Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_11038
Subject:
NM_001321051.1
Aligned Length:
522
Identities:
456
Gaps:
51

Alignment

Query   1  ATGAAACAATTGCCTGCGGCAACAGTTCGACTCCTTTCAAGTTCTCAGATCATCACTTCGGTGGTCAGTGTTGT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAAACAATTGCCTGCGGCAACAGTTCGACTCCTTTCAAGTTCTCAGATCATCACTTCGGTGGTCAGTGTTGT  74

Query  75  AAAAGAGCTTATTGAAAACTCCTTGGATGCTGGTGCCACAAGCGTAGATGTTAAACTGGAGAACTATGGATTTG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AAAAGAGCTTATTGAAAACTCCTTGGATGCTGGTGCCACAAGCGTAGATGTTAAACTGGAGAACTATGGATTTG  148

Query 149  ATAAAATTGAGGTGCGAGATAACGGGGAGGGTATCAAGGCTGTTGATGCACCTGTAATGGCAATGAAGTACTAC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ATAAAATTGAGGTGCGAGATAACGGGGAGGGTATCAAGGCTGTTGATGCACCTGTAATGGCAATGAAGTACTAC  222

Query 223  ACCTCAAAAATAAATAGTCATGAAGATCTTGAAAATTTGACAACTTACGGTTTTCGTGGAGAAGCCTTGGGGTC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  ACCTCAAAAATAAATAGTCATGAAGATCTTGAAAATTTGACAACTTACGGTTTTCGTGGAGAAGCCTTGGGGTC  296

Query 297  AATTTGTTGTATAGCTGAGGTTTTAATTACAACAAGAACGGCTGCTGATAATTTTAGCACCCAGTATGTTTTAG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AATTTGTTGTATAGCTGAGGTTTTAATTACAACAAGAACGGCTGCTGATAATTTTAGCACCCAGTATGTTTTAG  370

Query 371  ATGGCAGTGGCCACATACTTTCTCAGAAACCTTCACATCTTGGTCAAGG---TAAGAAAGTAGCTTTGTATACA  441
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |.|        ||.|||   ||
Sbjct 371  ATGGCAGTGGCCACATACTTTCTCAGAAACCTTCACATCTTGGTCAAGGGTCTCA--------CTCTGT---CA  433

Query 442  AACATTCTTTACCTTTTC--TGTCTTAATTGTTGGTTTA----AAAAAAAAAAAGTTACTCGG-----------  498
           .|||..||..||   |.|  ||.|.|.| |.||||||.|    ||            .|||.|           
Sbjct 434  CACAGGCTGGAC---TGCAGTGGCATCA-TCTTGGTTCACTGCAA------------CCTCTGCCTCCCAGGCT  491

Query 499  ----  498
               
Sbjct 492  CAAG  495