Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10935
• Subject: NM_001145779.1
• Aligned Length: 706
• Identities: 665
• Gaps: 28

Alignment

Query   1  ---------------------------MVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEP  47
                                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct   1  MATANFGKIQIGIYVEIKRSDGRIHQAMVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEDIEP  74

Query  48  SPETPPPPASSAKVNKIVKNRRTVASIKNDPPSRDNRVVGSARARPSQFPEQSSSAQQNGSVSDISPVQAAKKE  121
           |||. |||.||.|||||||||||||..|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  SPEL-PPPSSSSKVNKIVKNRRTVAAVKNDPPPRDNRVVGSARARPSQLPEQSSSAQQNGSVSDISPVQAAKKE  147

Query 122  FGPPSRRKSNCVKEVEKLQEKREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPIDEH  195
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148  FGPPSRRKSNCVKEVEKLQEKREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPIDEH  221

Query 196  RICVCVRKRPLNKKETQMKDLDVITIPSKDVVMVHEPKQKVDLTRYLENQTFRFDYAFDDSAPNEMVYRFTARP  269
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222  RICVCVRKRPLNKKETQMKDLDVITIPSKDVVMVHEPKQKVDLTRYLENQTFRFDYAFDDSAPNEMVYRFTARP  295

Query 270  LVETIFERGMATCFAYGQTGSGKTHTMGGDFSGKNQDCSKGIYALAARDVFLMLKKPNYKKLELQVYATFFEIY  343
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296  LVETIFERGMATCFAYGQTGSGKTHTMGGDFSGKNQDCSKGIYALAARDVFLMLKKPNYKKLELQVYATFFEIY  369

Query 344  SGKVFDLLNRKTKLRVLEDGKQQVQVVGLQEREVKCVEDVLKLIDIGNSCRTSGQTSANAHSSRSHAVFQIILR  417
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370  SGKVFDLLNRKTKLRVLEDGKQQVQVVGLQEREVKCVEDVLKLIDIGNSCRTSGQTSANAHSSRSHAVFQIILR  443

Query 418  RKGKLHGKFSLIDLAGNERGADTSSADRQTRLEGAEINKSLLALKECIRALGRNKPHTPFRASKLTQVLRDSFI  491
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444  RKGKLHGKFSLIDLAGNERGADTSSADRQTRLEGAEINKSLLALKECIRALGRNKPHTPFRASKLTQVLRDSFI  517

Query 492  GENSRTCMIATISPGMASCENTLNTLRYANRVKELTVDPTAAGDVRPIMHHPPNQIDDLETQWGVGSSPQRDDL  565
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 518  GENSRTCMIATISPGMASCENTLNTLRYANRVKELTVNPAAAGDVHPIMHHPPSQIDDLETQWGVGSSPQRDDL  591

Query 566  KLLCEQNEEEVSPQLFTFHEAVSQMVEMEEQVVEDHRAVFQESIRWLEDEKALLEMTEEVDYDVDSYATQLEAI  639
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592  KLLCEQNEEEVSPQLFTFHEAVSQMVEMEEQVVEDHRAVFQESIRWIEDEKALLEMTEEVDYDVDSYATQLEAI  665

Query 640  LEQKIDILTELRDKVKSFRAALQEEEQASKQINPKRPRAL  679
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666  LEQKIDILTELRDKVKSFRAALQEEEQASKQINPKRPRAL  705