------------------------------------------------------- 544
Sbjct 593 GTTCTAGGAGTGGAAGAGGAGGAAACTTTGGTTTTGGGGATTCTCGTGGTGGCGGTGGCAATTTTGGACCAGGA 666
Query 545 -------------------------------------------------------------------------- 544
Sbjct 667 CCAGGAAGCAACTTTAGGGGGGGATCTGATGGATACGGAAGTGGACGTGGATTTGGGGATGGCTATAATGGGTA 740
Query 545 ---AGGAGGACCTGGAGGTGGCAATTTTGGAGGTAGCCCCGGTTATGGAGGAGGAAGAGGAGGATATGGTGGTG 615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGGAGGAGGACCTGGAGGTGGCAATTTTGGAGGTAGCCCTGGTTATGGAGGAGGAAGAGGAGGATATGGTGGTG 814
Query 616 GAGGACCTGGATATGGCAACCAGGGTGGGGGCTACGGAGGTGGTTATGACAACTATGGAGGAGGAAATTATGGA 689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GAGGACCTGGATATGGCAACCAGGGTGGGGGCTACGGAGGTGGTTATGACAACTATGGAGGAGGAAATTATGGA 888
Query 690 AGTGGAAATTACAATGATTTTGGAAATTATAACCAGCAACCTTCTAACTACGGTCCAA---------------- 747
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 889 AGTGGAAGTTACAATGATTTTGGAAATTATAACCAGCAGCCTTCTAACTATGGTCCAATGAAGAGTGGAAACTT 962
Query 748 -------------------------------------------------------------------------- 747
Sbjct 963 TGGGGGTAGCAGGAACATGGGAGGACCATATGGTGGAGGGAACTATGGTCCTGGAGGAAGTGGAGGAAGTGGTG 1036
Query 748 ----------------------- 747
Sbjct 1037 GCTATGGTGGAAGGAGCAGATAT 1059