Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11015
• Subject: XM_017010908.1
• Aligned Length: 1566
• Identities: 1094
• Gaps: 462

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTTTACAGCCAGAGTCACTTTCAACAGTGATAACTGTACTTACTCTTTGAAGAACTCTGAGCCGCAGCCTGA  74

Query    1  ----------------------------------------ATGATAGTGTTTGTCAGGTTCAACTCCAGCCATG  34
                                                    ||.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATCAGGGAGGTTATATACTAGGCCAGAAAGAGAATATCCAATTACAGTGTTTGTCAGGTTCAACTCCAGCCATG  148

Query   35  GTTTCCCAGTGGAGGTCGATTCTGACACCAGCATCTTCCAGCTCAAGGAGGTGGTTGCTAAGCGACAGGGGGTT  108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTTTCCCAGTGGAGGTCGATTCTGACACCAGCATCTTCCAGCTCAAGGAGGTGGTTGCTAAGCGACAGGGGGTT  222

Query  109  CCGGCTGACCAGTTGCGTGTGATTTTCGCAGGGAAGGAGCTGAGGAATGACTGGACTGTGCAGAATTGTGACCT  182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCGGCTGACCAGTTGCGTGTGATTTTCGCAGGGAAGGAGCTGAGGAATGACTGGACTGTGCAGAATTGTGACCT  296

Query  183  GGATCAGCAGAGCATTGTTCACATTGTGCAGAGACCGTGGAGAAAAGGTCAAGAAATGAATGCAACTGGAGGCG  256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGATCAGCAGAGCATTGTTCACATTGTGCAGAGACCGTGGAGAAAAGGTCAAGAAATGAATGCAACTGGAGGCG  370

Query  257  ACGACCCCAGAAACGCGGCGGGAGGCTGTGAGCGGGAGCCCCAGAGCTTGACTCGGGTGGACCTCAGCAGCTCA  330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACGACCCCAGAAACGCGGCGGGAGGCTGTGAGCGGGAGCCCCAGAGCTTGACTCGGGTGGACCTCAGCAGCTCA  444

Query  331  GTCCTCCCAGGAGACTCTGTGGGGCTGGCTGTCATTCTGCACACTGACAGCAGGAAGGACTCACCACCAGCTGG  404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTCCTCCCAGGAGACTCTGTGGGGCTGGCTGTCATTCTGCACACTGACAGCAGGAAGGACTCACCACCAGCTGG  518

Query  405  AAGTCCAGCAGGTAGATCAATCTACAACAGCTTTTATGTGTATTGTAAAGGCCCCTGTCAAAGAGTGCAGCCGG  478
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGTCCAGCAGGTAGATCAATCTACAACAGCTTTTATGTGTATTGCAAAGGCCCCTGTCAAAGAGTGCAGCCGG  592

Query  479  GGAAACTCAGGGTACAGTGCAGCACCTGCAGGCAGGCAACGCTCACCTTGACCCAGGGTCCATCTTGCTGGGAT  552
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAAACTCAGGGTACAGTGCAGCACCTGCAGGCAGGCAACGCTCACCTTGACCCAGGGTCCATCTTGCTGGGAT  666

Query  553  GATGTTTTAATTCCAAACCGGATGAGTGGTGAATGCCAATCCCCACACTGCCCTGGGACTAGTGCAGAATTTTT  626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATGTTTTAATTCCAAACCGGATGAGTGGTGAATGCCAATCCCCACACTGCCCTGGGACTAGTGCAGAATTTTT  740

Query  627  CTTTAAATGTGGAGCACACCCCACCTCTGACAAGGAAACATCAGTAGCTTTGCACCTGATCGCAACAAATAGTC  700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTTAAATGTGGAGCACACCCCACCTCTGACAAGGAAACATCAGTAGCTTTGCACCTGATCGCAACAAATAGTC  814

Query  701  GGAACATCACTTGCATTACGTGCACAGACGTCAGGAGCCCCGTCCTGGTTTTCCAGTGCAACTCCCGCCACGTG  774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGAACATCACTTGCATTACGTGCACAGACGTCAGGAGCCCCGTCCTGGTTTTCCAGTGCAACTCCCGCCACGTG  888

Query  775  ATTTGCTTAGACTGTTTCCACTTATACTGTGTGACAAGACTCAATGATCGGCAGTTTGTTCACGACCCTCAACT  848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTTGCTTAGACTGTTTCCACTTATACTGTGTGACAAGACTCAATGATCGGCAGTTTGTTCACGACCCTCAACT  962

Query  849  TGGCTACTCCCTGCCTTGTGTGGGAACTGGAGACACAGTGGTGCTTAGAGGAGCTCTGGGGGGATTCAGGAGAG  922
            ||||||||||||||||||||||                                                    
Sbjct  963  TGGCTACTCCCTGCCTTGTGTG----------------------------------------------------  984

Query  923  GAGTCGCTGGCTGTCCCAACTCCTTGATTAAAGAGCTCCATCACTTCAGGATTCTGGGAGAAGAGCAGTACAAC  996
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  985  -----GCTGGCTGTCCCAACTCCTTGATTAAAGAGCTCCATCACTTCAGGATTCTGGGAGAAGAGCAGTACAAC  1053

Query  997  CGGTACCAGCAGTATGGTGCAGAGGAGTGTGTCCTGCAGATGGGGGGCGTGTTATGCCCCCGCCCTGGCTGTGG  1070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1054  CGGTACCAGCAGTATGGTGCAGAGGAGTGTGTCCTGCAGATGGGGGGCGTGTTATGCCCCCGCCCTGGCTGTGG  1127

Query 1071  AGCGGGGCTGCTGCCGGAGCCTGACCAGAGGAAAGTCACCTGCGAAGGGGGCAATGGCCTGGGCTGTGGGTAT-  1143
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.| 
Sbjct 1128  AGCGGGGCTGCTGCCGGAGCCTGACCAGAGGAAAGTCACCTGCGAAGGGGGCAATGGCCTGGGCTGTGGGTTTG  1201

Query 1144  ----------GGA---CAACGAAG---AACAAAA----------------------------------------  1161
                      |||   .||.||||   |.||..|                                        
Sbjct 1202  CCTTCTGCCGGGAATGTAAAGAAGCGTACCATGAAGGGGAGTGCAGTGCCGTATTTGAAGCCTCAGGAACAACT  1275

Query 1162  --------------------------------------------------------------------------  1161
                                                                                      
Sbjct 1276  ACTCAGGCCTACAGAGTCGATGAAAGAGCCGCCGAGCAGGCTCGTTGGGAAGCAGCCTCCAAAGAAACCATCAA  1349

Query 1162  --------------------------------------------------------------------------  1161
                                                                                      
Sbjct 1350  GAAAACCACCAAGCCCTGTCCCCGCTGCCATGTACCAGTGGAAAAAAATGGAGGCTGCATGCACATGAAGTGTC  1423

Query 1162  --------------------------------------------------------------------------  1161
                                                                                      
Sbjct 1424  CGCAGCCCCAGTGCAGGCTCGAGTGGTGCTGGAACTGTGGCTGCGAGTGGAACCGCGTCTGCATGGGGGACCAC  1497

Query 1162  ------------  1161
                        
Sbjct 1498  TGGTTCGACGTG  1509