Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11047
• Subject: XM_006539659.2
• Aligned Length: 1647
• Identities: 1133
• Gaps: 447

Alignment

Query    1  ATGGTTCACTCCAGCATGGGGGCTCCAGAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCGAGAAGCAAGGTCTGGA  74
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct    1  ATGGTTCATTCCAGCATGGGGGCTCCAGAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCGAGAAGCAAAGTCTGGA  74

Query   75  CTCCCCATCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCAGACACTAATCATCAGAACCCCCAAAATAAGACCT  148
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.||||||||||||||.|||||..|.|
Sbjct   75  CTCCCCGTCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCCGACATTAACCATCAGAACCCCCAGAATAAAGCGT  148

Query  149  CCCCATTCTCCGTGTCCCCAACTGGCCCCAGTACAA--------------------------------------  184
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|                                      
Sbjct  149  CCCCATTCTCTGTGTCCCCAACTGGCCCCAGCACCAAGGTGGGCATTCTCTCTGGCCTCCACTTAACATTCTGG  222

Query  185  ----------------------------AGATCAAGGCTGAAGACCCCAGTGGCGATTCAGCCCCAGCAGCACC  230
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTCCCGGACCCTGCCTCTCTCCTCCCCAGATCAAGGCTGAAGACCCCAGTGGCGATTCAGCCCCAGCAGCACC  296

Query  231  CCTGCCCCCTCAGCCGGCCCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGTTGACGGGCAGCCAGCTAGCTGGGG  304
            ||.||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCGCCCCCCCAGCCGGCTCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGCTGACGGGCAGCCAGCTAGCTGGGG  370

Query  305  ACATACAGCAGCTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTGCCAGGCCACCACCTCCAGCCACCTGCTCAGTTC  378
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACATACAGCAACTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTCCCCGGCCACCACCTCCAGCCACCTGCTCAGTTC  444

Query  379  CTGCTACCGCAGGCCCAGCAGAGCCAGCCAGGCCTGCTACCGACACCAAATCTATTCCAGCTACCTCAGCAAAC  452
            |||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  CTGCTGCCACAGGCACAGCAGAGTCAGCCAGGCCTGCTACCAACGCCAAATCTATTCCAGCTACCTCAACAAAC  518

Query  453  CCAGGGAGCTCTTCTGACCTCCCAGCCCCGGGCCGGGCTTCCCACACAGCCCCCCAAATGCTTGGAGCCACCAT  526
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct  519  CCAGGGAGCTCTCCTGACCTCCCAGCCCCGGGCTGGGCTTCCTACACAGCCCCCGAAATGCTTGGAGCCGCCCT  592

Query  527  CCCACCCCGAGGAGCCCAGTGATCTGGAGGAGCTGGAGCAATTCGCCCGCACCTTCAAGCAACGCCGCATCAAG  600
            |||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCACCCGGAGGAGCCCAGCGATCTGGAGGAGCTGGAACAGTTTGCTCGCACCTTCAAGCAACGCCGCATCAAG  666

Query  601  CTGGGCTTCACGCAGGGTGATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTACGGCAACGACTTCAGCCAGACGACCAT  674
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  CTGGGCTTCACACAGGGTGATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTATGGCAACGACTTCAGCCAAACGACCAT  740

Query  675  TTCCCGCTTCGAGGCCCTCAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGCAAACTCAAGCCCCTCCTGGAGAAGTGGCTCA  748
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTCCCGCTTCGAGGCCCTCAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGTAAACTCAAGCCCCTCCTGGAGAAGTGGCTCA  814

Query  749  ACGATGCAGAGACTATGTCTGTGGACTCAAGCCTGCCCAGCCCCAACCAGCTGAGCAGCCCCAGCCTGGGTTTC  822
            ||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACGACGCAGAGACTATGTCTGTGGATTCAAGCCTACCCAGCCCAAACCAGCTGAGCAGCCCCAGCCTGGGTTTC  888

Query  823  GACGGCCTGCCCGGCCGGAGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACAAACGTCCGCTTCGCCTTAGAGAAGAG  896
            |||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACGGGCTGCCGGGGCGGAGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACGAATGTCCGCTTCGCCTTAGAGAAGAG  962

Query  897  TTTTCTAGCGAACCAGAAGCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCCGAGCAGCTGCACATGGAGAAGGAAG  970
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTTCCTAGCGAACCAGAAGCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCAGAGCAGCTGCACATGGAGAAGGAAG  1036

Query  971  TGATCCGCGTCTGGTTCTGCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAACCCCTGCAGTGCGGCCCCCATGCTG  1044
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGATCCGCGTCTGGTTCTGCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAACCCTTGCAGTGCGGCCCCCATGCTG  1110

Query 1045  CCCAGCCCAGGGAAGCCGGCCAGCTACAGCCCCCATATGGTCACACCCCAAGGGGGCGCGGGGACCTTACCGTT  1118
            ||||||||.||.||||||.|||||||||||||.||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1111  CCCAGCCCGGGAAAGCCGACCAGCTACAGCCCTCACCTGGTCACACCCCAAGGGGGCGCAGGGACCTTACCATT  1184

Query 1119  GTCCCAAGCTTCCAGCAGTCTGAGCA------------------------------------------------  1144
            ||||||||||||.|||||||||||||                                                
Sbjct 1185  GTCCCAAGCTTCTAGCAGTCTGAGCACAACAGTTACTACCTTATCCTCAGCTGTGGGGACGCTCCATCCCAGCC  1258

Query 1145  --------------------------------------------------------------------------  1144
                                                                                      
Sbjct 1259  GGACAGCAGGAGGGGGTGGGGGTGGGGGCGGAGCTGCGCCCCCCCTCAATTCCATCCCCTCTGTCACTCCCCCA  1332

Query 1145  --------------CAACAGCACAAACCCCAGCCCTCAAGGCAGCCACTCGGCTATCGGCTTGTCAGGCC----  1200
                          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||    
Sbjct 1333  CCCCCGGCCACCACCAACAGCACAAACCCGAGCCCTCAAGGCAGCCACTCGGCTATTGGCTTGTCGGGCCTGAA  1406

Query 1201  --------------------------------------------------------------------------  1200
                                                                                      
Sbjct 1407  CCCCAGCGCGGGAAGCACAATGGTGGGGTTGAGCTCTGGGCTGAGTCCAGCCCTCATGAGCAACAACCCTTTGG  1480

Query 1201  --------------------------------------------------------------------------  1200
                                                                                      
Sbjct 1481  CCACTATCCAAGGTGCGTGCTGCCTCATGTCACCCCATTGCCACCAGTCCTGTCCTCTCCTGGGCCTCGAGCCC  1554

Query 1201  --------------------------------------------------------------------------  1200
                                                                                      
Sbjct 1555  ACCCTCCCCCATTGCTGCCCCAGCCATGCCATCCCGCCCCCCTGCTCACTGCATTGCTCGCCTCTTCATCCCCA  1628

Query 1201  -------------------  1200
                               
Sbjct 1629  TCTGTCTTCGGGAAAGGTG  1647