Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11047
- Subject:
- XM_017026893.2
- Aligned Length:
- 1824
- Identities:
- 1200
- Gaps:
- 624
Alignment
Query 1 ATGGTTCACTCCAGCATGGGGGCTCCAGAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCGAGAAGCAAGGTCTGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTTCACTCCAGCATGGGGGCTCCAGAAATAAGAATGTCTAAGCCCCTGGAGGCCGAGAAGCAAGGTCTGGA 74
Query 75 CTCCCCATCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCAGACACTAATCATCAGAACCCCCAAAATAAGACCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTCCCCATCAGAGCACACAGACACCGAAAGAAATGGACCAGACACTAATCATCAGAACCCCCAAAATAAGACCT 148
Query 149 CCCCATTCTCCGTGTCCCCAACTGGCCCCAGTACAA-------------------------------------- 184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCCCATTCTCCGTGTCCCCAACTGGCCCCAGTACAAAGGTGGGCATTCTCTCTGGCCTCCACTTAACATTCTGG 222
Query 185 ----------------------------AGATCAAGGCTGAAGACCCCAGTGGCGATTCAGCCCCAGCAGCACC 230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGTCCCGGACCCTGCCTCTCTCCCCCCCAGATCAAGGCTGAAGACCCCAGTGGCGATTCAGCCCCAGCAGCACC 296
Query 231 CCTGCCCCCTCAGCCGGCCCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGTTGACGGGCAGCCAGCTAGCTGGGG 304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCTGCCCCCTCAGCCGGCCCAGCCTCATCTGCCCCAGGCCCAACTCATGTTGACGGGCAGCCAGCTAGCTGGGG 370
Query 305 ACATACAGCAGCTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTGCCAGGCCACCACCTCCAGCCACCTGCTCAGTTC 378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACATACAGCAGCTCCTCCAGCTCCAGCAGCTGGTGCTTGTGCCAGGCCACCACCTCCAGCCACCTGCTCAGTTC 444
Query 379 CTGCTACCGCAGGCCCAGCAGAGCCAGCCAGGCCTGCTACCGACACCAAATCTATTCCAGCTACCTCAGCAAAC 452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGCTACCGCAGGCCCAGCAGAGCCAGCCAGGCCTGCTACCGACACCAAATCTATTCCAGCTACCTCAGCAAAC 518
Query 453 CCAGGGAGCTCTTCTGACCTCCCAGCCCCGGGCCGGGCTTCCCACACAGCCCCCCAAATGCTTGGAGCCACCAT 526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCAGGGAGCTCTTCTGACCTCCCAGCCCCGGGCCGGGCTTCCCACACAGCCCCCCAAATGCTTGGAGCCACCAT 592
Query 527 CCCACCCCGAGGAGCCCAGTGATCTGGAGGAGCTGGAGCAATTCGCCCGCACCTTCAAGCAACGCCGCATCAAG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCCACCCCGAGGAGCCCAGTGATCTGGAGGAGCTGGAGCAATTCGCCCGCACCTTCAAGCAACGCCGCATCAAG 666
Query 601 CTGGGCTTCACGCAGGGTGATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTACGGCAACGACTTCAGCCAGACGACCAT 674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTGGGCTTCACGCAGGGTGATGTGGGCCTGGCCATGGGCAAGCTCTACGGCAACGACTTCAGCCAGACGACCAT 740
Query 675 TTCCCGCTTCGAGGCCCTCAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGCAAACTCAAGCCCCTCCTGGAGAAGTGGCTCA 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTCCCGCTTCGAGGCCCTCAACCTGAGCTTCAAGAACATGTGCAAACTCAAGCCCCTCCTGGAGAAGTGGCTCA 814
