Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10953
- Subject:
- NM_001321121.2
- Aligned Length:
- 2133
- Identities:
- 2120
- Gaps:
- 9
Alignment
Query 1 ATGAAACTTGTCTTCCTCGTCCTGCTGTTCCTCGGGGCCCTCGGACTGTGTCTGGCTGGCAGTAGGAGAAGGAG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||| |||||
Sbjct 1 ATGAAACTTGTCTTCCTCGTCCTGCTGTTCCTCGGGGCCCTCGGACTGTGTCTGGCTGGCCGTAGG---AGGAG 71
Query 75 TGTTCAGTGGTGCGCCGTATCCCAACCCGAGGCCACAAAATGCTTCCAATGGCAAAGGAATATGAGAAAAGTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 72 TGTTCAGTGGTGCGCCGTATCCCAACCCGAGGCCACAAAATGCTTCCAATGGCAAAGGAATATGAGAAAAGTGC 145
Query 149 GTGGCCCTCCTGTCAGCTGCATAAAGAGAGACTCCCCCATCCAGTGTATCCAGGCCATTGCGGAAAACAGGGCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146 GTGGCCCTCCTGTCAGCTGCATAAAGAGAGACTCCCCCATCCAGTGTATCCAGGCCATTGCGGAAAACAGGGCC 219
Query 223 GATGCTGTGACCCTTGATGGTGGTTTCATATACGAGGCAGGCCTGGCCCCCTACAAACTGCGACCTGTAGCGGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 220 GATGCTGTGACCCTTGATGGTGGTTTCATATACGAGGCAGGCCTGGCCCCCTACAAACTGCGACCTGTAGCGGC 293
Query 297 GGAAGTCTACGGGACCGAAAGACAGCCACGAACTCACTATTATGCCGTGGCTGTGGTGAAGAAGGGCGGCAGCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 GGAAGTCTACGGGACCGAAAGACAGCCACGAACTCACTATTATGCCGTGGCTGTGGTGAAGAAGGGCGGCAGCT 367
Query 371 TTCAGCTGAACGAACTGCAATGTCTGAAGTCCTGCCACACAGGCCTTCGCAGGACCGCTGGATGGAATGTCCCT 444
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368 TTCAGCTGAACGAACTGCAAGGTCTGAAGTCCTGCCACACAGGCCTTCGCAGGACCGCTGGATGGAATGTCCCT 441
Query 445 ATAGGGACACTTCGTCCATTCTTGAATTGGACGGGTCCACCTGAGCCCATTGAGGCAGCTGTGGCCAGGTTCTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442 ATAGGGACACTTCGTCCATTCTTGAATTGGACGGGTCCACCTGAGCCCATTGAGGCAGCTGTGGCCAGGTTCTT 515
Query 519 CTCAGCCAGCTGTGTTCCCGGTGCAGATAAAGGACAGTTCCCCAACCTGTGTCGCCTGTGTGCGGGGACAGGGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 CTCAGCCAGCTGTGTTCCCGGTGCAGATAAAGGACAGTTCCCCAACCTGTGTCGCCTGTGTGCGGGGACAGGGG 589
Query 593 AAAACAAATGTGCCTTCTCCTCCCAGGAACCGTACTTCAGCTACTCTGGTGCCTTCAAGTGTCTGAGAGACGGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 AAAACAAATGTGCCTTCTCCTCCCAGGAACCGTACTTCAGCTACTCTGGTGCCTTCAAGTGTCTGAGAGACGGG 663
Query 667 GCTGGAGACGTGGCTTTTATCAGAGAGAGCACAGTGTTTGAGGACCTGTCAGACGAGGCTGAAAGGGACGAGTA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 GCTGGAGACGTGGCTTTTATCAGAGAGAGCACAGTGTTTGAGGACCTGTCAGACGAGGCTGAAAGGGACGAGTA 737
Query 741 TGAGTTACTCTGCCCAGACAACACTCGGAAGCCAGTGGACAAGTTCAAAGACTGCCATCTGGCCCGGGTCCCTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 TGAGTTACTCTGCCCAGACAACACTCGGAAGCCAGTGGACAAGTTCAAAGACTGCCATCTGGCCCGGGTCCCTT 811
Query 815 CTCATGCCGTTGTGGCACGAAGTGTGAATGGCAAGGAGGATGCCATCTGGAATCTTCTCCGCCAGGCACAGGAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 CTCATGCCGTTGTGGCACGAAGTGTGAATGGCAAGGAGGATGCCATCTGGAATCTTCTCCGCCAGGCACAGGAA 885
Query 889 AAGTTTGGAAAGGACAAGTCACCGAAATTCCAGCTCTTTGGCTCCCCTAGTGGGCAGAAAGATCTGCTGTTCAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 AAGTTTGGAAAGGACAAGTCACCGAAATTCCAGCTCTTTGGCTCCCCTAGTGGGCAGAAAGATCTGCTGTTCAA 959
Query 963 GGACTCTGCCATTGGGTTTTCGAGGGTGCCCCCGAGGATAGATTCTGGGCTGTACCTTGGCTCCGGCTACTTCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 GGACTCTGCCATTGGGTTTTCGAGGGTGCCCCCGAGGATAGATTCTGGGCTGTACCTTGGCTCCGGCTACTTCA 1033
