Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_10935
Subject:
NM_004520.4
Aligned Length:
706
Identities:
679
Gaps:
27

Alignment

Query   1  ---------------------------MVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEP  47
                                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MATANFGKIQIGIYVEIKRSDGRIHQAMVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLESIFSLNPDLVPDEEIEP  74

Query  48  SPETPPPPASSAKVNKIVKNRRTVASIKNDPPSRDNRVVGSARARPSQFPEQSSSAQQNGSVSDISPVQAAKKE  121
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  SPETPPPPASSAKVNKIVKNRRTVASIKNDPPSRDNRVVGSARARPSQFPEQSSSAQQNGSVSDISPVQAAKKE  148

Query 122  FGPPSRRKSNCVKEVEKLQEKREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPIDEH  195
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  FGPPSRRKSNCVKEVEKLQEKREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIRDFRGSLDYRPLTTADPIDEH  222

Query 196  RICVCVRKRPLNKKETQMKDLDVITIPSKDVVMVHEPKQKVDLTRYLENQTFRFDYAFDDSAPNEMVYRFTARP  269
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  RICVCVRKRPLNKKETQMKDLDVITIPSKDVVMVHEPKQKVDLTRYLENQTFRFDYAFDDSAPNEMVYRFTARP  296

Query 270  LVETIFERGMATCFAYGQTGSGKTHTMGGDFSGKNQDCSKGIYALAARDVFLMLKKPNYKKLELQVYATFFEIY  343
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  LVETIFERGMATCFAYGQTGSGKTHTMGGDFSGKNQDCSKGIYALAARDVFLMLKKPNYKKLELQVYATFFEIY  370

Query 344  SGKVFDLLNRKTKLRVLEDGKQQVQVVGLQEREVKCVEDVLKLIDIGNSCRTSGQTSANAHSSRSHAVFQIILR  417
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  SGKVFDLLNRKTKLRVLEDGKQQVQVVGLQEREVKCVEDVLKLIDIGNSCRTSGQTSANAHSSRSHAVFQIILR  444

Query 418  RKGKLHGKFSLIDLAGNERGADTSSADRQTRLEGAEINKSLLALKECIRALGRNKPHTPFRASKLTQVLRDSFI  491
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  RKGKLHGKFSLIDLAGNERGADTSSADRQTRLEGAEINKSLLALKECIRALGRNKPHTPFRASKLTQVLRDSFI  518

Query 492  GENSRTCMIATISPGMASCENTLNTLRYANRVKELTVDPTAAGDVRPIMHHPPNQIDDLETQWGVGSSPQRDDL  565
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  GENSRTCMIATISPGMASCENTLNTLRYANRVKELTVDPTAAGDVRPIMHHPPNQIDDLETQWGVGSSPQRDDL  592

Query 566  KLLCEQNEEEVSPQLFTFHEAVSQMVEMEEQVVEDHRAVFQESIRWLEDEKALLEMTEEVDYDVDSYATQLEAI  639
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  KLLCEQNEEEVSPQLFTFHEAVSQMVEMEEQVVEDHRAVFQESIRWLEDEKALLEMTEEVDYDVDSYATQLEAI  666

Query 640  LEQKIDILTELRDKVKSFRAALQEEEQASKQINPKRPRAL  679
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  LEQKIDILTELRDKVKSFRAALQEEEQASKQINPKRPRAL  706