Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10935
• Subject: XM_006517535.3
• Aligned Length: 2232
• Identities: 1870
• Gaps: 198

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCAACGGCCAACTTCGGCAAGATCCAGATCGGGATTTACGTGGAGATCAAGCGCAGCGATGGCCGAATACA  74

Query    1  -------ATGGTAACATCTTTAAATGAAGATAATGAAAGTGTAACTGTTGAATGGATAGAAAATGGAGATACAA  67
                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CCAAGCAATGGTAACATCTTTAAATGAAGATAATGAAAGTGTAACTGTTGAGTGGATAGAAAATGGAGATACGA  148

Query   68  AAGGCAAAGAGATTGACCTGGAGAGCATCTTTTCACTTAACCCTGACCTTGTTCCTGATGAAGAAATTGAACCC  141
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  149  AAGGCAAAGAGATTGACTTGGAGAGCATCTTTTCACTTAACCCTGACCTTGTACCTGATGAAGATATTGAGCCC  222

Query  142  AGTCCAGAAACACCTCCACCTCCAGCATCCTCAGCCAAAGTAAACAAAATTGTAAAGAATCGACGGACTGTAGC  215
            |||||||||..|||||||||..|..||||||||   |||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  223  AGTCCAGAACTACCTCCACCCTCGTCATCCTCA---AAAGTTAACAAAATTGTAAAGAACCGGCGGACTGTGGC  293

Query  216  TTCTATTAAGAATGACCCTCCTTCAAGAGATAATAGAGTGGTTGGTTCAGCACGTGCACGGCCCAGTCAATTTC  289
            ..||.||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..|||
Sbjct  294  AGCTGTTAAGAATGACCCTCCCCCGAGAGATAATAGAGTGGTTGGTTCAGCACGCGCACGGCCTAGTCAGCTTC  367

Query  290  CTGAACAGTCTTCCTCTGCACAACAGAATGGTAGTGTTTCAGATATATCTCCAGTTCAAGCTGCAAAAAAGGAA  363
            ||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  368  CTGAGCAATCGTCTTCTGCACAACAGAATGGTAGCGTTTCAGATATATCTCCAGTTCAAGCTGCAAAAAAGGAG  441

Query  364  TTTGGACCCCCTTCACGTAGAAAATCTAATTGTGTGAAAGAAGTAGAAAAACTGCAAGAAAAACGAGAGAAAAG  437
            |||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct  442  TTTGGCCCTCCTTCACGTAGAAAATCCAATTGTGTGAAAGAAGTAGAAAAATTGCAAGAAAAACGAGAAAAAAG  515

Query  438  GAGATTGCAACAGCAAGAACTTAGAGAAAAAAGAGCCCAGGACGTTGATGCTACAAACCCAAATTATGAAATTA  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  516  GAGATTGCAACAGCAAGAACTTAGAGAAAAAAGAGCCCAGGATGTTGATGCTACAAATCCAAATTACGAAATTA  589

Query  512  TGTGTATGATCAGAGACTTTAGAGGAAGTTTGGATTATAGACCATTAACAACAGCAGATCCTATTGATGAACAT  585
            |||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  TGTGTATGATCAGAGACTTCAGAGGGAGCTTGGATTACAGACCCCTAACAACAGCAGATCCTATTGATGAACAT  663

Query  586  AGGATATGTGTGTGTGTAAGAAAACGACCACTCAATAAAAAAGAAACTCAAATGAAAGATCTTGATGTAATCAC  659
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  664  AGGATATGTGTTTGTGTAAGAAAACGACCACTCAATAAAAAAGAAACTCAAATGAAAGATCTTGATGTGATCAC  737

Query  660  AATTCCTAGTAAAGATGTTGTGATGGTACATGAACCAAAACAAAAAGTAGATTTAACAAGGTACCTAGAAAACC  733
            |||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||.|||||||.|
Sbjct  738  AATCCCTAGTAAAGATGTTGTGATGGTCCACGAACCCAAACAGAAAGTAGACTTAACAAGGTACTTAGAAAATC  811

Query  734  AAACATTTCGTTTTGATTATGCCTTTGATGACTCAGCTCCTAATGAAATGGTTTACAGGTTTACTGCTAGACCA  807
            |.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  812  AGACATTTCGGTTTGATTACGCCTTCGATGACTCAGCTCCTAATGAAATGGTTTACAGGTTTACTGCTAGGCCA  885

Query  808  CTAGTGGAAACTATATTTGAAAGGGGAATGGCTACATGCTTTGCTTATGGGCAGACTGGAAGTGGAAAAACTCA  881
            |||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  886  CTAGTGGAAACAATATTTGAAAGGGGCATGGCTACGTGCTTTGCTTATGGGCAGACTGGAAGTGGGAAAACTCA  959

Query  882  TACTATGGGTGGTGACTTTTCAGGAAAGAACCAAGATTGTTCTAAAGGAATTTATGCATTAGCAGCTCGAGATG  955
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  960  TACTATGGGTGGTGACTTTTCAGGAAAGAACCAGGATTGTTCTAAGGGAATTTATGCATTAGCAGCTCGCGATG  1033

Query  956  TCTTTTTAATGCTAAAGAAGCCAAACTATAAGAAGCTAGAACTTCAAGTATATGCAACCTTCTTTGAAATTTAT  1029
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1034  TCTTTTTAATGCTGAAGAAGCCAAACTATAAGAAACTAGAACTTCAAGTATATGCAACATTTTTTGAAATTTAT  1107