Query 1037 CTGCCATCCAGAACTTGAGGAAAAGTGAGGAGGAAGTGGCTGCCCGGCGTGCGCGGGTCGTGTGGTGTGCGGTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 CTGCCATCCAGAACTTGAGGAAAAGTGAGGAGGAAGTGGCTGCCCGGCGTGCGCGGGTCGTGTGGTGTGCGGTG 1107
Query 1111 GGCGAGCAGGAGCTGCGCAAGTGTAACCAGTGGAGTGGCTTGAGCGAAGGCAGCGTGACCTGCTCCTCGGCCTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 GGCGAGCAGGAGCTGCGCAAGTGTAACCAGTGGAGTGGCTTGAGCGAAGGCAGCGTGACCTGCTCCTCGGCCTC 1181
Query 1185 CACCACAGAGGACTGCATCGCCCTGGTGCTGAAAGGAGAAGCTGATGCCATGAGTTTGGATGGAGGATATGTGT 1258
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 CACCACAGAGGACTGCATCGCC------CTGAAAGGAGAAGCTGATGCCATGAGTTTGGATGGAGGATATGTGT 1249
Query 1259 ACACTGCAGGCAAATGTGGTTTGGTGCCTGTCCTGGCAGAGAACTACAAATCCCAACAAAGCAGTGACCCTGAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250 ACACTGCAGGCAAATGTGGTTTGGTGCCTGTCCTGGCAGAGAACTACAAATCCCAACAAAGCAGTGACCCTGAT 1323
Query 1333 CCTAACTGTGTGGATAGACCTGTGGAAGGATATCTTACTGTGGCGGTGGTTAGGAGATCAGACACTAGCCTTAC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 CCTAACTGTGTGGATAGACCTGTGGAAGGATATCTTGCTGTGGCGGTGGTTAGGAGATCAGACACTAGCCTTAC 1397
Query 1407 CTGGAACTCTGTGAAAGGCAAGAAGTCCTGCCACACCGCCGTGGACAGGACTGCAGGCTGGAATATCCCCATGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398 CTGGAACTCTGTGAAAGGCAAGAAGTCCTGCCACACCGCCGTGGACAGGACTGCAGGCTGGAATATCCCCATGG 1471
Query 1481 GCCTGCTCTTCAACCAGACGGGCTCCTGCAAATTTGATGAATATTTCAGTCAAAGCTGTGCCCCTGGGTCTGAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472 GCCTGCTCTTCAACCAGACGGGCTCCTGCAAATTTGATGAATATTTCAGTCAAAGCTGTGCCCCTGGGTCTGAC 1545
Query 1555 CCGAGATCTAATCTCTGTGCTCTGTGTATTGGCGACGAGCAGGGTGAGAATAAGTGCGTGCCCAACAGCAACGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546 CCGAGATCTAATCTCTGTGCTCTGTGTATTGGCGACGAGCAGGGTGAGAATAAGTGCGTGCCCAACAGCAACGA 1619
Query 1629 GAGATACTACGGCTACACTGGGGCTTTCCGGTGCCTGGCTGAGAATGCTGGAGACGTTGCATTTGTGAAAGATG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 GAGATACTACGGCTACACTGGGGCTTTCCGGTGCCTGGCTGAGAATGCTGGAGACGTTGCATTTGTGAAAGATG 1693
Query 1703 TCACTGTCTTGCAGAACACTGATGGAAATAACAATGAGGCATGGGCTAAGGATTTGAAGCTGGCAGACTTTGCG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694 TCACTGTCTTGCAGAACACTGATGGAAATAACAATGAGGCATGGGCTAAGGATTTGAAGCTGGCAGACTTTGCG 1767
Query 1777 CTGCTGTGCCTCGATGGCAAACGGAAGCCTGTGACTGAGGCTAGAAGCTGCCATCTTGCCATGGCCCCGAATCA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768 CTGCTGTGCCTCGATGGCAAACGGAAGCCTGTGACTGAGGCTAGAAGCTGCCATCTTGCCATGGCCCCGAATCA 1841
Query 1851 TGCCGTGGTGTCTCGGATGGATAAGGTGGAACGCCTGAAACAGGTGTTGCTCCACCAACAGGCTAAATTTGGGA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842 TGCCGTGGTGTCTCGGATGGATAAGGTGGAACGCCTGAAACAGGTGTTGCTCCACCAACAGGCTAAATTTGGGA 1915
Query 1925 GAAATGGATCTGACTGCCCGGACAAGTTTTGCTTATTCCAGTCTGAAACCAAAAACCTTCTGTTCAATGACAAC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916 GAAATGGATCTGACTGCCCGGACAAGTTTTGCTTATTCCAGTCTGAAACCAAAAACCTTCTGTTCAATGACAAC 1989
Query 1999 ACTGAGTGTCTGGCCAGACTCCATGGCAAAACAACATATGAAAAATATTTGGGGCCACAGTATGTCGCAGGCAT 2072
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1990 ACTGAGTGTCTGGCCAGACTCCATGGCAAAACAACATATGAAAAATATTTGGGACCACAGTATGTCGCAGGCAT 2063
Query 2073 TACTAATCTGAAAAAGTGCTCAACCTCCCCCCTCCTGGAAGCCTGTGAATTCCTCAGGAAG 2133
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2064 TACTAATCTGAAAAAGTGCTCAACCTCCCCCCTCCTGGAAGCCTGTGAATTCCTCAGGAAG 2124