Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10962
- Subject:
- XM_011521585.2
- Aligned Length:
- 1337
- Identities:
- 1202
- Gaps:
- 91
Alignment
Query 1 ---------------------------------ATGGATGAAAGGAACCGACAGACTTT----AAGAAAGAAAG 37
|||||||||||||||||||||.||.| |||||.|||
Sbjct 1 ATGGGGCGGAAGAAAATACAAATCACACGCATAATGGATGAAAGGAACCGACAGGCTCTGAACAAGAAGGAA-- 72
Query 38 GCCTTAATGGTTGTGAGAGCCCTGATGCTGACGATTACTT----TGAGCACAGTCCACTCTCGGAGGACAGATT 107
|..|..||.||.||.|||||.||..|||| ||||| ||.||..|.|||||...|.||.||.|.||.
Sbjct 73 --CACAGAGGGTGCGACAGCCCAGACCCTGA----TACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATA 140
Query 108 CAGCAAACTAAATGAAGATAGTGATTTTAT-----------TTTCAAACG-AG---GCCCT---CCTGGTCTGC 163
.|..|||.|.|||||.||...||||..||| .|..||.|| || |..|| ||||||||||
Sbjct 141 TAAAAAAATTAATGAGGAATTTGATAATATGATGCGGAATCATAAAATCGCAGTGAGTACTAAACCTGGTCTGC 214
Query 164 CACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGG 237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 215 CACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGG 288
Query 238 AGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAAC 311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 AGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAAC 362
Query 312 CACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGA 385
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 CACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGA 436
Query 386 GCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCT 459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 437 GCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCT 510
Query 460 TCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACC 533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 511 TCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACC 584
Query 534 AGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCA 607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 585 AGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCA 658
Query 608 TGATGCCTCCACTA------------------------AACACCCAAAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAA 657
|||||||||||||| ||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 TGATGCCTCCACTATCGGAGGAAGAGGAATTGGAGTTGAATACCCAGAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAA 732
Query 658 CCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCC 731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 733 CCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCC 806
Query 732 GACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAA 805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807 GACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAA 880
Query 806 TGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCT 879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 TGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCT 954
Query 880 GGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGAT 953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 GGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGAT 1028
Query 954 TTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGC 1027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 TTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGC 1102
Query 1028 CGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGAC 1101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103 CGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGAC 1176
Query 1102 AGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAAT 1175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177 AGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAAT 1250
Query 1176 TGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGG 1249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 TGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGG 1324
Query 1250 TGACC 1254
|||||
Sbjct 1325 TGACC 1329