Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10962
- Subject:
- XM_011521573.2
- Aligned Length:
- 1538
- Identities:
- 1226
- Gaps:
- 289
Alignment
Query 1 ---------------------------------ATGGATGAAAGGAACCGACAG---ACTTT----AAGA---- 30
||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 1 ATGGGGCGGAAGAAAATACAAATCACACGCATAATGGATGAAAGGAACCGACAGGTCACTTTTACAAAGAGAAA 74
Query 31 -------------AAGAAAGGC------CTTAATG------GT---TGTGA----------------------- 53
|||||||.| ||||.|| || |||||
Sbjct 75 GTTTGGATTAATGAAGAAAGCCTATGAACTTAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA 148
Query 54 -------------------------GAGCCCTGATGCTGACGA--TTACTT--------------------TG- 79
.|||.|||||...|||.| || ||| ||
Sbjct 149 GCTCTAACAAACTGTTTCAATATGCTAGCACTGATATGGACAAAGTT-CTTCTCAAGTATACAGAATATAATGA 221
Query 80 ----------AGCACAGTCCACT---------------CTC----------GGAGGACAGA------------- 105
||||.|..|.||| ||| |||..|||||
Sbjct 222 ACCTCATGAAAGCAGAACCAACTCGGATATTGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAACACAGAGGGTGCGACAGCC 295
Query 106 -------------TTCA-----GCAAACT--AAAT---GAAGA---------------TAGTG----ATTTTAT 137
|||| ||.|||| |.|| ||||| ||.|| ||||.||
Sbjct 296 CAGACCCTGATACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGAATTTGAT 369
Query 138 TTTCAA-ACGAGGC-----CCT---------------------CCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGT 184
|| |.||.|| |.| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 ----AATATGATGCGGAATCATAAAATCGCAGTGAGTACTAAACCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGT 439
Query 185 CTGTCACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCT 258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440 CTGTCACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCT 513
Query 259 TTGGCAGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTC 332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514 TTGGCAGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTC 587
Query 333 TCCTGGAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGC 406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 588 TCCTGGAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGC 661
Query 407 CAAATGGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 CAAATGGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCT 735
Query 481 ACTGGTGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAAT 554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 736 ACTGGTGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAAT 809
Query 555 GAACAGTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTA------- 621
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 810 GAACAGTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTATCGGAGG 883
Query 622 -----------------AACACCCAAAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTG 678
||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 884 AAGAGGAATTGGAGTTGAATACCCAGAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTG 957
Query 679 TCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTA 752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 TCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTA 1031
Query 753 TTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGT 826
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 TTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGT 1105
Query 827 CGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106 CGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGT 1179
Query 901 TCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTAT 974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180 TCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTAT 1253
Query 975 GACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGC 1048
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 GACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGC 1327
Query 1049 CACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGC 1122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328 CACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGC 1401
Query 1123 TCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAA 1196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402 TCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAA 1475
Query 1197 CACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTGACC 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476 CACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTGACC 1533