Query 749 ACGATGCAGAGACTATGTCTGTGGACTCAAGCCTGCCCAGCCCCAACCAGCTGAGCAGCCCCAGCCTGGGTTTC 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACGATGCAGAGACTATGTCTGTGGACTCAAGCCTGCCCAGCCCCAACCAGCTGAGCAGCCCCAGCCTGGGTTTC 888
Query 823 GACGGCCTGCCCGGCCGGAGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACAAACGTCCGCTTCGCCTTAGAGAAGAG 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GACGGCCTGCCCGGCCGGAGACGCAAGAAGAGGACCAGCATCGAGACAAACGTCCGCTTCGCCTTAGAGAAGAG 962
Query 897 TTTTCTAGCGAACCAGAAGCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCCGAGCAGCTGCACATGGAGAAGGAAG 970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TTTTCTAGCGAACCAGAAGCCTACCTCAGAGGAGATCCTGCTGATCGCCGAGCAGCTGCACATGGAGAAGGAAG 1036
Query 971 TGATCCGCGTCTGGTTCTGCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAACCCCTGCAGTGCGGCCCCCATGCTG 1044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGATCCGCGTCTGGTTCTGCAACCGGCGCCAGAAGGAGAAACGCATCAACCCCTGCAGTGCGGCCCCCATGCTG 1110
Query 1045 CCCAGCCCAGGGAAGCCGGCCAGCTACAGCCCCCATATGGTCACACCCCAAGGGGGCGCGGGGACCTTACCGTT 1118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCCAGCCCAGGGAAGCCGGCCAGCTACAGCCCCCATATGGTCACACCCCAAGGGGGCGCGGGGACCTTACCGTT 1184
Query 1119 GTCCCAAGCTTCCAGCAGTCTGAGCA------------------------------------------------ 1144
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GTCCCAAGCTTCCAGCAGTCTGAGCACAACAGTTACTACCTTATCCTCAGCTGTGGGGACGCTCCACCCCAGCC 1258
Query 1145 -------------------------------------------------------------------------- 1144
Sbjct 1259 GGACAGCTGGAGGGGGTGGGGGCGGGGGCGGGGCTGCGCCCCCCCTCAATTCCATCCCCTCTGTCACTCCCCCA 1332
Query 1145 --------------CAACAGCACAAACCCCAGCCCTCAAGGCAGCCACTCGGCTATCGGCTTGTCAGGCC---- 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCCCCGGCCACCACCAACAGCACAAACCCCAGCCCTCAAGGCAGCCACTCGGCTATCGGCTTGTCAGGCCTGAA 1406
Query 1201 -------------------------------------------------------------------------- 1200
Sbjct 1407 CCCCAGCACGGGAAGCACAATGGTGGGGTTGAGCTCCGGGCTGAGTCCAGCCCTCATGAGCAACAACCCTTTGG 1480
Query 1201 -------------------------------------------------------------------------- 1200
Sbjct 1481 CCACTATCCAAGCCCTGGCCTCTGGTGGAACCCTGCCCCTTACCAGCCTTGATGGCAGCGGGAATCTGGTGCTG 1554
Query 1201 -------------------------------------------------------------------------- 1200
Sbjct 1555 GGGGCAGCCGGTGCAGCCCCGGGGAGCCCTGGCCTGGTGACCTCGCCGCTCTTCTTGAATCATGCTGGGCTGCC 1628
Query 1201 -------------------------------------------------------------------------- 1200
Sbjct 1629 CCTGCTCAGCACCCCGCCTGGTGTGGGCCTGGTCTCAGCAGCGGCTGCGGCTGTGGCAGCCTCCATCTCCAGCA 1702
Query 1201 -------------------------------------------------------------------------- 1200
Sbjct 1703 AGTCTCCTGGCCTCTCCTCCTCATCCTCTTCATCCTCATCCTCCTCCTCCTCCACTTGCAGCGAGACGGCAGCA 1776
Query 1201 ------------------------------------------------ 1200
Sbjct 1777 CAGACCCCTGGAGGTCCAGGGGGGCCCGAGGCAGGGTCCAAACCTGAG 1824
