Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_10935
Subject:
NM_001243952.1
Aligned Length:
686
Identities:
679
Gaps:
7

Alignment

Query   1  -------MVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEPSPETPPPPASSAKVNKIVKN  67
                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MGRIHQAMVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEPSPETPPPPASSAKVNKIVKN  74

Query  68  RRTVASIKNDPPSRDNRVVGSARARPSQFPEQSSSAQQNGSVSDISPVQAAKKEFGPPSRRKSNCVKEVEKLQE  141
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  RRTVASIKNDPPSRDNRVVGSARARPSQFPEQSSSAQQNGSVSDISPVQAAKKEFGPPSRRKSNCVKEVEKLQE  148

Query 142  KREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPIDEHRICVCVRKRPLNKKETQMKD  215
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  KREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPIDEHRICVCVRKRPLNKKETQMKD  222

Query 216  LDVITIPSKDVVMVHEPKQKVDLTRYLENQTFRFDYAFDDSAPNEMVYRFTARPLVETIFERGMATCFAYGQTG  289
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  LDVITIPSKDVVMVHEPKQKVDLTRYLENQTFRFDYAFDDSAPNEMVYRFTARPLVETIFERGMATCFAYGQTG  296

Query 290  SGKTHTMGGDFSGKNQDCSKGIYALAARDVFLMLKKPNYKKLELQVYATFFEIYSGKVFDLLNRKTKLRVLEDG  363
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  SGKTHTMGGDFSGKNQDCSKGIYALAARDVFLMLKKPNYKKLELQVYATFFEIYSGKVFDLLNRKTKLRVLEDG  370

Query 364  KQQVQVVGLQEREVKCVEDVLKLIDIGNSCRTSGQTSANAHSSRSHAVFQIILRRKGKLHGKFSLIDLAGNERG  437
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  KQQVQVVGLQEREVKCVEDVLKLIDIGNSCRTSGQTSANAHSSRSHAVFQIILRRKGKLHGKFSLIDLAGNERG  444

Query 438  ADTSSADRQTRLEGAEINKSLLALKECIRALGRNKPHTPFRASKLTQVLRDSFIGENSRTCMIATISPGMASCE  511
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  ADTSSADRQTRLEGAEINKSLLALKECIRALGRNKPHTPFRASKLTQVLRDSFIGENSRTCMIATISPGMASCE  518

Query 512  NTLNTLRYANRVKELTVDPTAAGDVRPIMHHPPNQIDDLETQWGVGSSPQRDDLKLLCEQNEEEVSPQLFTFHE  585
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  NTLNTLRYANRVKELTVDPTAAGDVRPIMHHPPNQIDDLETQWGVGSSPQRDDLKLLCEQNEEEVSPQLFTFHE  592

Query 586  AVSQMVEMEEQVVEDHRAVFQESIRWLEDEKALLEMTEEVDYDVDSYATQLEAILEQKIDILTELRDKVKSFRA  659
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  AVSQMVEMEEQVVEDHRAVFQESIRWLEDEKALLEMTEEVDYDVDSYATQLEAILEQKIDILTELRDKVKSFRA  666

Query 660  ALQEEEQASKQINPKRPRAL  679
           ||||||||||||||||||||
Sbjct 667  ALQEEEQASKQINPKRPRAL  686