Query 1030  AGTGGAAAGGTGTTTGACTTGCTAAACAGGAAAACAAAATTAAGAGTTCTAGAAGATGGAAAACAGCAGGTTCA  1103
            ||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1108  AGTGGAAAGGTGTTTGACTTACTAAATAGGAAAACAAAATTAAGAGTACTAGAAGATGGGAAGCAGCAGGTCCA  1181

Query 1104  AGTGGTGGGATTACAGGAACGGGAGGTCAAATGTGTTGAAGATGTACTGAAACTCATTGACATAGGCAACAGTT  1177
            |||||||||..|.|||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1182  AGTGGTGGGGCTGCAGGAGCGGGAGGTGAAGTGTGTGGAGGACGTGCTGAAGCTCATCGACATAGGCAACAGCT  1255

Query 1178  GCAGAACATCCGGTCAAACATCTGCAAATGCACATTCATCTCGGAGCCATGCAGTGTTTCAGATTATTCTTAGA  1251
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1256  GCAGAACATCTGGCCAAACATCTGCAAATGCACATTCATCTCGGAGCCATGCAGTGTTCCAGATCATTCTAAGA  1329

Query 1252  AGGAAAGGAAAACTACATGGCAAATTTTCTCTCATTGATTTGGCTGGAAATGAAAGAGGAGCTGATACTTCCAG  1325
            |||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1330  AGGAAGGGGAAACTACATGGTAAATTTTCTCTCATTGACCTGGCTGGGAACGAAAGAGGAGCTGATACATCCAG  1403

Query 1326  TGCGGACAGGCAAACTAGGCTTGAAGGTGCTGAAATTAATAAAAGCCTTTTAGCACTCAAGGAGTGCATCAGAG  1399
            |||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1404  TGCAGACAGGCAAACCAGGCTTGAAGGTGCTGAAATTAATAAAAGCCTTTTAGCACTCAAGGAGTGCATCCGAG  1477

Query 1400  CCTTAGGTAGAAATAAACCTCATACTCCTTTCCGTGCAAGTAAACTCACTCAGGTGTTAAGAGATTCTTTCATA  1473
            |||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||.|.||||||||.||||||
Sbjct 1478  CCTTAGGTAGAAACAAACCCCATACGCCTTTCCGAGCGAGCAAACTCACTCAGGTGCTGAGAGATTCCTTCATA  1551

Query 1474  GGTGAAAACTCTCGTACCTGCATGATTGCCACAATCTCTCCAGGAATGGCATCCTGTGAAAATACTCTTAATAC  1547
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  GGTGAAAATTCTCGTACCTGCATGATTGCCACAATCTCTCCAGGAATGGCATCCTGTGAAAATACTCTTAATAC  1625

Query 1548  ATTAAGATATGCAAAT----------------------------------------------------------  1563
            .|||||||||||||||                                                          
Sbjct 1626  GTTAAGATATGCAAATAGAGTAAAGGAGTTTGGAATTAGTCCTTCAGACATTCCCTTCTCCCAGGGTGGTGGCA  1699

Query 1564  --------------------------------------------------------AGGGTCAAAGAATTGACT  1581
                                                                    |||||.||||||||||||
Sbjct 1700  GTCGCCCTGATCTCTCTCCTTCTTACGATTATGACGACTTTTCTCCTTCAATTACCAGGGTGAAAGAATTGACT  1773

Query 1582  GTAGATCCAACTGCTGCTGGTGATGTTCGTCCAATAATGCACCATCCACCAAACCAGATTGATGACTTAGAGAC  1655
            |||.|||||.||||||||||.|||||.|.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1774  GTAAATCCAGCTGCTGCTGGCGATGTCCATCCAATAATGCACCATCCACCGAGCCAGATTGATGACTTAGAGAC  1847

Query 1656  ACAGTGGGGTGTGGGGAGTTCCCCTCAGAGAGATGATCTAAAACTTCTTTGTGAACAAAATGAAGAAGAAGTCT  1729
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1848  ACAGTGGGGTGTGGGGAGTTCTCCTCAGAGAGATGATCTAAAACTTCTCTGTGAACAAAATGAAGAAGAAGTTT  1921

Query 1730  CTCCACAGTTGTTTACTTTCCACGAAGCTGTTTCACAAATGGTAGAAATGGAAGAACAAGTTGTAGAAGATCAC  1803
            ||||||||.||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct 1922  CTCCACAGCTGTTCACTTTCCATGAAGCTGTCTCCCAGATGGTAGAGATGGAAGAGCAGGTTGTGGAAGATCAT  1995

Query 1804  AGGGCAGTGTTCCAGGAATCTATTCGGTGGTTAGAAGATGAAAAGGCCCTCTTAGAGATGACTGAAGAAGTAGA  1877
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  AGGGCAGTGTTCCAGGAATCCATTCGCTGGATAGAAGATGAAAAGGCTCTCCTAGAGATGACTGAAGAAGTAGA  2069

Query 1878  TTATGATGTCGATTCATATGCTACACAACTTGAAGCTATTCTTGAGCAAAAAATAGACATTTTAACTGAACTGC  1951
            .||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|
Sbjct 2070  CTATGATGTAGACTCATATGCTACACAACTTGAAGCTATTCTTGAGCAAAAAATAGACATTTTAACTGAGTTAC  2143

Query 1952  GGGATAAAGTGAAATCTTTCCGTGCAGCTCTACAAGAGGAGGAACAAGCCAGCAAGCAAATCAACCCGAAGAGA  2025
            |.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 2144  GAGATAAAGTGAAATCTTTTCGCGCAGCGCTACAAGAAGAAGAGCAAGCAAGCAAGCAAATTAACCCCAAGAGG  2217

Query 2026  CCCCGTGCCCTT  2037
            |||||.|||||.
Sbjct 2218  CCCCGAGCCCTC  2229