Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10962
- Subject:
- XM_017022195.1
- Aligned Length:
- 1310
- Identities:
- 1199
- Gaps:
- 73
Alignment
Query 1 ---------------------------------ATGGATGAAAGGAACCGACAGACTTT----AAGAAAGAAAG 37
|||||||||||||||||||||.||.| |||||.|||
Sbjct 1 ATGGGGCGGAAGAAAATACAAATCACACGCATAATGGATGAAAGGAACCGACAGGCTCTGAACAAGAAGGAA-- 72
Query 38 GCCTTAATGGTTGTGAGAGCCCTGATGCTGACGATTACTT----TGAGCACAGTCCACTCTCGGAGGACAGATT 107
|..|..||.||.||.|||||.||..|||| ||||| ||.||..|.|||||...|.||.||.|.||.
Sbjct 73 --CACAGAGGGTGCGACAGCCCAGACCCTGA----TACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATA 140
Query 108 CAGCAAACTAAATGAAGATAGTGATTTTATTTTCAA-ACGAGG--------------CCCTCCTGGTCTGCCAC 166
.|..|||.|.|||||.|| ||||.|| || |.||.| |.|.|||||||||||||
Sbjct 141 TAAAAAAATTAATGAGGA-----ATTTGAT----AATATGATGCGGAATCATAAAATCGCACCTGGTCTGCCAC 205
Query 167 CTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 206 CTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGT 279
Query 241 TCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCAC 314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 280 TCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCAC 353
Query 315 ATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCA 388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 354 ATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCA 427
Query 389 CTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCT 462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 428 CTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCT 501
Query 463 CCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGG 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 502 CCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGG 575
Query 537 TGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGA 610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 576 TGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGA 649
Query 611 TGCCTCCACTAAACACCCAAAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTG 684
|||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 650 TGCCTCCACTAAATACCCAGAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTG 723
Query 685 ACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACT 758
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 724 ACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACT 797
Query 759 GACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCT 832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 798 GACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCT 871
Query 833 GGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAAT 906
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 872 GGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAAT 945
Query 907 TTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCC 980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 946 TTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCC 1019
Query 981 ATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAAC 1054
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 ATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAAC 1093
Query 1055 CCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTAT 1128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1094 CCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTAT 1167
Query 1129 GATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGA 1202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1168 GATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGA 1241
Query 1203 GGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTGACC 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1242 GGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTGACC 1293