Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11033
• Subject: NM_002669.4
• Aligned Length: 1542
• Identities: 1513
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGGTCGAGGAGGTACAGAAACATTCTGTACACACCCTTGTGTTCAGGTCGTTGAAGAGGACCCATGACATGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCGAGGAGGTACAGAAACATTCTGTACACACCCTTGTGTTCAGGTCGTTGAAGAGGACCCATGACATGTT  74

Query   75  TGTAGCTGATAATGGAAAACCTGTGCCTTTAGATGAAGAGAGTCACAAACGAAAAATGGCAATCAAGCTTCGTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTAGCTGATAATGGAAAACCTGTGCCTTTAGATGAAGAGAGTCACAAACGAAAAATGGCAATCAAGCTTCGTA  148

Query  149  ATGAGTATGGTCCTGTGTTGCATATGCCTACTTCAAAAGAAAATCTTAAAGAGAAGGGTCCTCAGAATGCAACG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGAGTATGGTCCTGTGTTGCATATGCCTACTTCAAAAGAAAATCTTAAAGAGAAGGGTCCTCAGAATGCAACG  222

Query  223  GATTCATATGTTCATAAACAGTACCCTGCCAATCAAGGACAAGAAGTTGAATACTTTGTGGCA-----------  285
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct  223  GATTCATATGTTCATAAACAGTACCCTGCCAATCAAGGACAAGAAGTTGAATACTTTGTGGCAGGTACACATCC  296

Query  286  ----------------GGGGTTGCTTTGACAGCAGATACTAAGATCCAGAGAATGCCAAGTGAATCAGCTGCAC  343
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATACCCACCAGGACCTGGGGTTGCTTTGACAGCAGATACTAAGATCCAGAGAATGCCAAGTGAATCAGCTGCAC  370

Query  344  AGTCCTTAGCGGTGGCATTACCTTTGCAGACCAAGGCTGATGCAAATCGTACTGCCCCTAGTGGAAGTGAATAC  417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTCCTTAGCGGTGGCATTACCTTTGCAGACCAAGGCTGATGCAAATCGTACTGCCCCTAGTGGAAGTGAATAC  444

Query  418  CGACATCCTGGGGCTTCTGACCGTCCACAGCCTACAGCGATGAATTCAATTGTCATGGAGACTGGCAATACCAA  491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGACATCCTGGGGCTTCTGACCGTCCACAGCCTACAGCGATGAATTCAATTGTCATGGAGACTGGCAATACCAA  518

Query  492  GAACTCTGCACTGATGGCTAAAAAAGCCCCTACAATGCCAAAACCCCAGTGGCACCCACCGTGGAAACTCTACA  565
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAACTCTGCACTGATGGCTAAAAAAGCCCCTACAATGCCAAAACCCCAGTGGCACCCACCGTGGAAACTCTACA  592

Query  566  GGGTTATCAGTGGGCATCTTGGCTGGGTTCGATGTATTGCTGTGGAACCTGGAAATCAGTGGTTTGTTACTGGA  639
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGTTATCAGTGGGCATCTTGGCTGGGTTCGATGTATTGCTGTGGAACCTGGAAATCAGTGGTTTGTTACTGGA  666

Query  640  TCTGCTGACAGAACTATAAAGATCTGGGACTTGGCTAGTGGCAAATTAAAACTGTCATTGACTGGGCATATTAG  713
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTGCTGACAGAACTATAAAGATCTGGGACTTGGCTAGTGGCAAATTAAAACTGTCATTGACTGGGCATATTAG  740

Query  714  TACTGTGCGGGGCGTGATAGTAAGCACAAGGAGCCCATATCTGTTCTCTTGTGGAGAAGACAAACAAGTGAAAT  787
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TACTGTGCGGGGCGTGATAGTAAGCACAAGGAGCCCATATCTGTTCTCTTGTGGAGAAGACAAACAAGTGAAAT  814

Query  788  GCTGGGATCTCGAATACAATAAGGTTATACGGCATTATCATGGACATTTAAGTGCAGTGTATGGTTTGGATTTG  861
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCTGGGATCTCGAATACAATAAGGTTATACGGCATTATCATGGACATTTAAGTGCAGTGTATGGTTTGGATTTG  888

Query  862  CACCCGACAATCGATGTGTTGGTAACCTGTAGTCGAGATTCAACTGCACGGATTTGGGATGTGAGAACTAAAGC  935
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACCCGACAATCGATGTGTTGGTAACCTGTAGTCGAGATTCAACTGCACGGATTTGGGATGTGAGAACTAAAGC  962

Query  936  CAGTGTACACACATTATCTGGACATACAAATGCAGTTGCTACAGTGAGATGTCAGGCTGCAGAACCACAGATTA  1009
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  CAGTGTACACACATTATCTGGACATACAAATGCAGTTGCTACAGTGAGATGTCAGGCTGCAGAACCACAAATTA  1036

Query 1010  TTACAGGAAGCCATGATACTACAATTCGATTATGGGATCTGGTGGCTGGAAAAACAAGAGTGACATTAACAAAT  1083
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTACAGGAAGCCATGATACTACAATTCGATTATGGGATCTGGTGGCTGGAAAAACAAGAGTGACATTAACAAAT  1110

Query 1084  CACAAAAAATCAGTTAGGGCTGTGGTTTTACATCCAAGACATTACACATTTGCATCTGGTTCTCCAGATAACAT  1157
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CACAAAAAATCAGTTAGGGCTGTGGTTTTACATCCAAGACATTACACATTTGCATCTGGTTCTCCAGATAACAT  1184

Query 1158  AAAGCAGTGGAAATTCCCTGATGGAAGTTTCATACAAAATCTTTCCGGTCATAATGCTATTATTAACACATTGA  1231
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAAGCAGTGGAAATTCCCTGATGGAAGTTTCATTCAAAATCTTTCCGGTCATAATGCTATTATTAACACATTGA  1258

Query 1232  CGGTAAATTCTGATGGAGTGCTTGTATCTGGAGCTGACAATGGCACCATGCATCTTTGGGACTGGAGAACTGGC  1305
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGGTAAATTCTGATGGAGTGCTTGTATCTGGAGCTGACAATGGCACCATGCATCTTTGGGACTGGAGAACTGGC  1332

Query 1306  TACAATTTTCAGAGAGTTCACGCAGCTGTGCAACCTGGGTCTTTGGACAGTGAATCAGGAATATTTGCTTGTGC  1379
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TACAATTTTCAGAGAGTTCACGCAGCTGTGCAACCTGGGTCTTTGGACAGTGAATCAGGAATATTTGCTTGTGC  1406

Query 1380  TTTTGATCAGTCTGAAAGTCGATTACTAACAGCTGAAGCTGATAAAACCATTAAAGTATACAGAGAGGATGACA  1453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTTTGATCAGTCTGAAAGTCGATTACTAACAGCTGAAGCTGATAAAACCATTAAAGTATACAGAGAGGATGACA  1480

Query 1454  CAGCCACAGAAGAAACTCATCCAGTCAGCTGGAAACCAGAAATTATCAAGAGAAAGAGATTT  1515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAGCCACAGAAGAAACTCATCCAGTCAGCTGGAAACCAGAAATTATCAAGAGAAAGAGATTT  1542