Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11054
• Subject: NM_001321989.2
• Aligned Length: 1212
• Identities: 1062
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ATGAGCCACATCCAGATCCCGCCGGGGCTCACGGAGCTGCTGCAGGGCTACACGGTGGAGGTGCTGCGACAGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCCACATCCAGATCCCGCCGGGGCTCACGGAGCTGCTGCAGGGCTACACGGTGGAGGTGCTGCGACAGCA  74

Query   75  GCCGCCTGACCTCGTCGAATTCGCAGTGGAGTACTTCACCCGCCTGCGCGAGGCCCGCGCCCCAGCCTCAGTCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCGCCTGACCTCGTCGAATTCGCAGTGGAGTACTTCACCCGCCTGCGCGAGGCCCGCGCCCCAGCCTCAGTCC  148

Query  149  TGCCCGCCGCCACCCCACGCCAGAGCCTGGGCCACCCCCCGCCAGAACCCGGCCCGGACCGTGTCGCCGACGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCCCGCCGCCACCCCACGCCAGAGCCTGGGCCACCCCCCGCCAGAACCCGGCCCGGACCGTGTCGCCGACGCC  222

Query  223  AAAGGGGACAGCGAGTCGGAGGAGGACGAGGACTTGGAAGTTCCAGTTCCTAGCAGATTTAATAGACGAGTATC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGGGGACAGCGAGTCGGAGGAGGACGAGGACTTGGAAGTTCCAGTTCCTAGCAGATTTAATAGACGAGTATC  296

Query  297  AGTCTGTGCTGAGACCTATAACCCTGATGAGGAAGAGGAAGATACAGATCCAAGGGTGATTCATCCTAAAACTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct  297  AGTCTGTGCTGAGACCTATAACCCTGATGAGGAAGAGGAAGATACAGATCCAAG--------------------  350

Query  371  ATGAACAGAGATGCAGACTTCAGGAAGCTTGCAAAGATATTCTCCTTTTCAAAAATCTTGATCAGGAACAGCTT  444
                                                                            ||||||||||
Sbjct  351  ----------------------------------------------------------------GGAACAGCTT  360

Query  445  TCTCAAGTTCTCGATGCCATGTTTGAAAGGATAGTCAAAGCTGATGAGCATGTCATTGACCAAGGAGATGATGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TCTCAAGTTCTCGATGCCATGTTTGAAAGGATAGTCAAAGCTGATGAGCATGTCATTGACCAAGGAGATGATGG  434

Query  519  AGACAACTTTTATGTCATAGAACGGGGAACTTATGACATTTTAGTAACAAAAGATAATCAAACCCGCTCTGTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  435  AGACAACTTTTATGTCATAGAACGGGGAACTTATGACATTTTAGTAACAAAAGATAATCAAACCCGCTCTGTTG  508

Query  593  GTCAATATGACAACCGTGGCAGTTTTGGAGAACTAGCTCTGATGTACAACACCCCGAGAGCTGCTACCATTGTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  509  GTCAATATGACAACCGTGGCAGTTTTGGAGAACTAGCTCTGATGTACAACACCCCGAGAGCTGCTACCATTGTT  582

Query  667  GCTACCTCAGAAGGCTCCCTTTGGGGACTGGACCGGGTGACTTTTAGAAGAATCATAGTGAAAAATAATGCAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  583  GCTACCTCAGAAGGCTCCCTTTGGGGACTGGACCGGGTGACTTTTAGAAGAATCATAGTGAAAAATAATGCAAA  656

Query  741  GAAGAGGAAGATGTTTGAATCATTTATTGAGTCTGTGCCCCTCCTTAAATCACTAGAGGTGTCAGAACGAATGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657  GAAGAGGAAGATGTTTGAATCATTTATTGAGTCTGTGCCCCTCCTTAAATCACTAGAGGTGTCAGAACGAATGA  730

Query  815  AGATTGTGGATGTAATAGGAGAGAAGATCTATAAGGATGGAGAACGCATAATCACTCA----------------  872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct  731  AGATTGTGGATGTAATAGGAGAGAAGATCTATAAGGATGGAGAACGCATAATCACTCAGGGTGAAAAGGCTGAT  804

Query  873  --------------------------------------------------GACTAAATCAAACAAGGATGGTGG  896
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  AGCTTTTACATCATAGAGTCTGGCGAAGTGAGCATCTTGATTAGAAGCAGGACTAAATCAAACAAGGATGGTGG  878

Query  897  GAACCAGGAGGTCGAGATTGCCCGCTGCCATAAGGGGCAGTACTTTGGAGAGCTTGCCCTGGTCACCAACAAAC  970
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  879  GAACCAGGAGGTCGAGATTGCCCGCTGCCATAAGGGGCAGTACTTTGGAGAGCTTGCCCTGGTCACCAACAAAC  952

Query  971  CCAGAGCTGCCTCAGCTTATGCAGTTGGAGATGTCAAATGCTTAGTTATGGATGTACAAGCATTCGAGAGGCTT  1044
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  CCAGAGCTGCCTCAGCTTATGCAGTTGGAGATGTCAAATGCTTAGTTATGGATGTACAAGCATTCGAGAGGCTT  1026

Query 1045  CTGGGGCCCTGCATGGACATCATGAAGAGGAACATCTCACACTATGAGGAACAGCTGGTGAAGATGTTTGGCTC  1118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027  CTGGGGCCCTGCATGGACATCATGAAGAGGAACATCTCACACTATGAGGAACAGCTGGTGAAGATGTTTGGCTC  1100

Query 1119  CAGCGTGGATCTGGGCAACCTCGGGCAG  1146
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  CAGCGTGGATCTGGGCAACCTCGGGCAG  1128