Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11046
• Subject: NM_001365849.1
• Aligned Length: 758
• Identities: 725
• Gaps: 32

Alignment

Query   1  ---------------MNNPSETSKPSMESGDGNTGTQTNGLDFQKQPVPVGGAISTAQAQAFLGHLHQVQLAGT  59
                          ||.                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MKTRMKIFVMIHFHLMNS-----------------TQTNGLDFQKQPVPVGGAISTAQAQAFLGHLHQVQLAGT  57

Query  60  SLQAAAQSLNVQSKSNEESGDSQQPSQPSQQPSVQAAIPQTQLMLAGGQITGLTLTPAQQQLLLQQAQAQAQLL  133
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  58  SLQAAAQSLNVQSKSNEESGDSQQPSQPSQQPSVQAAIPQTQLMLAGGQITGLTLTPAQQQLLLQQAQAQAQLL  131

Query 134  AAAVQQHSASQQHSAAGATISASAATPMTQIPLSQPIQIAQDLQQLQQLQQQNLNLQQFVLVHPTTNLQPAQFI  207
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 132  AAAVQQHSASQQHSAAGATISASAATPMTQIPLSQPIQIAQDLQQLQQLQQQNLNLQQFVLVHPTTNLQPAQFI  205

Query 208  ISQTPQGQQGLLQAQNLLTQLPQQSQANLLQSQPSITLTSQPATPTRTIAATPIQTLPQSQSTPKRIDTPSLEE  281
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 206  ISQTPQGQQGLLQAQNLLTQLPQQSQANLLQSQPSITLTSQPATPTRTIAATPIQTLPQSQSTPKRIDTPSLEE  279

Query 282  PSDLEELEQFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAEN  355
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 280  PSDLEELEQFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAEN  353

Query 356  LSSDSSLSSPSALNSPGIEGLSRRRKKRTSIETNIRVALEKSFLENQKPTSEEITMIADQLNMEKEVIRVWFCN  429
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 354  LSSDSSLSSPSALNSPGIEGLSRRRKKRTSIETNIRVALEKSFLENQKPTSEEITMIADQLNMEKEVIRVWFCN  427

Query 430  RRQKEKRINPPSSGGTSSSPIKAIFPSPTSLVATTPSLVTSSAATTLTVSPVLPLTSAAVTNLSVTGTSDTTSN  503
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 428  RRQKEKRINPPSSGGTSSSPIKAIFPSPTSLVATTPSLVTSSAATTLTVSPVLPLTSAAVTNLSVTGTSDTTSN  501

Query 504  NTATVISTAPPASSAVTSPSLSPSPSASASTSEASSASETSTTQTTSTPLSSPLGTSQVMVTASGLQTAAAAAL  577
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 502  NTATVISTAPPASSAVTSPSLSPSPSASASTSEASSASETSTTQTTSTPLSSPLGTSQVMVTASGLQTAAAAAL  575

Query 578  QGAAQLPANASLAAMAAAAGLNPSLMAPSQFAAGGALLSLNPGTLSGALSPALMSNSTLATIQALASGGSLPIT  651
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 576  QGAAQLPANASLAAMAAAAGLNPSLMAPSQFAAGGALLSLNPGTLSGALSPALMSNSTLATIQALASGGSLPIT  649

Query 652  SLDATGNLVFANAGGAPNIVTAPLFLNPQNLSLLTSNPVSLVSAAAASAGNSAPVASLHATSTSAESIQNSLFT  725
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 650  SLDATGNLVFANAGGAPNIVTAPLFLNPQNLSLLTSNPVSLVSAAAASAGNSAPVASLHATSTSAESIQNSLFT  723

Query 726  VASASGAASTTTTASKAQ  743
           ||||||||||||||||||
Sbjct 724  VASASGAASTTTTASKAQ  741