Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11022
- Subject:
- XM_006527570.1
- Aligned Length:
- 1488
- Identities:
- 1239
- Gaps:
- 144
Alignment
Query 1 ATGGATCGGATGAAGAAGATCAAACGGCAGCTGTCAATGA---------------------------------- 40
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATCGGATGAAGAAGATCAAACGGCAGCTGTCAATGACACTCCGAGGGGGCCGAGGCATAGATAAGACCAA 74
Query 41 -------------------------------------------------------------------------- 40
Sbjct 75 TGGTGTCCCTGAGCAGATAGGCCTGGATGAGAGTGGTGGCGGTGGTGGCAGTGACCTTGGAGAAGCTCCCACCC 148
Query 41 ------------------------------------CACTCAGCTCTGCACCAGAGATTGTGCACGAGGACTTG 78
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 149 GTATTGCCCCTGGGGAGCTTCGCTCTGTTCGGGGCCCACTCAGCTCTGCACCAGAGATTGTGCACGAGGACATG 222
Query 79 AAGATGGGGTCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGTGCAGTCTCCAGTGAGAGT 152
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGATGGGATCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACATCCTCAGATGAGGTGCAGTCTCCAGTGAGAGT 296
Query 153 GCGTATGCGCAACCATCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCCTATCACTACCAGCTGACA 226
|||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 297 GCGCATGCGCAACCACCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAACGCCTGTCACTACCAGCTGACA 370
Query 227 TCCGGCTGCCTGAGGGCTACCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGACAAGCCCCTCAGCCGCCGC 300
|.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 371 TACGGCTGCCTGAGGGCTACCTTGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGATAAGCCTCTTAGCCGGCGC 444
Query 301 CTCCGTCGTGTCAGCCTATCTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAAGCTGGACAAACTGGGCGA 374
|||||.||.|||||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct 445 CTCCGCCGAGTCAGTTTGTCTGAGATTGGCTTTGGAAAACTGGAGACCTACATCAAGCTAGACAAGCTGGGTGA 518
Query 375 GGGTACCTATGCCACCGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGGCACTCAAGGAGATCAGAC 448
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 519 GGGTACCTATGCCACTGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTAGCACTTAAGGAGATCAGAC 592
Query 449 TGGAACATGAAGAGGGGGCACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTGCTCAAGGACCTCAAACACGCCAAC 522
|||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 593 TGGAACACGAAGAAGGGGCACCCTGTACTGCTATCCGGGAAGTATCCCTGCTTAAGGACCTCAAGCATGCCAAC 666
Query 523 ATCGTTACGCTACATGACATTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGAGTACCTGGACAAGGACCT 596
|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct 667 ATCGTCACACTACATGACATTATCCACACAGAGAAGTCCCTCACACTTGTCTTTGAATACTTGGACAAGGACCT 740
Query 597 GAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGTTCCTGTTCCAGCTGCTCC 670
||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 741 GAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGAAATGTCATCAACATGCACAATGTGAAACTGTTCCTGTTCCAGTTGCTCC 814
Query 671 GTGGCCTGGCCTACTGCCACCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTGCTCATCAACGAG 744
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 815 GTGGCCTGGCCTACTGCCACAGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTACTCATCAACGAG 888
Query 745 AGGGGAGAGCTCAAGCTGGCTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAACAAAGACATACTCCAATGA 818
||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct 889 AGGGGAGAGCTCAAACTGGCAGATTTTGGCCTGGCTCGTGCCAAGTCAATTCCTACTAAAACATACTCCAACGA 962
Query 819 GGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACTCCACTCAGATTGACATGT 892
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 963 AGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTACTTGGGTCCACAGACTACTCTACCCAAATTGACATGT 1036
Query 893 GGGGTGTGGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGCTCCACGGTGGAGGAACAG 966
|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1037 GGGGTGTAGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACCGGCCGGCCCCTCTTCCCAGGCTCCACAGTGGAAGAACAG 1110
Query 967 CTACACTTCATCTTCCGTATCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCATCCTGTCCAACGAGGAGTT 1040
||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1111 CTGCACTTCATCTTCCGCATTTTGGGAACCCCAACTGAGGAGACATGGCCAGGTATCCTGTCCAATGAGGAGTT 1184
Query 1041 CAAGACATACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCCGACTTGATAGCGACGGGG 1114
.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1185 TAGAACATACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTCTGAGCCATGCACCCCGACTTGATAGCGATGGAG 1258
Query 1115 CCGACCTCCTCACCAAGCTGTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAGGATGCCATGAAACATCCA 1188
|.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 1259 CTGACCTCCTCACCAAGCTGCTGCAGTTTGAGGGTCGCAATCGGATCTCTGCTGAGGATGCCAGGAAACATCCA 1332
Query 1189 TTCTTCCTCAGTCTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACTAAAGGAGATTCA 1262
|||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 1333 TTCTTTCTCAGCTTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACTAAAGGAGGTACA 1406
Query 1263 GCTACAAAAGGAGGCCAGCCTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAGGCAGGCCAGCTTTCCGCGTGGTGGACA 1336
|||||||||||||||||.|.|||||||..|.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1407 GCTACAAAAGGAGGCCAACATTCGGTCCACTTCTATGCCTGACTCAGGCAGGCCAGCTTTCCGTGTGGTGGATA 1480
Query 1337 CCGAGTTC 1344
||||||||
Sbjct 1481 CCGAGTTC 1488