Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11062
- Subject:
- NM_001303414.1
- Aligned Length:
- 783
- Identities:
- 681
- Gaps:
- 42
Alignment
Query 1 ATGAATCCATTCCTGATCCTTGCCTTTGTGGGAGCTGCTGTTGCTGTCCCCTTTGACGATGATGACAAGATTGT 74
|||||||.|.|.|||||||||.|||||||.|.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1 ATGAATCTACTTCTGATCCTTACCTTTGTTGCAGCTGCTGTTGCTGCCCCCTTTGATGATGATGACAAGATCGT 74
Query 75 TGGGGGCTACACCTGTGAGGAGAATTCTCTCCCCTACCAGGTGTCCCTGAATTCTGGCTCCCACTTCTGCGGTG 148
|||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 75 TGGGGGCTACATCTGTGAGGAGAATTCTGTCCCCTACCAGGTGTCCTTGAATTCTGGCTACCACTTCTGCGGTG 148
Query 149 GCTCCCTCATCAGCGAACAGTGGGTGGTATCAGCAGCTCACTGCTACAAGAC---------------------- 200
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||.|
Sbjct 149 GCTCCCTCATCAGCGAACAGTGGGTGGTGTCAGCAGGTCACTGCTACAAGTCGGCAATTAACTCAAAATTATCA 222
Query 201 --------------------CCGCATCCAGGTGAGACTGGGAGAGCACAACATCAAAGTCCTGGAGGGGAATGA 254
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGAAGAGGGTGTGAATATCACCGCATCCAGGTGAGACTGGGAGAGCACAACATCGAAGTCCTGGAGGGGAATGA 296
Query 255 GCAGTTCATCAATGCAGCCAAGATCATCCGCCACCCCCAATACGACAGGAAGACTCTGAACAATGACATCATGT 328
.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||.||||...|||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 297 ACAGTTCATCAATGCGGCCAAGATCATCCGCCACCCCAAATACAACAGCCGGACTCTGGACAATGACATCCTGC 370
Query 329 TAATCAAGCTCTCCTCACGTGCAGTAATCAACGCCCGCGTGTCCACCATCTCTCTGCCCACCGCCCCTCCAGCC 402
|.||||||||||||||||.|||.||.|||||..|||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 371 TGATCAAGCTCTCCTCACCTGCCGTCATCAATTCCCGCGTGTCCGCCATCTCTCTGCCCACTGCCCCTCCAGCT 444
Query 403 ACTGGCACGAAGTGCCTCATCTCTGGCTGGGGCAACACTGCGAGCTCTGGCGCCGACTACCCAGACGAGCTGCA 476
.|||||||..|||.|||||||||.|||||||||||||||..|||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCTGGCACCGAGTCCCTCATCTCCGGCTGGGGCAACACTCTGAGTTCTGGTGCCGACTACCCAGACGAGCTGCA 518
Query 477 GTGCCTGGACGCTCCTGTGCTGAGCCAGGCTAAGTGTGAAGCCTCCTACCCTGGAAAGATTACCAGCAACATGT 550
|||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 519 GTGCCTGGATGCTCCTGTGCTGAGCCAGGCTGAGTGTGAAGCCTCCTACCCTGGAAAGATTACCAACAACATGT 592
Query 551 TCTGTGTGGGCTTCCTTGAGGGAGGCAAGGATTCATGTCAGGGTGATTCTGGTGGCCCTGTGGTCTGCAATGGA 624
||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 593 TCTGTGTGGGCTTCCTCGAGGGAGGCAAGGATTCCTGCCAGGGTGATTCTGGTGGCCCTGTGGTCTCCAATGGA 666
Query 625 CAGCTCCAAGGAGTTGTCTCCTGGGGTGATGGCTGTGCCCAGAAGAACAAGCCTGGAGTCTACACCAAGGTCTA 698
.|||||||||||.|||||||||||||..|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGCTCCAAGGAATTGTCTCCTGGGGCTATGGCTGTGCCCAGAAGAACAGGCCTGGAGTCTACACCAAGGTCTA 740
Query 699 CAACTATGTGAAATGGATTAAGAACACCATAGCTGCCAACAGC 741
||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAACTATGTGGACTGGATTAAGGACACCATAGCTGCCAACAGC 783