Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10962
• Subject: XM_011250814.2
• Aligned Length: 1504
• Identities: 1101
• Gaps: 278

Alignment

Query    1  ---------------------------------ATGGATGAAAGGAACCGACAG---ACTTTAAGAAA--GAAA  36
                                             ||||||||.||||||||||||   |||||.|.|||  ||||
Sbjct    1  ATGGGGCGAAAGAAGATACAAATCACACGCATAATGGATGAGAGGAACCGACAGGTTACTTTTACAAAGCGAAA  74

Query   37  G------------------GCCTTAATG------GT------TGTG--------AGAGCCCTGAT---------  63
            |                  ||||  |||      ||      ||||        |.|||.||.||         
Sbjct   75  GTTTGGATTGATGAAGAAAGCCT--ATGAACTCAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAA  146

Query   64  ------------GCTG-------ACG------ATTACTTTGAGCACAGTC-----------CACT---------  92
                        ||||       |||      .|.||.|.|| ||.||||           ||||         
Sbjct  147  CAGCTCTAATAAGCTGTTTCAGTACGCTAGCACTGACATGGA-CAAAGTCCTTCTCAAATACACTGAGTATAAC  219

Query   93  -----------------------CTCG---------GAGG------------------ACAGA-----------  105
                                   ||||         ||||                  |||||           
Sbjct  220  GAGCCTCATGAAAGCAGGACGAACTCGGATATCGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAACACAGAGGGTGCGACAG  293

Query  106  ---------------TTCA-----GCAAACT--AAAT---GAAGA---------------TAGTG----ATTTT  135
                           ||||     ||.||||  |.||   |||||               ||.||    ||||.
Sbjct  294  CCCAGACCCTGATACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGAATTTG  367

Query  136  ATTTTCAA-ACGAGG--------------CCCTCCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGT  194
            ||    || |.||.|              |.|.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  368  AT----AATATGATGCGGAATCATAAAATCGCACCTGGCTTGCCACCTCAGAACTTCTCAATGTCTGTCACAGT  437

Query  195  TCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCA  268
            .||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  438  CCCTGTGACCAGCCCTAATGCTTTGTCGTACACTAACCCAGGGAGTTCACTCGTGTCACCGTCTTTGGCAGCCA  511

Query  269  GCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCT  342
            |||||||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.|.|.||||..||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  512  GCTCAACATTAGCAGATTCGAGCATGCTGTCTCCACCCCCAGCCACGCTACATAGAAATGTGTCCCCAGGAGCT  585

Query  343  CCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGC  416
            ||.|||||||||||||||||.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  586  CCGCAGAGACCACCAAGTACCGGCAGTGCAAGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACGGTGCCAAATGGAGC  659

Query  417  TGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAA  490
            |||||..|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct  660  TGGAAATAGTCCTGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGGGCCTCTCCAAATTTGATTGGAAATACTGGTGCAA  733

Query  491  ATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGG  564
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||||||||.||
Sbjct  734  ATAGTTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCGCCACCAGGTGGTGGCAGTCTTGGAATGAACAGTCGG  807

Query  565  AAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTAAACACCCAAAGGATCAG  638
            |||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||..||||||||||.||
Sbjct  808  AAACCAGATCTACGAGTTGTCATTCCCCCATCAAGCAAGGGCATGATGCCCCCACTTAATGCCCAAAGGATAAG  881

Query  639  TAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGAC  712
            .||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  882  CAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCCACGCCTGTAGTGTCTGTGACAACTCCGAGCTTGCCTCCACAGGGAC  955

Query  713  TTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAA  786
            |.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  956  TAGTGTACTCAGCAATGCCGACAGCCTACAACACTGATTACTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCTGCCCTGCAA  1029

Query  787  GGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGC  860
            |||||.|..||.||.|||||||||||.|||||.||||..||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1030  GGCTTTACTTCCCCTGGAATGCTGTCTCTGGGGCAGGCTTCAGCCTGGCAGCAGCACCATCTAGGACAAGCAGC  1103

Query  861  CCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCA  934
            ||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1104  CCTCAGCTCTCTGGTGGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCAAATTTGTCCATTAACACCAACCAGAACATCA  1177

Query  935  GCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAG  1008
            .|||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||.|.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||| 
Sbjct 1178  ACATTAAGTCAGAGCCAATTTCACCTCCCCGTGATAGAATGACCCCATCAGGCTTCCAACAGCAGCAGCAGCA-  1250

Query 1009  CAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAAT  1082
                                |||||.||.||||||.|.|||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1251  --------------------GCCACAACAGCAGCCACCGCCACAACCTCCACAGCCCCAACCCCGGCAGGAAAT  1304

Query 1083  GGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGG  1156
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1305  GGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCCAGCAGCTCCTATGATGGCAGTGACCGGGAGGATCCACGGG  1378

Query 1157  GCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGA  1230
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1379  GTGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCTCCAAATACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAACGC  1452

Query 1231  ATGAGGATGGACGCGTGGGTGACC  1254
            ||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 1453  ATGAGGATGGACACATGGGTGACC  1476