Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11022
• Subject: XM_011543921.1
• Aligned Length: 1648
• Identities: 1326
• Gaps: 320

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCGCGTCCCCTCCCGCTGCGGACGGGTCCTTTGGTACATGCAGTCCGAGTCACTATTCCAGGTCCTCAGG  74

Query    1  -------------------------------------------------------------------ATGGATC  7
                                                                               |||||||
Sbjct   75  ATATAGCCGTGACCTAAACACAGAAATCTACCCTGGCGGAGCTGATCTTCTAGTTGTGGCGATCGCCATGGATC  148

Query    8  GGATGAAGAAGATCAAACGGCAGCTGTCAATGA-----------------------------------------  40
            |||||||||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct  149  GGATGAAGAAGATCAAACGGCAGCTGTCAATGACACTCCGAGGTGGCCGAGGCATAGACAAGACCAATGGTGCC  222

Query   41  --------------------------------------------------------------------------  40
                                                                                      
Sbjct  223  CCTGAGCAGATAGGCCTGGATGAGAGTGGTGGTGGTGGCGGCAGTGACCCTGGAGAGGCCCCCACACGTGCTGC  296

Query   41  -----------------------------CACTCAGCTCTGCACCAGAGATTGTGCACGAGGACTTGAAGATGG  85
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCTGGGGAACTTCGTTCTGCACGGGGCCCACTCAGCTCTGCACCAGAGATTGTGCACGAGGACTTGAAGATGG  370

Query   86  GGTCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGTGCAGTCTCCAGTGAGAGTGCGTATG  159
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGTCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGTGCAGTCTCCAGTGAGAGTGCGTATG  444

Query  160  CGCAACCATCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCCTATCACTACCAGCTGACATCCGGCT  233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGCAACCATCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCCTATCACTACCAGCTGACATCCGGCT  518

Query  234  GCCTGAGGGCTACCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGACAAGCCCCTCAGCCGCCGCCTCCGTC  307
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCTGAGGGCTACCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGACAAGCCCCTCAGCCGCCGCCTCCGTC  592

Query  308  GTGTCAGCCTATCTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAAGCTGGACAAACTGGGCGAGGGTACC  381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGTCAGCCTATCTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAAGCTGGACAAACTGGGCGAGGGTACC  666

Query  382  TATGCCACCGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGGCACTCAAGGAGATCAGACTGGAACA  455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATGCCACCGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGGCACTCAAGGAGATCAGACTGGAACA  740

Query  456  TGAAGAGGGGGCACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTGCTCAAGGACCTCAAACACGCCAACATCGTTA  529
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAAGAGGGGGCACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTGCTCAAGGACCTCAAACACGCCAACATCGTTA  814

Query  530  CGCTACATGACATTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGAGTACCTGGACAAGGACCTGAAGCAG  603
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGCTACATGACATTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGAGTACCTGGACAAGGACCTGAAGCAG  888

Query  604  TACCTGGATGACTGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGTTCCTGTTCCAGCTGCTCCGTGGCCT  677
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACCTGGATGACTGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGTTCCTGTTCCAGCTGCTCCGTGGCCT  962

Query  678  GGCCTACTGCCACCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTGCTCATCAACGAGAGGGGAG  751
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCCTACTGCCACCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTGCTCATCAACGAGAGGGGAG  1036

Query  752  AGCTCAAGCTGGCTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAACAAAGACATACTCCAATGAGGTGGTG  825
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCTCAAGCTGGCTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAACAAAGACATACTCCAATGAGGTGGTG  1110

Query  826  ACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACTCCACTCAGATTGACATGTGGGGTGT  899
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACTCCACTCAGATTGACATGTGGGGTGT  1184

Query  900  GGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGCTCCACGGTGGAGGAACAGCTACACT  973
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGCTCCACGGTGGAGGAACAGCTACACT  1258

Query  974  TCATCTTCCGTATCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCATCCTGTCCAACGAGGAGTTCAAGACA  1047
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCATCTTCCGTATCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCATCCTGTCCAACGAGGAGTTCAAGACA  1332

Query 1048  TACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCCGACTTGATAGCGACGGGGCCGACCT  1121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCCGACTTGATAGCGACGGGGCCGACCT  1406

Query 1122  CCTCACCAAGCTGTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAGGATGCCATGAAACATCCATTCTTCC  1195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCTCACCAAGCTGTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAGGATGCCATGAAACATCCATTCTTCC  1480

Query 1196  TCAGTCTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACTAAAGGAGATTCAGCTACAA  1269
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCAGTCTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACTAAAGGAGATTCAGCTACAA  1554

Query 1270  AAGGAGGCCAGCCTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAGGCAGGCCAGCTTTCCGCGTGGTGGACA------C  1337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||.||    ||||||||      |
Sbjct 1555  AAGGAGGCCAGCCTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAG----------TTGCC----GGTGGACAGCATGGC  1614

Query 1338  CGAGTTC-------------  1344
            |  ||.|             
Sbjct 1615  C--GTGCCAGCCTCCCACAC  1632